121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1309 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1309  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  261  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2189  hypothetical protein  62.83 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124091  hitchhiker  0.000597226 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  61.62 
 
 		 386 aa  130  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1363  protein of unknown function DUF1232  60 
 
 		 126 aa  126  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00386396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1462  protein of unknown function DUF1232  58.26 
 
 		 126 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583508  normal  0.293258 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  59.62 
 
 		 114 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1795  hypothetical protein  55.75 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  53.57 
 
 		 386 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0754  hypothetical protein  60.55 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3871  hypothetical protein  58.26 
 
 		 125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4882  protein of unknown function DUF1232  60.47 
 
 		 129 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0592  hypothetical protein  59.34 
 
 		 137 aa  110  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632584  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3485  protein of unknown function DUF1232  50.43 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1269  hypothetical protein  52.68 
 
 		 132 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3856  hypothetical protein  54.13 
 
 		 124 aa  108  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0230903  normal  0.0305359 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  44.74 
 
 		 142 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2623  hypothetical protein  49.59 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3216  hypothetical protein  48 
 
 		 111 aa  104  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.944113  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0463  hypothetical protein  49.09 
 
 		 130 aa  104  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.572887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0873  protein of unknown function DUF1232  46.49 
 
 		 124 aa  103  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0685526 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2593  protein of unknown function DUF1232  46.96 
 
 		 130 aa  102  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3901  hypothetical protein  44.74 
 
 		 132 aa  100  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0698239  normal  0.0160769 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1439  hypothetical protein  45.3 
 
 		 131 aa  96.7  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0560  hypothetical protein  58.59 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  39.66 
 
 		 118 aa  92  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134025  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0941  hypothetical protein  46.85 
 
 		 133 aa  89.4  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000582601  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2543  hypothetical protein  67.69 
 
 		 75 aa  88.2  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3301  hypothetical protein  57.14 
 
 		 125 aa  87.8  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1552  protein of unknown function DUF1232  39.32 
 
 		 121 aa  87  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000451461  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0456  protein of unknown function DUF1232  36.21 
 
 		 127 aa  85.5  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1695  protein of unknown function DUF1232  40.91 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1980  protein of unknown function DUF1232  43.88 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55739  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2654  protein of unknown function DUF1232  55.24 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.140494  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2380  protein of unknown function DUF1232  41.84 
 
 		 98 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.658738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1977  hypothetical protein  49.45 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.284202 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1449  hypothetical protein  63.64 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.808576  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1079  hypothetical protein  43.88 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3740  uncharacterized small membrane protein  45 
 
 		 94 aa  70.1  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2183  hypothetical protein  50 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.697444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2241  hypothetical protein  39.29 
 
 		 89 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0559618 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0751  hypothetical protein  37.93 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2502  hypothetical protein  39.24 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0793  hypothetical protein  39.24 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.569474  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0024  protein of unknown function DUF1232  40.3 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1308  hypothetical protein  41.46 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525865  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2926  hypothetical protein  40.74 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4012  hypothetical protein  43.21 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3716  hypothetical protein  34.57 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270803 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  35.06 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0363  hypothetical protein  39.68 
 
 		 80 aa  52  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.029871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0490  hypothetical protein  40.7 
 
 		 249 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  31.4 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  31.46 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  32.95 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  34.94 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0704  hypothetical protein  33.77 
 
 		 124 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18241  hypothetical protein  32.22 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0694351 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  34.69 
 
 		 143 aa  47.8  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1330  protein of unknown function DUF1232  39.13 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  41.67 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2523  hypothetical protein  34.33 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0989751  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05801  hypothetical protein  29.67 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4172  hypothetical protein  32.86 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0445378  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1034  hypothetical protein  30.69 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.383392  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0247  hypothetical protein  32.84 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0280  hypothetical protein  35 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0597  hypothetical protein  38.67 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.182188  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  44.68 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2505  hypothetical protein  29.52 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00216917  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  44.68 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2278  hypothetical protein  29.52 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575719  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0145  hypothetical protein  34.92 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3332  hypothetical protein  30.68 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4050  protein of unknown function DUF1232  39.06 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3727  protein of unknown function DUF1232  39.06 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883988  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2261  hypothetical protein  29.52 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000353755  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2487  hypothetical protein  29.52 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3655  hypothetical protein  35.71 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0289  hypothetical protein  35.71 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3867  hypothetical protein  35.71 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4080  hypothetical protein  38.1 
 
 		 117 aa  42.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3070  hypothetical protein  35.94 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0318  hypothetical protein  35.71 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2219  hypothetical protein  29.52 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0999  hypothetical protein  38.33 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.178423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3677  hypothetical protein  35.71 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4049  hypothetical protein  38.1 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0092  hypothetical protein  29.79 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0407  hypothetical protein  29.58 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4167  hypothetical protein  38.1 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2566  hypothetical protein  29.52 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0631165  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3972  protein of unknown function DUF1232  38.1 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  35.59 
 
 		 171 aa  41.6  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2657  hypothetical protein  27.18 
 
 		 126 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90763  hitchhiker  0.00677971 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1882  protein of unknown function DUF1232  60 
 
 		 95 aa  42  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2427  hypothetical protein  27.62 
 
 		 109 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2903  hypothetical protein  27.62 
 
 		 109 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0923004  normal  0.0879248 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  31.43 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  41.46 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0661  hypothetical protein  32.39 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>