More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2772 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00435  copper transporter  49.53 
 
 
834 aa  690    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3126  copper-translocating P-type ATPase  49.53 
 
 
834 aa  690    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0477  copper-exporting ATPase  47.66 
 
 
742 aa  696    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00355  Cation transport ATPase  50.46 
 
 
782 aa  757    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1689  cation transporter E1-E2 family ATPase  65.88 
 
 
753 aa  1000    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00395  Cation transport ATPase  52.07 
 
 
747 aa  739    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0802  copper-transporting P-type ATPase  45.33 
 
 
902 aa  636    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00440  hypothetical protein  49.53 
 
 
834 aa  690    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004188  copper-translocating P-type ATPase  47.76 
 
 
909 aa  696    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1690  copper-translocating P-type ATPase  47.79 
 
 
740 aa  696    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3027  copper-translocating P-type ATPase  49.2 
 
 
939 aa  692    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1505  copper-translocating P-type ATPase  66.23 
 
 
744 aa  983    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3165  copper exporting ATPase  48.87 
 
 
961 aa  690    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.517155  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0270  copper-translocating P-type ATPase  51.72 
 
 
748 aa  751    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3818  copper-translocating P-type ATPase  51.39 
 
 
747 aa  752    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.585028  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0562  copper exporting ATPase  48.87 
 
 
833 aa  693    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.304776  normal  0.828863 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3191  copper-translocating P-type ATPase  65.45 
 
 
760 aa  1002    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.427707  normal  0.767066 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3027  copper exporting ATPase  48.6 
 
 
955 aa  686    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0552  copper exporting ATPase  49 
 
 
833 aa  694    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1535  copper-translocating P-type ATPase  66.09 
 
 
744 aa  981    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.639562  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0419  copper exporting ATPase  49.33 
 
 
834 aa  684    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2772  copper-translocating P-type ATPase  100 
 
 
757 aa  1524    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1408  copper-translocating P-type ATPase  67.02 
 
 
744 aa  995    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.659936  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3220  copper exporting ATPase  50.07 
 
 
907 aa  707    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3006  copper-translocating P-type ATPase  47.23 
 
 
850 aa  669    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40662  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1807  cation transporter E1-E2 family ATPase  47.55 
 
 
915 aa  676    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3132  copper exporting ATPase  49.33 
 
 
834 aa  682    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.142794  hitchhiker  0.000000556714 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2846  copper-translocating P-type ATPase  66.49 
 
 
744 aa  988    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.515584  hitchhiker  0.000113532 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0527  copper exporting ATPase  49.4 
 
 
834 aa  687    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0606  copper exporting ATPase  49 
 
 
833 aa  694    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0523  copper exporting ATPase  49.27 
 
 
834 aa  688    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2091  copper-translocating P-type ATPase  51.32 
 
 
750 aa  773    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0545  copper exporting ATPase  48.87 
 
 
833 aa  693    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1485  copper-translocating P-type ATPase  66.49 
 
 
752 aa  1021    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.391625 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2587  copper-translocating P-type ATPase  65.41 
 
 
758 aa  1000    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0901243 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2654  copper-translocating P-type ATPase  65.93 
 
 
758 aa  1005    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0212  copper-translocating P-type ATPase  49.6 
 
 
746 aa  717    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1031  copper-translocating P-type ATPase  49.07 
 
 
913 aa  686    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01268  cation transport ATPase  47.08 
 
 
898 aa  694    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4145  copper-translocating P-type ATPase  51.26 
 
 
778 aa  754    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.418825  normal  0.147287 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2761  copper-translocating P-type ATPase  66.58 
 
 
753 aa  1014    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2255  copper-translocating P-type ATPase  49.34 
 
 
869 aa  711    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1381  copper-translocating P-type ATPase  50.87 
 
 
844 aa  749    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0547  copper exporting ATPase  49 
 
 
833 aa  694    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1097  copper exporting ATPase  50.2 
 
 
907 aa  714    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3789  copper-translocating P-type ATPase  49.8 
 
 
860 aa  712    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1265  copper exporting ATPase  48.73 
 
 
955 aa  688    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.057349 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1499  copper-translocating P-type ATPase  66.62 
 
 
744 aa  987    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0563  copper exporting ATPase  49.33 
 
 
834 aa  682    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0962  copper exporting ATPase  48.73 
 
 
832 aa  704    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.220688  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0577  copper exporting ATPase  49.73 
 
 
834 aa  687    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2072  copper-translocating P-type ATPase  46.91 
 
 
725 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  44.07 
 
 
827 aa  600  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  48.77 
 
 
823 aa  592  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  43.32 
 
 
841 aa  588  1e-166  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  43.95 
 
 
762 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  44.2 
 
 
833 aa  587  1e-166  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  43.82 
 
 
762 aa  585  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  43.68 
 
 
767 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  45.12 
 
 
839 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  43.68 
 
 
762 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  43.55 
 
 
762 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  47.9 
 
 
795 aa  580  1e-164  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  42.8 
 
 
826 aa  576  1.0000000000000001e-163  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0177  heavy metal translocating P-type ATPase  47.46 
 
 
755 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.963495  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  42.75 
 
 
786 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  43.03 
 
 
833 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  42.19 
 
 
839 aa  575  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  43.17 
 
 
837 aa  574  1.0000000000000001e-162  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1000  heavy metal translocating P-type ATPase  47.27 
 
 
809 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111426 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  43.03 
 
 
840 aa  575  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1098  copper-translocating P-type ATPase  48.29 
 
 
806 aa  570  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0763477  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3420  heavy metal translocating P-type ATPase  48.01 
 
 
815 aa  570  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9859  copper-translocating P-type ATPase  46.79 
 
 
737 aa  571  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1533  heavy metal translocating P-type ATPase  49.28 
 
 
724 aa  570  1e-161  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0264  heavy metal translocating P-type ATPase  48.01 
 
 
815 aa  570  1e-161  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11723  heavy-metal transporting P-type ATPase  43.78 
 
 
835 aa  572  1e-161  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0439709  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4302  heavy metal translocating P-type ATPase  47.85 
 
 
815 aa  570  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  47.07 
 
 
804 aa  566  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1596  hypothetical protein  44.87 
 
 
735 aa  568  1e-160  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1397  hypothetical protein  47.92 
 
 
735 aa  567  1e-160  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  42.48 
 
 
852 aa  568  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  41.55 
 
 
836 aa  566  1e-160  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  43.53 
 
 
855 aa  567  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  42.61 
 
 
836 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  42.82 
 
 
831 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  41.84 
 
 
836 aa  565  1.0000000000000001e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  43.17 
 
 
752 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3941  heavy metal translocating P-type ATPase  46.5 
 
 
781 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  42.61 
 
 
836 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2429  copper-translocating P-type ATPase  48.01 
 
 
773 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3603  heavy metal translocating P-type ATPase  46.5 
 
 
781 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.385449 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4911  heavy metal translocating P-type ATPase  47.55 
 
 
793 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_824  cation transport ATPase  40.79 
 
 
828 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1223  heavy metal translocating P-type ATPase  43.52 
 
 
721 aa  560  1e-158  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  48.17 
 
 
801 aa  559  1e-158  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2080  heavy metal translocating P-type ATPase  40.87 
 
 
814 aa  559  1e-158  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0351429  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  47.26 
 
 
846 aa  561  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  43.18 
 
 
797 aa  560  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7880  heavy metal translocating P-type ATPase  47.53 
 
 
788 aa  557  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>