More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3620 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  100 
 
 		 404 aa  827    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  53.98 
 
 		 390 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  54.24 
 
 		 390 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  53.21 
 
 		 390 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  54.31 
 
 		 389 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  54.05 
 
 		 389 aa  437  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  51.39 
 
 		 401 aa  437  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  52.81 
 
 		 400 aa  434  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  52.44 
 
 		 390 aa  425  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  51.16 
 
 		 390 aa  416  9.999999999999999e-116  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1496  NADH dehydrogenase subunit D  50.24 
 
 		 417 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2155  NADH dehydrogenase I, D subunit  50.9 
 
 		 441 aa  408  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  51.4 
 
 		 411 aa  409  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3082  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.49 
 
 		 422 aa  408  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  49.52 
 
 		 417 aa  408  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  47.83 
 
 		 417 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1406  NADH dehydrogenase subunit D  47.83 
 
 		 417 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.621774 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02414  hypothetical protein similar to NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor (Eurofung)  48.22 
 
 		 475 aa  403  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151267 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3223  NADH dehydrogenase I, D subunit  51.44 
 
 		 392 aa  404  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0966966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  50.48 
 
 		 417 aa  403  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  50.13 
 
 		 393 aa  402  1e-111  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3253  NADH dehydrogenase subunit D  48.07 
 
 		 417 aa  403  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.626895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  49.76 
 
 		 417 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0989  NADH dehydrogenase subunit D  48.67 
 
 		 417 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.287966  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1615  NADH dehydrogenase subunit D  48.43 
 
 		 417 aa  399  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0833647  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  49.87 
 
 		 393 aa  399  9.999999999999999e-111  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  47.84 
 
 		 417 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1427  NADH dehydrogenase subunit D  47.34 
 
 		 417 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  49.76 
 
 		 417 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1558  NADH dehydrogenase subunit D  48.84 
 
 		 392 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.970995  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3507  NADH dehydrogenase subunit D  47.34 
 
 		 417 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3297  NADH dehydrogenase subunit D  50.64 
 
 		 402 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  50.65 
 
 		 388 aa  399  9.999999999999999e-111  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0548  NADH dehydrogenase subunit D  48.43 
 
 		 424 aa  398  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.899987  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0924  NADH dehydrogenase subunit D  50.39 
 
 		 406 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  49.61 
 
 		 397 aa  400  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  47.83 
 
 		 417 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3331  NADH dehydrogenase subunit D  48.9 
 
 		 416 aa  396  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150101  normal  0.101451 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2575  NADH dehydrogenase subunit D  50.51 
 
 		 401 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0392469  normal  0.134645 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1346  NADH dehydrogenase subunit D  46.86 
 
 		 417 aa  396  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00313693  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  47.83 
 
 		 417 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0711  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.55 
 
 		 417 aa  396  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.577358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  47.83 
 
 		 417 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1888  NADH dehydrogenase subunit D  46.63 
 
 		 417 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2270  NADH dehydrogenase subunit D  47.58 
 
 		 417 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0316798  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0820  NADH dehydrogenase subunit D  47.83 
 
 		 417 aa  394  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.205502  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2027  NADH dehydrogenase subunit D  48.07 
 
 		 436 aa  392  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1094  NADH dehydrogenase subunit D  47.34 
 
 		 417 aa  393  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.402289  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3211  NADH dehydrogenase subunit D  46.62 
 
 		 417 aa  395  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1504  NADH dehydrogenase subunit D  47.58 
 
 		 417 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00434712 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1031  NADH dehydrogenase subunit D  47.34 
 
 		 417 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0235722  normal  0.1717 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2211  NADH dehydrogenase subunit D  46.63 
 
 		 417 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.518232 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2284  NADH dehydrogenase subunit D  47.34 
 
 		 417 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0248166  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.13 
 
 		 417 aa  393  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1262  NADH dehydrogenase subunit D  49.87 
 
 		 396 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0272  NADH dehydrogenase subunit D  47.83 
 
 		 435 aa  389  1e-107  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2059  NADH dehydrogenase subunit D  46.15 
 
 		 417 aa  391  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102892  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01290  NADH dehydrogenase subunit D  46.79 
 
 		 435 aa  389  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.191542  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  47.1 
 
 		 417 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1826  NADH dehydrogenase subunit D  47.1 
 
 		 417 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4630  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.01 
 
 		 402 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.193494 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0964  NADH dehydrogenase subunit D  46.88 
 
 		 417 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389115  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1885  NADH dehydrogenase subunit D  48.63 
 
 		 402 aa  389  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.634993 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0734  NADH dehydrogenase subunit D  47.1 
 
 		 417 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.301756  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1438  NADH dehydrogenase subunit D  47.1 
 
 		 417 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.38 
 
 		 417 aa  391  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2006  NADH dehydrogenase subunit D  46.62 
 
 		 417 aa  391  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000196393  normal  0.17064 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0243  NADH dehydrogenase subunit D  48.07 
 
 		 435 aa  390  1e-107  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1662  NADH dehydrogenase I, D subunit  50.13 
 
 		 383 aa  388  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1064  NADH dehydrogenase subunit D  47.34 
 
 		 417 aa  391  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240648  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0960  NADH dehydrogenase subunit D  47.58 
 
 		 417 aa  391  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000966275 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2404  NADH dehydrogenase subunit D  49.87 
 
 		 396 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00163945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2884  NADH dehydrogenase subunit D  50 
 
 		 416 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736243  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1302  NADH dehydrogenase subunit D  47.1 
 
 		 417 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0930  NADH dehydrogenase subunit D  45.67 
 
 		 417 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1133  NADH dehydrogenase subunit D  47.1 
 
 		 417 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154075  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0416  NADH dehydrogenase subunit D  47.1 
 
 		 417 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1967  NADH dehydrogenase subunit D  47.23 
 
 		 417 aa  390  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0788296 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1293  NADH dehydrogenase subunit D  47.1 
 
 		 417 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0875  NADH dehydrogenase subunit D  47.58 
 
 		 417 aa  391  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  45.64 
 
 		 793 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3834  NADH dehydrogenase subunit D  49.62 
 
 		 396 aa  385  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4560  NADH dehydrogenase subunit D  48.59 
 
 		 398 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17714 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1354  NADH dehydrogenase subunit D  49.36 
 
 		 396 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.937388  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02730  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  46.25 
 
 		 452 aa  386  1e-106  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0483  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.97 
 
 		 426 aa  385  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.87 
 
 		 414 aa  386  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  46.45 
 
 		 794 aa  388  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68160  NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor  48.06 
 
 		 474 aa  387  1e-106  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1266  NADH dehydrogenase subunit D  45.89 
 
 		 417 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2810  NADH dehydrogenase subunit D  46.38 
 
 		 417 aa  386  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.299965 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1715  NADH dehydrogenase subunit D  48.6 
 
 		 396 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1961  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.56 
 
 		 417 aa  385  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00447389  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2004  NADH dehydrogenase subunit D  47.78 
 
 		 402 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2515  NADH dehydrogenase subunit D  48.3 
 
 		 404 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4129  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.58 
 
 		 396 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5799  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.36 
 
 		 396 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.143218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1025  NADH dehydrogenase subunit D  48.84 
 
 		 396 aa  382  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0184  NADH dehydrogenase subunit D  48.32 
 
 		 408 aa  384  1e-105  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1762  NADH dehydrogenase subunit D  48.18 
 
 		 417 aa  382  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>