More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2281 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  100 
 
 
90 aa  172  2e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  92.41 
 
 
95 aa  143  7e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  83.72 
 
 
92 aa  139  1e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  78.41 
 
 
88 aa  133  7e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  78.41 
 
 
88 aa  133  9e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  75.28 
 
 
89 aa  125  2e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  79.22 
 
 
151 aa  124  5e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  74.42 
 
 
86 aa  120  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  75.9 
 
 
86 aa  115  2e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  69.88 
 
 
88 aa  115  2e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3262  ribosomal protein S20  75.58 
 
 
90 aa  115  2e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521997  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  73.17 
 
 
86 aa  115  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  70.93 
 
 
86 aa  109  1e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  68.6 
 
 
86 aa  108  2e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  71.08 
 
 
88 aa  108  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  66.29 
 
 
107 aa  108  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  66.29 
 
 
89 aa  107  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  70 
 
 
86 aa  103  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  70 
 
 
86 aa  103  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  70 
 
 
86 aa  103  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12640  SSU ribosomal protein S20P  72.09 
 
 
86 aa  103  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.464272  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  63.75 
 
 
86 aa  102  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1556  30S ribosomal protein S20  69.88 
 
 
86 aa  100  5e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  69.14 
 
 
86 aa  100  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  67.44 
 
 
86 aa  100  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  69.62 
 
 
162 aa  100  7e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  1.27538e-06  unclonable  1.13677e-09 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  62.35 
 
 
88 aa  99.8  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  67.9 
 
 
86 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2207  ribosomal protein S20  68.6 
 
 
86 aa  97.1  8e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.437419  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2223  ribosomal protein S20  67.47 
 
 
86 aa  93.6  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133967  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1614  ribosomal protein S20  65.91 
 
 
88 aa  94  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  61.45 
 
 
86 aa  92.4  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  60.24 
 
 
86 aa  89.4  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53249e-08 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3421  ribosomal protein S20  66.67 
 
 
86 aa  88.6  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144385  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2242  30S ribosomal protein S20  62.65 
 
 
86 aa  87  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.636504  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07740  ribosomal protein S20  67.09 
 
 
172 aa  87  7e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.603346 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1654  ribosomal protein S20  67.09 
 
 
167 aa  86.7  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.158748  hitchhiker  0.00316633 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  56.98 
 
 
86 aa  85.5  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12430  SSU ribosomal protein S20P  65.12 
 
 
88 aa  84.7  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0372924  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  58.33 
 
 
87 aa  84  6e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0854  ribosomal protein S20  61.25 
 
 
86 aa  79  2e-14  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  53.01 
 
 
87 aa  78.6  3e-14  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  53.01 
 
 
87 aa  78.6  3e-14  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0583  30S ribosomal protein S20  62.5 
 
 
86 aa  77.4  6e-14  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  50.63 
 
 
105 aa  73.9  6e-13  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  54.43 
 
 
89 aa  73.6  8e-13  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  49.4 
 
 
95 aa  70.5  7e-12  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  52.44 
 
 
94 aa  69.3  2e-11  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  1.7573e-05 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  43.48 
 
 
89 aa  68.6  3e-11  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  44.32 
 
 
88 aa  67.4  6e-11  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1576  ribosomal protein S20  50.67 
 
 
89 aa  66.2  1e-10  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 
89 aa  65.9  2e-10  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.40091e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  46.91 
 
 
88 aa  65.1  3e-10  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 
96 aa  64.7  4e-10  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  3.00859e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  50.65 
 
 
88 aa  64.3  6e-10  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  43.18 
 
 
88 aa  63.5  9e-10  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  5.91631e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  47.95 
 
 
87 aa  62.8  1e-09  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0527  ribosomal protein S20  44.32 
 
 
88 aa  63.2  1e-09  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  42.17 
 
 
87 aa  62.4  2e-09  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  42.68 
 
 
88 aa  61.2  4e-09  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  47.56 
 
 
85 aa  61.2  5e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  1.76977e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2817  30S ribosomal protein S20  50 
 
 
91 aa  60.5  7e-09  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 
96 aa  60.5  7e-09  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  5.67629e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2909  30S ribosomal protein S20  50 
 
 
91 aa  60.5  7e-09  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 
85 aa  60.1  9e-09  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  40.96 
 
 
86 aa  59.7  1e-08  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1511  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 
85 aa  59.7  1e-08  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 
85 aa  59.7  1e-08  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2717  30S ribosomal protein S20  53.95 
 
 
90 aa  59.3  2e-08  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.469442  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4315  30S ribosomal protein S20  42.68 
 
 
90 aa  59.3  2e-08  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.59944e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  43.84 
 
 
87 aa  58.5  3e-08  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  5.8734e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  46.58 
 
 
87 aa  58.5  3e-08  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.04078e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1587  30S ribosomal protein S20  40.45 
 
 
88 aa  58.5  3e-08  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  42.53 
 
 
84 aa  58.2  4e-08  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  1.67926e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  40.96 
 
 
85 aa  57.8  5e-08  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  5.91712e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2725  30S ribosomal protein S20  47.37 
 
 
92 aa  57.8  5e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0313698  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  40.96 
 
 
85 aa  57.8  5e-08  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  40.96 
 
 
85 aa  57.8  5e-08  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  40.96 
 
 
85 aa  57.8  5e-08  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.15322e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  40.96 
 
 
85 aa  57.8  5e-08  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  40.96 
 
 
85 aa  57.8  5e-08  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  40.96 
 
 
85 aa  57.8  5e-08  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  40.96 
 
 
85 aa  57.8  5e-08  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.53456e-13 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0950  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 
77 aa  57.4  6e-08  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0608659  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0225  30S ribosomal protein S20  39.33 
 
 
87 aa  57.8  6e-08  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  4.77404e-11  normal  0.0381808 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  49.35 
 
 
90 aa  57.4  6e-08  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  1.26326e-09  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3551  30S ribosomal protein S20  42.7 
 
 
89 aa  57.4  7e-08  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  44.16 
 
 
94 aa  57.4  7e-08  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.34662e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1013  30S ribosomal protein S20  39.77 
 
 
88 aa  57  9e-08  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  7.73203e-15  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1902  30S ribosomal protein S20  43.37 
 
 
77 aa  56.2  1e-07  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000191113  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0850  30S ribosomal protein S20  45.78 
 
 
78 aa  56.6  1e-07  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  1.16553e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2689  30S ribosomal protein S20  40.91 
 
 
88 aa  56.6  1e-07  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2561  30S ribosomal protein S20  40.91 
 
 
88 aa  56.6  1e-07  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf244  ribosomal protein S20  45.45 
 
 
87 aa  56.2  1e-07  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026073  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  39.76 
 
 
85 aa  56.6  1e-07  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  1.17943e-11 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1172  30S ribosomal protein S20  46.34 
 
 
88 aa  56.2  1e-07  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  5.75412e-05  hitchhiker  4.02538e-09 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1416  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 
87 aa  55.5  2e-07  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.71927e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0847  30S ribosomal protein S20  43.21 
 
 
97 aa  55.5  3e-07  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0745  30S ribosomal protein S20  41.57 
 
 
90 aa  54.7  4e-07  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.426088 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0238  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 
85 aa  54.7  4e-07  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00017388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>