More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4079 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  100 
 
 		 268 aa  538  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  74.1 
 
 		 264 aa  372  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  73.81 
 
 		 265 aa  367  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3914  ABC transporter related  71.98 
 
 		 264 aa  366  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291945  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  61.6 
 
 		 266 aa  308  8e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3096  ABC transporter  57.89 
 
 		 263 aa  275  5e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3258  iron ABC transporter, ATP-binding protein  56.75 
 
 		 263 aa  275  7e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.047532  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1927  ABC transporter related  54.18 
 
 		 262 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0701632 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3390  ABC Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  59.36 
 
 		 260 aa  265  5e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.864072  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3036  ABC transporter related  58.96 
 
 		 260 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1360  ABC transporter related  63.56 
 
 		 256 aa  259  3e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2416  iron ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.98 
 
 		 262 aa  258  6e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.484616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3279  ABC transporter related  54.18 
 
 		 262 aa  255  5e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2056  ABC transporter related  54.18 
 
 		 262 aa  255  6e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2599  ABC transporter related  52.19 
 
 		 254 aa  245  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2273  ABC transporter related  51.39 
 
 		 254 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2982  ABC transporter related  53.06 
 
 		 254 aa  244  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200508  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3207  ABC transporter related  47.43 
 
 		 253 aa  243  3e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.712241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4222  ABC transporter related  52.38 
 
 		 254 aa  240  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5100  ABC transporter related  48.95 
 
 		 253 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130853  normal  0.02881 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  48.59 
 
 		 275 aa  230  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  50.2 
 
 		 257 aa  223  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  45.61 
 
 		 409 aa  217  1e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0443  ABC transporter related  49.4 
 
 		 257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.152213 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5388  ABC transporter related  49.37 
 
 		 253 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133322  normal  0.359169 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17610  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  48.13 
 
 		 251 aa  208  6e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  43.03 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  43.03 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  43.03 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  43.03 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  40.49 
 
 		 266 aa  203  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  42.62 
 
 		 255 aa  201  8e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1426  ABC transporter related protein  44.98 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1610  ABC transporter related protein  50.2 
 
 		 315 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0728276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  42.92 
 
 		 268 aa  198  7e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.66 
 
 		 253 aa  198  7.999999999999999e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3182  ABC transporter related  39.85 
 
 		 321 aa  196  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0840  ABC transporter related  39.85 
 
 		 321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  38.11 
 
 		 251 aa  195  6e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1653  ABC transporter related protein  49.56 
 
 		 254 aa  194  8.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2164  ABC transporter related  39.68 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1330  ABC transporter related  44.58 
 
 		 261 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  43.03 
 
 		 262 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0867  ABC transporter related  44.58 
 
 		 261 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1348  ABC transporter related  44.58 
 
 		 261 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893482  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3280  ABC transporter related  39.77 
 
 		 326 aa  193  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4086  ABC transporter related  42.19 
 
 		 279 aa  194  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0593  ABC transporter-like  43.44 
 
 		 262 aa  192  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1413  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  45.61 
 
 		 295 aa  193  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1301  ABC transporter-related protein  43.78 
 
 		 261 aa  192  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3576  ABC transporter related  47.86 
 
 		 264 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0297567 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2416  ABC transporter related  42.08 
 
 		 273 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.118562 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  43.57 
 
 		 260 aa  192  5e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2035  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  45.19 
 
 		 263 aa  191  7e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0878  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  45.19 
 
 		 265 aa  191  8e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.382345  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2712  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  45.19 
 
 		 265 aa  191  8e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203934  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3192  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  45.19 
 
 		 265 aa  191  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1898  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  45.19 
 
 		 265 aa  191  8e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303699  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3153  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  45.19 
 
 		 263 aa  191  9e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4490  ABC transporter, ATPase subunit  43.75 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0876356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0965  ABC transporter related  40.23 
 
 		 293 aa  191  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1116  ABC transporter related  40.7 
 
 		 307 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  42.54 
 
 		 264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  37.55 
 
 		 259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2584  ABC transporter related  46.28 
 
 		 273 aa  189  5e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  38.91 
 
 		 254 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8245  ABC transporter related  42.97 
 
 		 271 aa  188  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4240  ABC transporter related  43.61 
 
 		 285 aa  188  7e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1033  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.76 
 
 		 285 aa  187  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21290  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  42.55 
 
 		 257 aa  188  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  42.32 
 
 		 490 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3382  ABC transporter related  41 
 
 		 308 aa  186  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  43.36 
 
 		 271 aa  186  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  39.75 
 
 		 255 aa  186  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0584  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.45 
 
 		 256 aa  185  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  39.67 
 
 		 269 aa  185  6e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  43.81 
 
 		 268 aa  185  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  37.5 
 
 		 268 aa  185  8e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  45.74 
 
 		 264 aa  184  9e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0404  ABC transporter related  42.02 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2963  ABC transporter related  40.34 
 
 		 293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4653  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.45 
 
 		 256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4668  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.45 
 
 		 256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3804  ABC transporter related  41.8 
 
 		 271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3844  ABC transporter related  42.74 
 
 		 257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0997  ABC transporter related  39.92 
 
 		 297 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0975  ABC transporter related  39.92 
 
 		 297 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2421  ABC transporter related  44.77 
 
 		 286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00390383  normal  0.0144872 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1009  ABC transporter related  39.92 
 
 		 297 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  39.17 
 
 		 269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3451  ABC transporter related protein  39.13 
 
 		 265 aa  183  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0148611  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4153  ABC transporter related  42.74 
 
 		 257 aa  183  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0112212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0156  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  39.13 
 
 		 265 aa  183  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00150  iron-hydroxamate transporter subunit  39.13 
 
 		 265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00128613  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3037  ABC transporter related  39.17 
 
 		 269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00149  hypothetical protein  39.13 
 
 		 265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00123723  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0155  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  39.13 
 
 		 265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0161  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  39.13 
 
 		 265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  41.67 
 
 		 262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  40.93 
 
 		 266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>