More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1907 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1907  response regulator receiver modulated CheW protein  100 
 
 
314 aa  625  1e-178  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06152  chemotaxis protein  86.31 
 
 
314 aa  541  1e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000739527  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01014  chemotaxis protein  86.31 
 
 
314 aa  541  1e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347371  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1068  putative CheW protein  47.56 
 
 
309 aa  299  3e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  normal  0.0302452 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  48.53 
 
 
310 aa  293  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20750  putative chemotaxis protein  50.16 
 
 
310 aa  292  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3486  response regulator receiver:CheW-like protein  47.56 
 
 
308 aa  291  8e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1781  putative chemotaxis protein  50.16 
 
 
310 aa  291  9e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  49.03 
 
 
309 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3089  response regulator receiver modulated CheW protein  50 
 
 
306 aa  291  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1927  chemotaxis protein CheV, putative  47.56 
 
 
308 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203525  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  47.8 
 
 
309 aa  289  5e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1794  chemotaxis protein CheV  48.84 
 
 
308 aa  288  8e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  47.48 
 
 
309 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2340  chemotaxis protein methyltransferase CheV  49.16 
 
 
306 aa  287  1e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  47.48 
 
 
309 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2215  putative chemotaxis protein  48.05 
 
 
316 aa  287  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1474  chemotaxis protein CheV  48.05 
 
 
309 aa  285  5e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  48.85 
 
 
308 aa  285  5e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1431  response regulator receiver modulated CheW protein  47.56 
 
 
313 aa  286  5e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  49.49 
 
 
306 aa  284  1e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  49.49 
 
 
306 aa  285  1e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  48.82 
 
 
306 aa  284  2e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1159  response regulator receiver modulated CheW protein  49.16 
 
 
306 aa  283  2e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.601808  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  48.82 
 
 
306 aa  284  2e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  48.82 
 
 
306 aa  284  2e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  48.82 
 
 
306 aa  283  2e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  48.82 
 
 
306 aa  284  2e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1338  response regulator receiver modulated CheW protein  48.82 
 
 
306 aa  283  2e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1595  response regulator receiver modulated CheW protein  48.48 
 
 
307 aa  283  3e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2599  putative CheW protein  48.48 
 
 
306 aa  283  4e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  49.35 
 
 
308 aa  282  4e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1343  response regulator receiver modulated CheW protein  48.48 
 
 
306 aa  283  4e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447173  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  49.16 
 
 
306 aa  282  5e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0522  putative CheW protein  48.37 
 
 
311 aa  279  5e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3612  putative CheW protein  48.86 
 
 
311 aa  278  6e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296716  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2128  chemotaxis protein CheV  48.86 
 
 
311 aa  278  6e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  47.81 
 
 
306 aa  278  7e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0891  response regulator receiver modulated CheW protein  48.24 
 
 
312 aa  278  1e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.875715  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2344  response regulator receiver modulated CheW protein  47.13 
 
 
314 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2320  chemotaxis protein CheV  48.48 
 
 
306 aa  276  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.698234  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1989  chemotaxis protein CheV  46.82 
 
 
314 aa  276  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2032  chemotaxis protein CheV  49.05 
 
 
338 aa  277  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00977151  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1670  response regulator receiver modulated CheW protein  48.86 
 
 
311 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.75876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3524  chemotaxis protein CheV, putative  48.05 
 
 
308 aa  275  5e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010446  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2462  response regulator receiver modulated CheW protein  46.82 
 
 
314 aa  276  5e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0985134  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1215  response regulator receiver modulated CheW protein  46.54 
 
 
310 aa  276  5e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.186708  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1646  response regulator receiver modulated CheW protein  48.53 
 
 
311 aa  275  5e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2852  putative CheW protein  49.19 
 
 
310 aa  275  5e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.141391 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2272  response regulator receiver modulated CheW protein  46.82 
 
 
314 aa  274  1e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.740501  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1476  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  45.4 
 
 
324 aa  273  2e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3297  response regulator receiver:CheW-like protein  48.05 
 
 
308 aa  274  2e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.307395  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3954  CheW protein  47.88 
 
 
311 aa  273  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2144  CheW-like protein  46.96 
 
