More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1490 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1490  putative aldolase  100 
 
 
210 aa  431  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0110  putative aldolase  81.07 
 
 
218 aa  354  5e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0116  putative aldolase  81.07 
 
 
218 aa  353  1e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02588  hypothetical protein  74.76 
 
 
212 aa  323  1e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0950  class II aldolase/adducin family protein  74.76 
 
 
212 aa  323  1e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0974  putative aldolase  74.76 
 
 
212 aa  323  1e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.776053  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3035  putative aldolase  74.76 
 
 
212 aa  323  1e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02553  hypothetical protein  74.76 
 
 
212 aa  323  1e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3136  putative aldolase  74.76 
 
 
212 aa  323  1e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2876  putative aldolase  74.76 
 
 
212 aa  323  1e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3225  putative aldolase  74.16 
 
 
212 aa  309  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3066  putative aldolase  74.16 
 
 
212 aa  309  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.494057 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3037  putative aldolase  74.16 
 
 
212 aa  309  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3121  putative aldolase  74.51 
 
 
212 aa  307  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0531321 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3105  putative aldolase  74.02 
 
 
212 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0210  putative aldolase  61.46 
 
 
210 aa  266  1e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2551  putative aldolase  61.46 
 
 
210 aa  265  4e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189319  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04752  putative aldolase  60.39 
 
 
215 aa  264  7e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  59.31 
 
 
210 aa  258  4e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  50.98 
 
 
243 aa  213  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  50.98 
 
 
231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0144  putative aldolase  52.68 
 
 
210 aa  205  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.349251  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0129  putative aldolase  52.2 
 
 
224 aa  202  3e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1837  putative aldolase  48.31 
 
 
212 aa  192  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0769134  normal  0.0677306 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3180  putative aldolase  46.63 
 
 
219 aa  190  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5310  putative aldolase  48.04 
 
 
222 aa  188  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.711943 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1137  putative aldolase  46.63 
 
 
226 aa  185  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.73575 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5014  putative aldolase  47.06 
 
 
224 aa  185  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0583347  normal  0.341145 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1425  putative aldolase  45.5 
 
 
217 aa  184  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4323  putative aldolase  46.12 
 
 
225 aa  184  7e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1632  putative aldolase  46.6 
 
 
220 aa  183  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2434  putative aldolase  47.83 
 
 
211 aa  182  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2082  putative aldolase  45.59 
 
 
220 aa  181  6e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4650  putative aldolase  46.08 
 
 
221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.590566  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3143  putative aldolase  50 
 
 
209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3734  putative aldolase  46.41 
 
 
214 aa  178  7e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1030  putative aldolase  44.12 
 
 
228 aa  177  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3411  putative aldolase  45.45 
 
 
214 aa  175  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2628  putative aldolase  45.59 
 
 
218 aa  174  8e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2170  putative aldolase  44.44 
 
 
220 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.842805  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1853  putative aldolase  45.15 
 
 
220 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2896  putative aldolase  44.22 
 
 
220 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0811936 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2485  class II aldolase/adducin family protein  47.09 
 
 
226 aa  169  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3382  class II aldolase/adducin family protein  46.46 
 
 
217 aa  168  5e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4425  putative aldolase  42.03 
 
 
218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5075  putative aldolase  43.63 
 
 
212 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2023  class II aldolase/adducin family protein  46.5 
 
 
208 aa  164  9e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0841682  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0476  putative aldolase  42.79 
 
 
212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369646  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1445  class II aldolase/adducin family protein  46 
 
 
208 aa  162  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5062  class II aldolase/adducin domain protein  43.55 
 
 
212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5929  putative aldolase  42.51 
 
 
220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0464  putative aldolase  42.55 
 
 
212 aa  161  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1553  putative aldolase  40.69 
 
 
216 aa  160  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  normal  0.465696 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2814  putative aldolase  42.79 
 
 
212 aa  159  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.216378 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3498  putative aldolase  40.87 
 
 
213 aa  157  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.392898  normal  0.194137 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0975  putative aldolase  42.72 
 
 
213 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4552  putative aldolase  43.14 
 
 
213 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.211976 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5122  putative aldolase  42.51 
 
 
212 aa  151  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3210  putative aldolase  42.51 
 
 
212 aa  151  8e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5157  putative aldolase  42.51 
 
 
212 aa  151  8e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117752  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0575  putative aldolase  42.65 
 
 
213 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0440  putative aldolase  42.65 
 
 
213 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0892  putative aldolase  42.65 
 
 
213 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2015  putative aldolase  42.65 
 
 
213 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435503  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1922  putative aldolase  42.65 
 
 
213 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1859  putative aldolase  42.65 
 
 
213 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1553  class II aldolase/adducin family protein  42.5 
 
 
204 aa  149  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2331  class II aldolase/adducin family protein  39.11 
 
 
216 aa  145  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3731  class II aldolase/adducin family protein  41.29 
 
 
220 aa  142  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4877  putative aldolase  40.72 
 
 
224 aa  135  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5143  putative aldolase  40 
 
 
222 aa  134  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0444  putative aldolase  38.01 
 
 
224 aa  129  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4769  class II aldolase/adducin family protein  34.95 
 
 
227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  32.63 
 
 
265 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  35.68 
 
 
207 aa  111  9e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2543  class II aldolase/adducin family protein  37.43 
 
 
237 aa  105  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3030  L-fuculose-1-phosphate aldolase  34.55 
 
 
220 aa  99.4  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0672732  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0434  class II aldolase/adducin family protein  33.52 
 
 
180 aa  98.6  6e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192772  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0503  class II aldolase/adducin family protein  34.27 
 
 
181 aa  97.8  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0398  class II aldolase/adducin family protein  31.6 
 
 
214 aa  97.4  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3402  class II aldolase/adducin family protein  31.6 
 
 
225 aa  97.4  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852747  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1224  class II aldolase/adducin family protein  34.12 
 
 
220 aa  95.5  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.190003 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1486  class II aldolase/adducin family protein  31.87 
 
 
190 aa  95.5  5e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0403  class II aldolase/adducin family protein  31.49 
 
 
181 aa  95.5  5e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.631542  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1177  class II aldolase/adducin family protein  30.16 
 
 
264 aa  94.7  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000951199  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0650  class II aldolase/adducin family protein  32.72 
 
 
222 aa  93.2  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.249121  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  32.84 
 
 
222 aa  93.6  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1051  L-fuculose phosphate aldolase  30.48 
 
 
234 aa  93.2  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.698084  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  30.81 
 
 
216 aa  92.4  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4482  class II aldolase/adducin-like  30.2 
 
 
220 aa  90.9  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0177289  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1884  L-fuculose phosphate aldolase  32.2 
 
 
213 aa  90.9  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1747  class II aldolase/adducin family protein  27.88 
 
 
303 aa  90.5  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241807  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1110  L-fuculose phosphate aldolase, putative  34.13 
 
 
219 aa  89.7  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1188  class II aldolase/adducin family protein  33.16 
 
 
222 aa  89  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0647898  normal  0.0283985 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0642  class II aldolase/adducin family protein  29.95 
 
 
215 aa  89  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.606774  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3569  hypothetical protein  34.91 
 
 
332 aa  87.4  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2465  class II aldolase/adducin family protein  32.11 
 
 
215 aa  87  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0198  class II aldolase/adducin family protein  29.67 
 
 
180 aa  86.7  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0602846  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2031  class II aldolase/adducin family protein  30.27 
 
 
211 aa  87  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3550  class II aldolase/adducin family protein  33.16 
 
 
214 aa  85.1  7e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>