More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1376 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3053  flagellar biosynthesis regulator FlhF  71.25 
 
 		 460 aa  656    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.432908  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1376  flagellar biosynthesis regulator FlhF  100 
 
 		 470 aa  961    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0597735  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1633  flagellar biosynthesis regulator FlhF  76.68 
 
 		 467 aa  721    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0994643  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3212  flagellar biosynthesis regulator FlhF  70.95 
 
 		 458 aa  653    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2561  flagellar biosynthesis regulator FlhF  72.69 
 
 		 460 aa  667    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.287894  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2911  flagellar biosynthesis regulator FlhF  71.04 
 
 		 460 aa  654    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2282  flagellar biosynthesis regulator FlhF  72.12 
 
 		 463 aa  667    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.451131  normal  0.682206 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1381  flagellar biosynthesis regulator FlhF  73.16 
 
 		 474 aa  703    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.286129 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1341  flagellar biosynthesis regulator FlhF  68.79 
 
 		 462 aa  643    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3051  flagellar biosynthesis regulator FlhF  76.89 
 
 		 464 aa  714    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.03242 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1452  flagellar biosynthesis regulator FlhF  71.25 
 
 		 460 aa  656    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1197  flagellar biosynthesis regulator FlhF  69.36 
 
 		 461 aa  665    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.137335  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2921  flagellar biosynthesis regulator FlhF  71.04 
 
 		 460 aa  655    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1357  flagellar biosynthesis regulator FlhF  71.97 
 
 		 458 aa  645    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.592498  normal  0.109972 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1297  flagellar biosynthesis regulator FlhF  70.49 
 
 		 458 aa  629  1e-179  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.113598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1364  flagellar biosynthesis regulator FlhF  70.28 
 
 		 458 aa  627  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.789112  normal  0.915737 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1656  flagellar biosynthesis regulator FlhF  46.34 
 
 		 495 aa  370  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000227361  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03146  flagellar biosynthesis regulator FlhF  44.69 
 
 		 503 aa  361  1e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2292  flagellar biosynthesis regulator FlhF  45.16 
 
 		 484 aa  359  5e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002830  flagellar biosynthesis protein FlhF  43.28 
 
 		 505 aa  352  8e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00231681  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1517  flagellar biosynthesis regulator FlhF  42.15 
 
 		 513 aa  352  1e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02872  flagellar biosynthesis protein  40.85 
 
 		 477 aa  295  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3032  GTP-binding signal recognition particle  41.59 
 
 		 443 aa  278  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1336  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  37.25 
 
 		 424 aa  249  7e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.550768  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2157  flagellar biosynthesis regulator FlhF  47.37 
 
 		 393 aa  238  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0741  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.38 
 
 		 487 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2807  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.37 
 
 		 437 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.16054 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1977  GTP-binding signal recognition particle  33.62 
 
 		 437 aa  229  8e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1946  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.13 
 
 		 536 aa  229  9e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45660  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.92 
 
 		 429 aa  225  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.311812 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3429  GTP-binding signal recognition particle  35.65 
 
 		 427 aa  224  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.911214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3439  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.63 
 
 		 442 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3669  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.5 
 
 		 435 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3874  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.11 
 
 		 429 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.571871  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0715  flagellar biosynthetic protein FlhF  33.96 
 
 		 485 aa  219  7.999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.858547  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1977  flagellar biosynthesis protein FlhF  33.55 
 
 		 442 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.218828  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3912  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.23 
 
 		 435 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4343  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.33 
 
 		 435 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1524  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.33 
 
 		 435 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.142564  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0479  GTP-binding signal recognition particle  41.4 
 
 		 585 aa  209  8e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.530078  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0745  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.99 
 
 		 388 aa  209  1e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2936  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.35 
 
 		 489 aa  207  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0148742  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0983  GTP-binding signal recognition particle  41.02 
 
 		 466 aa  203  6e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10552 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3700  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.67 
 