 
313 aa  272  6e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00213305  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1752  response regulator receiver modulated CheW protein  45.22 
 
 
314 aa  271  9e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1176  putative CheW protein  48.2 
 
 
309 aa  271  9e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.531119  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  45.22 
 
 
314 aa  271  9e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.404736  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2594  putative CheW protein  45.22 
 
 
314 aa  271  9e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0125388  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2213  putative CheW protein  45.95 
 
 
311 aa  271  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2633  putative CheW protein  45.22 
 
 
314 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0317026  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1572  CheW protein  46.58 
 
 
310 aa  270  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2319  putative CheW protein  45.54 
 
 
314 aa  269  4e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00776156  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2678  response regulator receiver modulated CheW protein  45.69 
 
 
312 aa  268  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0199239  normal  0.361965 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2316  response regulator receiver modulated CheW protein  45.69 
 
 
313 aa  266  3e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90141  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  45.33 
 
 
306 aa  266  4e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.262439  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003013  chemotaxis protein CheV  44.73 
 
 
317 aa  262  7e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0231  chemotaxis protein CheV  45.54 
 
 
313 aa  260  2e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02869  hypothetical protein  44.09 
 
 
313 aa  259  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1944  response regulator receiver modulated CheW protein  45.19 
 
 
314 aa  259  5e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  2.11383e-06  normal  0.0128896 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2144  response regulator receiver modulated CheW protein  44.37 
 
 
317 aa  258  9e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  6.7765e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1592  chemotaxis protein CheV  45.05 
 
 
314 aa  258  1e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01327  chemotaxis protein CheV  43.75 
 
 
319 aa  257  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.750704  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  46.96 
 
 
309 aa  255  6e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1063  putative CheW protein  44.52 
 
 
307 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1901  response regulator receiver modulated CheW protein  46.79 
 
 
314 aa  248  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0980501  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02930  chemotaxis protein  43.5 
 
 
248 aa  206  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.464973  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2185  putative CheW protein  40.96 
 
 
297 aa  201  1e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0845954  normal  0.0210169 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0734  response regulator receiver:CheW-like protein  36.36 
 
 
322 aa  198  9e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3224  response regulator receiver modulated CheW protein  38.92 
 
 
319 aa  195  8e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3225  response regulator receiver modulated CheW protein  37.35 
 
 
322 aa  192  6e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185014  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0735  response regulator receiver:CheW-like protein  38.46 
 
 
311 aa  189  5e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0841  response regulator receiver modulated CheW protein  37.94 
 
 
299 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03881  putative response regulator transcription regulator protein  37.74 
 
 
313 aa  186  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.59764 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3501  response regulator receiver modulated CheW protein  36.51 
 
 
316 aa  185  7e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.598076 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4573  response regulator receiver modulated CheW protein  36.51 
 
 
316 aa  185  7e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.639433 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0826  putative CheW protein  37.62 
 
 
299 aa  184  1e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449083  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1747  response regulator receiver modulated CheW protein  37.28 
 
 
298 aa  183  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999043 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0802  chemotaxis protein CheV  38.03 
 
 
299 aa  183  4e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1323  chemotaxis protein CheV, putative  37.74 
 
 
314 aa  182  7e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4985  response regulator receiver:CheW-like protein  37.9 
 
 
318 aa  182  8e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1139  response regulator receiver:CheW-like protein  38.98 
 
 
298 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.455632 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1457  response regulator receiver modulated CheW protein  34.11 
 
 
314 aa  180  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2493  putative CheW protein  36.24 
 
 
299 aa  180  3e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4654  CheW protein  38.72 
 
 
300 aa  179  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2899  response regulator receiver modulated CheW protein  35.44 
 
 
295 aa  179  5e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.715975  hitchhiker  0.00931868 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2364  response regulator receiver modulated CheW protein  33.9 
 
 
297 aa  179  6e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1598  CheW protein  38.44 
 
 
317 aa  178  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874814  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2936  putative CheW protein  35.44 
 
 
298 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.243491 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2796  putative CheW protein  35.44 
 
 
298 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1561  response regulator receiver modulated CheW protein  35.44 
 
 
298 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0294399  hitchhiker  0.00399966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>