More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5787 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5787  histidine kinase  100 
 
 		 415 aa  814    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.634184 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4365  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 		 468 aa  239  5.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.665132  normal  0.714097 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.06 
 
 		 407 aa  194  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 440 aa  156  7e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 445 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  33.23 
 
 		 422 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  35.04 
 
 		 413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 385 aa  129  9.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884966 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 		 372 aa  126  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  35.42 
 
 		 403 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 402 aa  122  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  38.19 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  35.02 
 
 		 381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 		 421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 397 aa  114  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  32.91 
 
 		 431 aa  112  9e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5452  sensor histidine kinase  31.42 
 
 		 556 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6031  Histidine kinase  38.27 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5078  histidine kinase  40.32 
 
 		 368 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2170  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 		 438 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.289043  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3408  histidine kinase  39.32 
 
 		 686 aa  110  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000158036  hitchhiker  0.000062789 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1596  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 420 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.310205  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 552 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.191431 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6313  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 448 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2942  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 333 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3924  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 		 363 aa  107  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1232  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 334 aa  106  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.783946 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  33.6 
 
 		 575 aa  106  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2612  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.48 
 
 		 391 aa  106  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 		 411 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0826  Histidine kinase  37.05 
 
 		 412 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 412 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  33.6 
 
 		 575 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  33.6 
 
 		 575 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  36.36 
 
 		 459 aa  105  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4752  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 393 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  32.6 
 
 		 397 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3023  response regulator  27.78 
 
 		 597 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000011368  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 485 aa  103  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2483  histidine kinase  31.03 
 
 		 514 aa  103  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.705062  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 		 468 aa  103  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1935  Histidine kinase  31.6 
 
 		 364 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 		 513 aa  103  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506396  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 546 aa  103  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3391  histidine kinase  37.5 
 
 		 356 aa  103  8e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.382044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4001  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 700 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 700 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0142  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 485 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 		 703 aa  102  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0748  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.87 
 
 		 393 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.279755 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  33.33 
 
 		 740 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  34.31 
 
 		 598 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0150  histidine kinase  29.58 
 
 		 485 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 594 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 598 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0607  histidine kinase  29.07 
 
 		 413 aa  100  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  35.21 
 
 		 470 aa  100  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 595 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5988  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 700 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 684 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 561 aa  100  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  32.63 
 
 		 387 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  33.63 
 
 		 378 aa  100  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5264  histidine kinase  27.9 
 
 		 376 aa  100  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3546  histidine kinase  34.23 
 
 		 489 aa  99.8  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.871685 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  35.35 
 
 		 466 aa  99.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  33.91 
 
 		 683 aa  99.8  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 707 aa  99.8  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.235944 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3162  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 381 aa  99.8  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.541775  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1651  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 		 703 aa  99.8  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.658025  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 		 468 aa  99.4  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0253  sensory box histidine kinase  33.04 
 
 		 830 aa  99.4  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0289  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  28.57 
 
 		 474 aa  99  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.79349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 404 aa  99  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2882  Histidine kinase  34.82 
 
 		 413 aa  98.6  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00350907  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2381  histidine kinase-related ATPase, putative  26.07 
 
 		 382 aa  98.6  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1368  histidine kinase  31.58 
 
 		 525 aa  98.2  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672249  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0817  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  31.43 
 
 		 466 aa  99  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000394288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  32.89 
 
 		 1226 aa  98.6  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 450 aa  98.6  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 475 aa  98.6  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 		 574 aa  99  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6398  histidine kinase  32.75 
 
 		 461 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.176497 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  34.88 
 
 		 466 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  34.88 
 
 		 466 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4605  histidine kinase  32.16 
 
 		 403 aa  97.4  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.506334 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  31.38 
 
 		 380 aa  97.4  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0877  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 474 aa  97.4  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.858486  normal  0.37178 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  31.25 
 
 		 482 aa  97.4  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1842  histidine kinase  33.17 
 
 		 529 aa  97.4  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  34.88 
 
 		 466 aa  97.1  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  38.06 
 
 		 481 aa  97.1  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  34.88 
 
 		 466 aa  97.1  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1808  histidine kinase  29.63 
 
 		 461 aa  97.1  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  34.88 
 
 		 466 aa  97.1  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 1229 aa  96.7  6e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1248  sensory box histidine kinase/response regulator  31.06 
 
 		 687 aa  97.1  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535727  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 596 aa  96.7  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 471 aa  96.3  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>