76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0003 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0003  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0291657  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3013  protein of unknown function DUF849  42.49 
 
 		 237 aa  154  8e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4947  hypothetical protein  43.29 
 
 		 268 aa  153  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0506143 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1802  hypothetical protein  45.02 
 
 		 247 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4383  hypothetical protein  45.23 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4764  hypothetical protein  45.23 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842431  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4174  protein of unknown function DUF849  39.24 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4470  hypothetical protein  45.23 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.392324 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2001  protein of unknown function DUF849  41.98 
 
 		 241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0932009 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5318  hypothetical protein  29.62 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3856  hypothetical protein  30.31 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5967  hypothetical protein  29.28 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5149  protein of unknown function DUF849  42.71 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261463  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2080  protein of unknown function DUF849  32.23 
 
 		 453 aa  55.8  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.550211 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4653  hypothetical protein  30.72 
 
 		 283 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0345  hypothetical protein  47.62 
 
 		 289 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0994863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3667  protein of unknown function DUF849  49.21 
 
 		 278 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1332  hypothetical protein  34.13 
 
 		 279 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235755  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3203  hypothetical protein  25.65 
 
 		 316 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272252  normal  0.299347 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  27.13 
 
 		 296 aa  52.8  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3344  protein of unknown function DUF849  49.21 
 
 		 278 aa  52.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  28.74 
 
 		 287 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4686  hypothetical protein  31.42 
 
 		 274 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal  0.972452 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0160  hypothetical protein  40.21 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4505  hypothetical protein  43.75 
 
 		 277 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.23371 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1080  hypothetical protein  36.25 
 
 		 281 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431343  normal  0.325295 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2085  protein of unknown function DUF849  30.4 
 
 		 281 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359333  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2376  protein of unknown function DUF849  30.4 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4735  hypothetical protein  29.96 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  35.54 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1894  hypothetical protein  28.12 
 
 		 290 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0673  hypothetical protein  31.03 
 
 		 288 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.144097 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0083  hypothetical protein  46.03 
 
 		 281 aa  50.1  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.187348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3495  hypothetical protein  37.5 
 
 		 281 aa  50.4  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599737  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2814  hypothetical protein  24.41 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.151503  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  34.15 
 
 		 292 aa  49.3  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3412  hypothetical protein  37.14 
 
 		 277 aa  48.5  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.717243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  38.2 
 
 		 293 aa  48.5  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4047  hypothetical protein  49.21 
 
 		 285 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.219165 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  31.48 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5036  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  26.36 
 
 		 280 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  23.17 
 
 		 273 aa  48.1  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  23.94 
 
 		 289 aa  48.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  27.66 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5151  protein of unknown function DUF849  31.58 
 
 		 274 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373427  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1354  hypothetical protein  29.51 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.291809  normal  0.536847 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  38.24 
 
 		 281 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  26.02 
 
 		 321 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0658  protein of unknown function DUF849  30.84 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1770  hypothetical protein  33.65 
 
 		 319 aa  47  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6352  protein of unknown function DUF849  31.25 
 
 		 274 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  31.25 
 
 		 273 aa  46.2  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1631  hypothetical protein  31.25 
 
 		 274 aa  46.2  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2778  hypothetical protein  24.81 
 
 		 294 aa  45.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2933  hypothetical protein  24.81 
 
 		 294 aa  45.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1153  hypothetical protein  24.81 
 
 		 294 aa  45.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3475  protein of unknown function DUF849  34.62 
 
 		 279 aa  45.8  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  38.57 
 
 		 282 aa  44.7  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0981  hypothetical protein  28.71 
 
 		 449 aa  45.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0265293  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  35.8 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  26.94 
 
 		 305 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0285  hypothetical protein  30.17 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  35.8 
 
 		 272 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0377  hypothetical protein  32.31 
 
 		 280 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1554  protein of unknown function DUF849  28.16 
 
 		 278 aa  43.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  35.8 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4226  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  26.05 
 
 		 303 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  32.04 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0174  hypothetical protein  38.26 
 
 		 280 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0513  hypothetical protein  30.97 
 
 		 302 aa  43.5  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0164851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  40 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  35.29 
 
 		 297 aa  43.5  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4165  hypothetical protein  35.58 
 
 		 283 aa  42.7  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0314  hypothetical protein  35 
 
 		 280 aa  42.7  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5229  protein of unknown function DUF849  29.52 
 
 		 274 aa  42.4  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0556  hypothetical protein  33.33 
 
 		 277 aa  42.4  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.103036  normal  0.316329 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>