More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4972 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009620  Smed_4972  dehydratase  100 
 
 
153 aa  312  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.810088  normal  0.1102 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0316  dehydratase  85.81 
 
 
148 aa  270  4.0000000000000004e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.416674  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2272  dehydratase  70.95 
 
 
148 aa  219  9e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4127  dehydratase  65.31 
 
 
146 aa  201  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2751  MaoC domain protein dehydratase  65.99 
 
 
146 aa  201  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84456  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3489  MaoC domain protein dehydratase  60.69 
 
 
147 aa  191  3e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2549  dehydratase  56.16 
 
 
154 aa  171  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0407782  normal  0.257026 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.33 
 
 
686 aa  107  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1539  dehydratase  36.55 
 
 
160 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  43.84 
 
 
686 aa  100  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3568  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.15 
 
 
682 aa  100  8e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.282162 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2956  MaoC domain protein dehydratase  46.83 
 
 
148 aa  99  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  40.69 
 
 
679 aa  97.1  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3869  MaoC-like dehydratase  37.34 
 
 
166 aa  96.3  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3090  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  42.47 
 
 
684 aa  94.7  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.748677  hitchhiker  0.00334678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3270  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  41.78 
 
 
684 aa  94  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2626  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  41.22 
 
 
684 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574883  normal  0.162198 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2489  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  41.78 
 
 
684 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8223  MaoC domain protein dehydratase  38.03 
 
 
150 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.924905  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6428  MaoC-like dehydratase  39.52 
 
 
146 aa  89  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.632937  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3071  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  38.36 
 
 
690 aa  89.4  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.329771 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1857  MaoC domain protein dehydratase  40.14 
 
 
149 aa  88.2  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1913  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  40.54 
 
 
695 aa  87.4  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0600585  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2639  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  39.04 
 
 
683 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.31992  normal  0.197677 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1030  MaoC domain protein dehydratase  33.79 
 
 
157 aa  85.5  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329133  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4357  MaoC domain protein dehydratase  34 
 
 
159 aa  85.5  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0411099  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0649  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  40.67 
 
 
683 aa  84.3  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.940422  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2898  MaoC domain protein dehydratase  33.79 
 
 
152 aa  84.3  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4804  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  40.15 
 
 
686 aa  84  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.27422 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6312  MaoC domain protein dehydratase  39.16 
 
 
157 aa  83.6  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1556  phenylacetic acid degradation protein paaN  38.26 
 
 
690 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7491  MaoC-like dehydratase  33.85 
 
 
165 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.490012 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0956  dehydratase  34.48 
 
 
150 aa  82  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0934  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  39.71 
 
 
691 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1534  MaoC-like dehydratase  35.17 
 
 
150 aa  80.9  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.734487  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3359  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  38.97 
 
 
685 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.990834  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4109  dehydratase  38.73 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294085  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2275  dehydratase  36.99 
 
 
167 aa  79.7  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2268  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  36.99 
 
 
681 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2258  phenylacetic acid degradation protein paaN  36.99 
 
 
681 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1474  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  36.99 
 
 
681 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1641  MaoC-like dehydratase  35.16 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204847  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3435  MaoC domain protein dehydratase  32.56 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0907  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  37.16 
 
 
687 aa  77.4  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338542  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1572  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  36.3 
 
 
681 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0031  dehydratase  37.06 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.109273  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  37.41 
 
 
683 aa  77  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4965  dehydratase  34.67 
 
 
183 aa  77  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal  0.0181187 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3636  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  36.55 
 
 
678 aa  77  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1834  MaoC-like dehydratase  35.04 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.420495  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1925  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  37.78 
 
 
679 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0838003  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1877  dehydratase  32.64 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4847  dehydratase  35.66 
 
 
164 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3103  MaoC domain protein dehydratase  29.61 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000549225 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5537  dehydratase, MaoC-like domain-containing protein  40.6 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4375  MaoC domain protein dehydratase  30.56 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0232  dehydratase  37.24 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4505  MaoC-like dehydratase  31.72 
 
 
161 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.547822 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1832  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  36.05 
 
 
678 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2124  MaoC domain protein dehydratase  32.89 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000215155  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3000  MaoC domain-containing protein  30.92 
 
 
151 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0628235  normal  0.0197508 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2693  dehydratase  30.92 
 
 
151 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215735  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6513  MaoC domain protein dehydratase  31.82 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1356  (de)hydratase  41.53 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7153  MaoC-like dehydratase  33.09 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851321  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6022  dehydratase  29.66 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176913  normal  0.447849 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6129  dehydratase  28.28 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6403  dehydratase  29.05 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.394709 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3886  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  35.38 
 
 
464 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271652  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1553  dehydratase  28.97 
 
 
161 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5530  MaoC-like dehydratase  29.05 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5510  MaoC domain protein dehydratase  28.97 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615692  normal  0.427484 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5894  dehydratase  29.05 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36432  normal  0.974652 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3455  MaoC domain protein dehydratase  31.03 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.031511  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6336  MaoC-like dehydratase  29.37 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00693601  normal  0.881007 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6290  MaoC domain protein dehydratase  35.97 
 
 
162 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16324  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4152  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  36.76 
 
 
686 aa  68.9  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39195  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20290  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
706 aa  68.2  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0650346  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0658  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  35.81 
 
 
664 aa  68.2  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1965  maoC family protein  34.88 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000123748 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3315  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  36.72 
 
 
470 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.287925  normal  0.745735 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1709  dehydrogenase with MaoC-like domain  29.58 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2919  dehydratase  31.76 
 
 
184 aa  67  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6753  dehydratase  36.03 
 
 
156 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.478036  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1790  maoC family protein  34.38 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00332873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1929  MaoC family protein  34.38 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.988718  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0611  dehydratase  43.18 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519544  normal  0.134756 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6530  dehydratase  28.28 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.82464  normal  0.726262 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0480  MaoC domain-containing protein  28.87 
 
 
174 aa  65.5  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1747  acyl dehydratase  33.59 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0685  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  35.88 
 
 
674 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0437  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  35.38 
 
 
676 aa  66.2  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.68112 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6245  dehydratase  28.28 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12521  oxidase regulatory-like protein  29.14 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26540  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  37.69 
 
 
681 aa  65.5  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.212629 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0702  MoaC domain-containing protein  25.69 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3053  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  35.38 
 
 
702 aa  65.1  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1933  MoaC domain-containing protein  25.69 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1055  dehydratase  36.43 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3255  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  33.78 
 
 
703 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.607573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>