57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4174 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4174  protein of unknown function DUF849  100 
 
 		 241 aa  471  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3013  protein of unknown function DUF849  44.4 
 
 		 237 aa  174  8e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4470  hypothetical protein  41.95 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.392324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4764  hypothetical protein  41.95 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4383  hypothetical protein  41.95 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4947  hypothetical protein  38.39 
 
 		 268 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0506143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0003  hypothetical protein  39.24 
 
 		 243 aa  131  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0291657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2001  protein of unknown function DUF849  37.3 
 
 		 241 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0932009 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1802  hypothetical protein  41.15 
 
 		 247 aa  116  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3344  protein of unknown function DUF849  29.96 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  26.4 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  24.62 
 
 		 292 aa  55.5  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  24.51 
 
 		 296 aa  53.1  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  21.55 
 
 		 275 aa  52.8  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3440  protein of unknown function DUF849  26.98 
 
 		 296 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01096  hypothetical protein  27.06 
 
 		 281 aa  51.2  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5967  hypothetical protein  27.27 
 
 		 284 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0083  hypothetical protein  29.34 
 
 		 281 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.187348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3667  protein of unknown function DUF849  29.67 
 
 		 278 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0174  hypothetical protein  27.85 
 
 		 280 aa  49.7  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4686  hypothetical protein  29.05 
 
 		 274 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal  0.972452 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3856  hypothetical protein  26.36 
 
 		 285 aa  49.3  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3495  hypothetical protein  24.1 
 
 		 281 aa  48.9  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599737  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  26.97 
 
 		 287 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1080  hypothetical protein  28.22 
 
 		 281 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431343  normal  0.325295 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  23.14 
 
 		 281 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004321  hypothetical protein  27.75 
 
 		 279 aa  47.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4509  protein of unknown function DUF849  26.27 
 
 		 309 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0556  hypothetical protein  25.3 
 
 		 277 aa  47  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.103036  normal  0.316329 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3412  hypothetical protein  23.69 
 
 		 277 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.717243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5318  hypothetical protein  27.47 
 
 		 280 aa  47  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4653  hypothetical protein  25.31 
 
 		 283 aa  47  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  20.25 
 
 		 273 aa  46.6  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5151  protein of unknown function DUF849  28.69 
 
 		 274 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373427  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4715  hypothetical protein  24.47 
 
 		 351 aa  46.2  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155352  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1332  hypothetical protein  25.31 
 
 		 279 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235755  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0827  hypothetical protein  25.88 
 
 		 309 aa  45.8  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  23.11 
 
 		 297 aa  45.4  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  25.67 
 
 		 294 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  23.95 
 
 		 293 aa  45.4  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  22.27 
 
 		 289 aa  45.4  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  25.2 
 
 		 311 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  25.67 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  25.67 
 
 		 294 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  26.97 
 
 		 293 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1937  hypothetical protein  27.27 
 
 		 295 aa  43.9  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.0127736 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0500  hypothetical protein  25.59 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  23.72 
 
 		 293 aa  43.9  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  27.57 
 
 		 282 aa  43.9  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2376  protein of unknown function DUF849  25.51 
 
 		 280 aa  43.5  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3479  hypothetical protein  37.5 
 
 		 264 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.805186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1737  hypothetical protein  26.89 
 
 		 291 aa  43.5  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2085  protein of unknown function DUF849  25.51 
 
 		 281 aa  43.5  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359333  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4735  hypothetical protein  26.05 
 
 		 275 aa  42.7  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5036  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  25.52 
 
 		 280 aa  42.4  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3285  hypothetical protein  26.09 
 
 		 309 aa  42.4  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71150  hypothetical protein  24.8 
 
 		 294 aa  42.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.185944  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>