More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2433 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  100 
 
 
348 aa  699    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  56.03 
 
 
353 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5910  Methyltransferase type 12  54.89 
 
 
353 aa  388  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.512688 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2845  methyltransferase type 11  56.77 
 
 
348 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.292154 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2765  methyltransferase type 12  55.91 
 
 
348 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.306767  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  57.06 
 
 
348 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2927  hypothetical protein  55.91 
 
 
348 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580788  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2079  hypothetical protein  52.74 
 
 
348 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0990  methyltransferase type 12  54 
 
 
351 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  55.43 
 
 
351 aa  377  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1034  Methyltransferase type 12  53.71 
 
 
360 aa  367  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2993  methyltransferase type 12  50.57 
 
 
351 aa  355  5e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0623  methyltransferase type 12  53.3 
 
 
357 aa  355  5e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3092  Methyltransferase type 12  50.43 
 
 
351 aa  354  1e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.684965  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3193  Methyltransferase type 12  50.43 
 
 
351 aa  354  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0507607  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5022  methyltransferase type 11  50.43 
 
 
353 aa  354  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.371366  normal  0.128681 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4241  Methyltransferase type 12  52 
 
 
360 aa  353  2e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0596  Methyltransferase type 12  55.01 
 
 
357 aa  352  5e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.579149 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1600  methyltransferase type 12  53.01 
 
 
359 aa  351  1e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1828  Methyltransferase type 11  53.3 
 
 
351 aa  345  6e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225649  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1551  methyltransferase type 12  51.43 
 
 
350 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2696  Methyltransferase type 12  49 
 
 
358 aa  335  5e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.362393 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1171  hypothetical protein  46.57 
 
 
351 aa  334  1e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544586  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1706  methyltransferase type 12  48.29 
 
 
353 aa  325  7e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266061  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3870  methyltransferase type 12  47.71 
 
 
357 aa  320  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6246  Methyltransferase type 12  46.67 
 
 
349 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106567  normal  0.283014 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2188  Methyltransferase type 12  44.71 
 
 
343 aa  266  4e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1632  hypothetical protein  35.8 
 
 
357 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18860  hypothetical protein  35.51 
 
 
357 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478854  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1290  Methyltransferase type 12  37.07 
 
 
341 aa  175  9e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.830154  normal  0.108647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  34.51 
 
 
355 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  35.95 
 
 
363 aa  164  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0550  Methyltransferase type 11  35.01 
 
 
356 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3711  methyltransferase type 12  32.14 
 
 
360 aa  151  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  32.63 
 
 
365 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12286  transcriptional regulator  30.92 
 
 
353 aa  142  6e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2608  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
380 aa  142  8e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476854  hitchhiker  0.00248794 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  31.32 
 
 
355 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  31.32 
 
 
355 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  31.32 
 
 
355 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  30.79 
 
 
360 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  28.49 
 
 
356 aa  138  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  28.49 
 
 
356 aa  138  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2574  Methyltransferase type 11  30.68 
 
 
363 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6570  methyltransferase type 12  30.77 
 
 
416 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2044  methyltransferase type 12  32.4 
 
 
369 aa  129  8.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  25.93 
 
 
344 aa  129  9.000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1793  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 
360 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2836  methyltransferase type 11  32.31 
 
 
362 aa  126  6e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251768  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  29.11 
 
 
376 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3928  methyltransferase type 11  29.67 
 
 
363 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.959556 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5751  Methyltransferase type 11  30.14 
 
 
356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.171597 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  29.73 
 
 
360 aa  119  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  31.53 
 
 
367 aa  116  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1328  Methyltransferase type 12  28.25 
 
 
365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.352621 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  29.67 
 
 
366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43981  predicted protein  29.47 
 
 
418 aa  113  5e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.321285  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1508  Methyltransferase type 11  36.51 
 
 
226 aa  76.3  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  39.13 
 
 
274 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4414  methyltransferase type 12  29.84 
 
 
356 aa  66.2  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  35.38 
 
 
287 aa  64.7  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
286 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2188  hypothetical protein  27.69 
 
 
411 aa  63.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636735  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  35.07 
 
 
314 aa  62.8  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2050  O-methyltransferase family 2  27.97 
 
 
377 aa  62.4  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141136 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4888  methyltransferase type 12  29.73 
 
 
351 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.687449 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5675  Methyltransferase type 12  27.06 
 
 
340 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.196275  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  34.17 
 
 
285 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  37.04 
 
 
276 aa  60.1  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2180  methyltransferase type 12  33.59 
 
 
205 aa  60.5  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  34.07 
 
 
285 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  34.07 
 
 
285 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2184  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  28.68 
 
 
363 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2230  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  28.68 
 
 
363 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392557  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2173  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  28.68 
 
 
363 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190617 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4232  methyltransferase type 11  31.78 
 
 
234 aa  59.3  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5718  O-methyltransferase family 2  26.57 
 
 
338 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1748  hypothetical protein  34.23 
 
 
247 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.245631 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  37.61 
 
 
282 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  29.89 
 
 
293 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  30.28 
 
 
213 aa  57.4  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1929  Methyltransferase type 11  43.06 
 
 
228 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000245244  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2551  Methyltransferase type 11  41.75 
 
 
248 aa  55.8  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.2 
 
 
280 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0046  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.01 
 
 
447 aa  55.8  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.404725  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
261 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0232  O-methyltransferase family protein  27.82 
 
 
338 aa  55.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0381  methyltransferase type 11  31.78 
 
 
213 aa  55.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.116579 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  28.29 
 
 
283 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2164  Methyltransferase type 11  25.86 
 
 
346 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337135  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  28.95 
 
 
283 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  30 
 
 
281 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  30 
 
 
267 aa  55.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  33.66 
 
 
414 aa  54.3  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5352  methyltransferase type 11  30.43 
 
 
268 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.1 
 
 
230 aa  53.9  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  30.14 
 
 
284 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2106  Methyltransferase type 12  35.66 
 
 
352 aa  53.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139734  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 
283 aa  53.5  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  30.91 
 
 
270 aa  53.1  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>