221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1577 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1577  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
272 aa  536  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  46.3 
 
 
252 aa  189  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.231237 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3260  beta-lactamase domain-containing protein  42.41 
 
 
275 aa  187  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3034  beta-lactamase domain-containing protein  42.41 
 
 
275 aa  177  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.641137 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1902  beta-lactamase domain-containing protein  39.34 
 
 
287 aa  152  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7059  beta-lactamase domain protein  36.13 
 
 
295 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
271 aa  139  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1653  beta-lactamase domain-containing protein  40.43 
 
 
238 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.139658  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2893  beta-lactamase domain protein  30.86 
 
 
271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11942  hypothetical protein  36.55 
 
 
250 aa  104  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  34.04 
 
 
317 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  27.31 
 
 
302 aa  97.8  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  29.23 
 
 
298 aa  92.4  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  29.17 
 
 
299 aa  92  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  32.93 
 
 
342 aa  91.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  34.11 
 
 
264 aa  90.5  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  34.77 
 
 
312 aa  90.1  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  33.33 
 
 
314 aa  88.2  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  34.01 
 
 
287 aa  88.2  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  32.16 
 
 
319 aa  87.8  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  34.34 
 
 
332 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  34.2 
 
 
323 aa  86.7  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  34.39 
 
 
315 aa  85.9  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  32.99 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  30.34 
 
 
319 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  31.47 
 
 
318 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  34.39 
 
 
637 aa  83.2  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3131  beta-lactamase domain-containing protein  32.19 
 
 
230 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.833456  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  30.77 
 
 
319 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  25.13 
 
 
308 aa  82.4  0.000000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3402  beta-lactamase domain-containing protein  33.77 
 
 
243 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433473  normal  0.430357 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  27.72 
 
 
316 aa  81.6  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  28.78 
 
 
316 aa  81.6  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  30.94 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  30.24 
 
 
319 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  30.46 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  30.46 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  27.6 
 
 
319 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  28.39 
 
 
312 aa  80.5  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  28.93 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  33.33 
 
 
644 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  30.46 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  30.46 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  30.46 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  30.46 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  30.46 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  27.46 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  30.04 
 
 
317 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  29.54 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  27.16 
 
 
318 aa  80.1  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  29.5 
 
 
321 aa  80.1  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  34.98 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  30.29 
 
 
319 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  30.35 
 
 
335 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  30.35 
 
 
335 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  30.04 
 
 
316 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  27.71 
 
 
319 aa  79.3  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  31.47 
 
 
321 aa  79  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  31.79 
 
 
312 aa  78.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 
304 aa  78.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  28.37 
 
 
321 aa  78.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  34.34 
 
 
318 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  29.03 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  35.35 
 
 
318 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  29.44 
 
 
352 aa  77.8  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  30.29 
 
 
319 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  30.29 
 
 
319 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  35.35 
 
 
318 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  30.77 
 
 
319 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  33.19 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  29.84 
 
 
307 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1033  beta-lactamase domain protein  30.33 
 
 
333 aa  75.9  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  27.88 
 
 
336 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  27.23 
 
 
316 aa  75.1  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  28.85 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  28.85 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  29.44 
 
 
307 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  27.6 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  27.17 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  27.23 
 
 
332 aa  74.3  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  30.54 
 
 
305 aa  73.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  26.7 
 
 
339 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  28.28 
 
 
317 aa  73.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  26.78 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  26.24 
 
 
339 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1677  metallo-beta-lactamase family protein  24.28 
 
 
299 aa  72.4  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  29.03 
 
 
309 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  31.84 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  29.58 
 
 
351 aa  70.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1866  beta-lactamase domain protein  30.85 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.914687  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  34.03 
 
 
327 aa  70.5  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  29.67 
 
 
315 aa  70.1  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2612  beta-lactamase domain protein  35.32 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584413  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  25.87 
 
 
318 aa  69.7  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  30.08 
 
 
310 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  33.85 
 
 
315 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  30.08 
 
 
310 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  28.77 
 
 
329 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  27.73 
 
 
349 aa  67  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  30.77 
 
 
310 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>