70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3053 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3053  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  100 
 
 		 220 aa  450  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4235  possible lolA type protein  74.7 
 
 		 220 aa  279  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48726  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  73.1 
 
 		 222 aa  277  9e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3767  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  73.1 
 
 		 222 aa  276  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.796035 
 
 
-
 
NC_004310  BR2003  hypothetical protein  68.18 
 
 		 230 aa  256  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1926  hypothetical protein  67.61 
 
 		 258 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0961  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  68.64 
 
 		 230 aa  248  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3234  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  61.63 
 
 		 216 aa  224  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0094  LolA family protein  44.5 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  45.14 
 
 		 339 aa  155  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296297  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0084  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  45.14 
 
 		 258 aa  153  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0818275 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0134  hypothetical protein  42.86 
 
 		 257 aa  151  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0443  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  42.86 
 
 		 315 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4909  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  42.46 
 
 		 313 aa  143  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.296324  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2892  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  41.67 
 
 		 332 aa  142  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0378  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  41.71 
 
 		 317 aa  141  7e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0277  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  44.57 
 
 		 280 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.012946  normal  0.130604 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0445  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  38.86 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0961015  normal  0.0287558 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1840  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  38.95 
 
 		 312 aa  136  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0335702  normal  0.659808 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4033  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  38.14 
 
 		 315 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0396564 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4403  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  38.14 
 
 		 315 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.271262  normal  0.226597 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3748  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  40.68 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0297901  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4515  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  37.63 
 
 		 314 aa  132  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal  0.254845 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1299  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  38.29 
 
 		 243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0329  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36 
 
 		 227 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014302 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0283  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  42.59 
 
 		 313 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111335  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2946  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.54 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.879784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0417  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.65 
 
 		 206 aa  98.6  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00656484  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5008  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.92 
 
 		 212 aa  95.5  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3116  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.62 
 
 		 223 aa  92.4  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0146  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.16 
 
 		 212 aa  92  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.193487 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1497  putative outer membrane lipoprotein carrier protein  32.16 
 
 		 212 aa  92  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0429  twin-arginine translocation pathway signal  31.9 
 
 		 203 aa  91.7  8e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3698  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.91 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2541  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.27 
 
 		 207 aa  91.3  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423269  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2901  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.16 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.568097 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2670  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.26 
 
 		 206 aa  88.6  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.18 
 
 		 198 aa  86.3  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.560514  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3189  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.82 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0058  outer membrane lipoprotein carrier protein  29.11 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000236321 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0061  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.66 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0207527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2594  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.73 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30310  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.73 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1783  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.56 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1394  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.93 
 
 		 208 aa  51.6  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2387  outer-membrane lipoprotein carrier protein  22.61 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0116989 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1711  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.87 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.113541  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1053  hypothetical protein  23.14 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0568151  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3407  outer-membrane lipoprotein carrier protein  24.06 
 
 		 211 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.315594 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4003  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.13 
 
 		 228 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0440839  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1830  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.13 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153108 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.53 
 
 		 223 aa  46.2  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.632485  normal  0.483182 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0846  hypothetical protein  19.89 
 
 		 193 aa  46.2  0.0004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1160  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.56 
 
 		 227 aa  46.2  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0682728 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3608  outer-membrane lipoprotein carrier protein  24.86 
 
 		 207 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1549  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.24 
 
 		 216 aa  45.1  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483652  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2435  outer-membrane lipoprotein carrier protein  28.16 
 
 		 210 aa  45.1  0.0009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.699017  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0757  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.25 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000775377 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0348  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  21.65 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0765  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.09 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0575497  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2658  hypothetical protein  24.28 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1281  outer-membrane lipoproteins carrier protein  27.2 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.866532  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1342  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.2 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0119  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.56 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.256615  normal  0.030366 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28210  outer-membrane lipoprotein carrier protein  21.79 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372853  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1296  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.03 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.435605 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5362  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.4 
 
 		 211 aa  42.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0547  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.75 
 
 		 230 aa  42  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.117593  hitchhiker  0.000046415 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0377  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA, putative  22.75 
 
 		 230 aa  42  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.365354  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1125  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.38 
 
 		 205 aa  42  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.437749 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>