109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0865 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0865  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  356  9e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2808  PadR-like family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 180 aa  122  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5461  PadR-like family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 183 aa  84  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5238  PadR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  37.21 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4870  PadR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4959  PadR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1493  PadR family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 204 aa  74.3  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1331  PadR-like family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  35.54 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  31.95 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1923  transcriptional regulator, PadR-like family  33.01 
 
 		 184 aa  64.3  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.870316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0079  PadR-like family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1267  transcriptional regulator, PadR-like family  25.54 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2628  transcriptional regulator, PadR-like family  21.43 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4476  PadR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1257  transcriptional regulator  29.88 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.287326 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1942  transcriptional regulator, PadR-like family  29.94 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.649518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1892  PadR-like family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.481903  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5568  transcriptional regulator, PadR-like family  31.14 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.630063  normal  0.41654 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2248  PadR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0137325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1322  PadR-like family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.704884 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4576  PadR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1669  PadR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.107785  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1645  transcriptional regulator  37.11 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0862  PadR-like family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1343  PadR-like family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1946  transcriptional regulator, PadR family  37.11 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1910  PadR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4271  PadR-like family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0469605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0779  transcriptional regulator, PadR-like family  21.76 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.125594  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00046  transcriptional regulator  33.75 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002309  predicted transcriptional regulator  33.75 
 
 		 179 aa  52.4  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  27.03 
 
 		 179 aa  52  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  32.93 
 
 		 325 aa  52  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 187 aa  51.2  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  39.47 
 
 		 252 aa  51.2  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5591  PadR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 196 aa  51.2  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4863  transcriptional regulator, PadR-like family  39.24 
 
 		 186 aa  50.8  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.149571  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  31.4 
 
 		 179 aa  51.2  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1272  transcriptional regulator  35.8 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546135  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1600  PadR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3512  transcriptional repressor PadR  29.3 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  35.37 
 
 		 174 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05461  hypothetical protein  25.19 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.144264 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0095  PadR-like family regulatory protein  35.8 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1517  PadR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.178756  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  35.8 
 
 		 174 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  40.79 
 
 		 180 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4818  transcriptional regulator, PadR-like family  25.19 
 
 		 179 aa  48.5  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2496  transcriptional regulator, PadR-like family  29.01 
 
 		 177 aa  48.5  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0617263  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3741  transcriptional regulator, PadR-like family  25.19 
 
 		 179 aa  48.5  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26090  predicted transcriptional regulator  26.26 
 
 		 194 aa  48.5  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4824  transcriptional regulator, PadR-like family  34.57 
 
 		 184 aa  48.1  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1578  PadR-like family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 185 aa  48.5  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59882  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0346  transcriptional regulator, PadR-like family  28.06 
 
 		 201 aa  47.8  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  0.03301 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 179 aa  47.8  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11201  hypothetical protein  30.23 
 
 		 189 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.705014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3673  PadR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 189 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  28.24 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  26.17 
 
 		 305 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  38.74 
 
 		 226 aa  47  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 152 aa  46.6  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0613  transcriptional regulator, PadR-like family  37.97 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.121754  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 181 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5605  PadR-like family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 207 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0554701  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  30 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6303  transcriptional regulator, PadR-like family  38.89 
 
 		 188 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113883  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5624  transcriptional regulator, PadR-like family  32.1 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2736  PadR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 236 aa  45.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.504798 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2019  transcriptional regulator, PadR-like family  25.58 
 
 		 160 aa  45.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.41981 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0905  PadR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 226 aa  45.1  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.760063  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3876  PadR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 226 aa  45.1  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.483976  normal  0.0238497 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0961  PadR-like family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 226 aa  45.1  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 168 aa  45.1  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  34.88 
 
 		 210 aa  44.7  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  32.93 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1362  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 223 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.323106  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37830  transcriptional regulator, PadR family  29.79 
 
 		 227 aa  43.5  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3702  transcriptional regulator, PadR-like family  28.09 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0979  transcriptional regulator PadR family protein  23.21 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.334428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 229 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7568  transcriptional regulator, PadR-like family  35.82 
 
 		 277 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  32.1 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  44.29 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  42.31 
 
 		 181 aa  42.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  31.71 
 
 		 174 aa  42.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  38.16 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  30.51 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 217 aa  42.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  29.32 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07680  predicted transcriptional regulator  26.32 
 
 		 166 aa  42.4  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 181 aa  41.6  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5137  PadR-like family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 254 aa  41.6  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.389503  normal  0.327359 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>