 		 825 aa  202  8e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.528557  normal  0.0206253 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3821  GTP-binding signal recognition particle  31.89 
 
 		 530 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.236698 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1311  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.92 
 
 		 570 aa  197  3e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3094  AAA ATPase  31.69 
 
 		 530 aa  195  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0196  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.64 
 
 		 588 aa  194  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.625172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0183  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.64 
 
 		 588 aa  194  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3079  flagellar GTP-binding protein  40.33 
 
 		 521 aa  191  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0061  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.71 
 
 		 583 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2014  GTP-binding signal recognition particle SRP54, G-protein  39.06 
 
 		 729 aa  191  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3923  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.71 
 
 		 583 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3802  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.9 
 
 		 624 aa  190  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3168  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.57 
 
 		 577 aa  190  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2845  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.11 
 
 		 374 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1697  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.11 
 
 		 374 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3421  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.11 
 
 		 374 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1620  GTP-binding signal recognition particle  39.64 
 
 		 592 aa  189  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00835044 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3842  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.5 
 
 		 583 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1247  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.15 
 
 		 414 aa  187  3e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00959  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.82 
 
 		 551 aa  187  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.136085  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06207  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.82 
 
 		 551 aa  187  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106259  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1748  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.46 
 
 		 379 aa  186  6e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1748  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.46 
 
 		 379 aa  186  8e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0251  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.61 
 
 		 582 aa  186  9e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.789642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4414  GTP-binding signal recognition particle  30.91 
 
 		 524 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0564624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4068  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.38 
 
 		 632 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2838  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.61 
 
 		 592 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4180  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.38 
 
 		 632 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0269  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.61 
 
 		 592 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.147151  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1392  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.19 
 
 		 615 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.70556  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0177  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.86 
 
 		 583 aa  184  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.167387 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4142  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.36 
 
 		 784 aa  184  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3372  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.34 
 
 		 587 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0303605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0132  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.67 
 
 		 657 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2962  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.79 
 
 		 644 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.168283  normal  0.0622523 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27900  flagellar biosynthesis protein  41.24 
 
 		 758 aa  182  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0457594  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1864  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.96 
 
 		 542 aa  182  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.625266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1561  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.95 
 
 		 446 aa  179  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.37144  normal  0.111794 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5617  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.33 
 
 		 804 aa  176  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51958  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0598  GTP-binding signal recognition particle  39.59 
 
 		 548 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4110  GTP-binding signal recognition particle  42.65 
 
 		 447 aa  169  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.963643  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0589  flagellar biosynthetic protein FlhF  30.02 
 
 		 437 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2166  flagellar biosynthetic protein FlhF  36.61 
 
 		 527 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1747  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.81 
 
 		 413 aa  164  4.0000000000000004e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3445  GTP-binding signal recognition particle  31.49 
 
 		 446 aa  162  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1173  flagellar biosynthetic protein FlhF  35.62 
 
 		 424 aa  162  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.141847  normal  0.243928 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3708  GTP-binding signal recognition particle  30.71 
 
 		 479 aa  161  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1178  flagellar biosynthetic protein FlhF  36.71 
 
 		 375 aa  160  4e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0427  GTP-binding signal recognition particle  39.63 
 
 		 452 aa  158  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3285  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  44.56 
 
 		 441 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1161  flagellar GTP-binding protein  46.15 
 
 		 419 aa  155  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0930  GTP-binding signal recognition particle  35.26 
 
 		 479 aa  154  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0705  flagellar biosynthesis regulator FlhF  41.44 
 
 		 438 aa  154  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3055  flagellar biosynthetic protein FlhF, putative  40.93 
 
 		 441 aa  152  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3766  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  39.45 
 
 		 468 aa  151  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3850  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  39.45 
 
 		 481 aa  151  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000866601 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4133  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  30.11 
 
 		 412 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.535146  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0791  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.49 
 
 		 392 aa  148  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0874551  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>