More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5100 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5100  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  100 
 
 
166 aa  343  5e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4086  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  69.28 
 
 
166 aa  251  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4080  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  50.6 
 
 
170 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.352325  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7017  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  47.27 
 
 
173 aa  177  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1380  NADH dehydrogenase I chain C  46.99 
 
 
175 aa  167  7e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0753299  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1244  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  48.8 
 
 
173 aa  166  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2422  NADH dehydrogenase subunit C  43.15 
 
 
202 aa  124  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3621  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.66 
 
 
182 aa  122  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0522  NADH dehydrogenase subunit C  41.22 
 
 
250 aa  121  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2834  NADH dehydrogenase subunit C  40.14 
 
 
214 aa  119  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal  0.125217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0283  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  43.09 
 
 
229 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4483  NADH dehydrogenase subunit C  43.2 
 
 
226 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00208368 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2248  NADH dehydrogenase subunit C  49.18 
 
 
208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0117858  normal  0.111894 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1309  NADH dehydrogenase subunit C  45.21 
 
 
215 aa  119  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.163344  normal  0.0849556 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1017  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.07 
 
 
219 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1083  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.38 
 
 
219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3227  NADH dehydrogenase subunit C  37.66 
 
 
240 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.754321  normal  0.0249404 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1212  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.38 
 
 
219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0340  NADH dehydrogenase I, C subunit  36.31 
 
 
162 aa  115  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0804  NADH dehydrogenase subunit C  40.41 
 
 
202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.215567  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0799  NADH dehydrogenase subunit C  40.41 
 
 
202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.557773  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4128  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.55 
 
 
215 aa  114  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5055  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  39.84 
 
 
246 aa  114  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1883  NADH dehydrogenase subunit C  43.2 
 
 
225 aa  114  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3170  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  39.84 
 
 
236 aa  113  8.999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3224  NADH dehydrogenase subunit C  39.73 
 
 
200 aa  113  8.999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0405196  normal  0.943012 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1353  NADH dehydrogenase subunit C  40 
 
 
200 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4561  NADH dehydrogenase subunit C  38.36 
 
 
201 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5798  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  39.73 
 
 
205 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323776  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4631  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  45.08 
 
 
209 aa  112  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.247115 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4416  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  39.42 
 
 
248 aa  111  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13168  NADH dehydrogenase subunit C  40.8 
 
 
236 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74163  NADH-ubiquinone oxidoreductase 30.4 kDa subunit, mitochondrial precursor  43.55 
 
 
281 aa  111  4.0000000000000004e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0353139  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2058  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.1 
 
 
215 aa  111  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.313982 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1548  NADH dehydrogenase subunit C  41.6 
 
 
231 aa  111  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.559128  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1578  NADH dehydrogenase subunit C  41.6 
 
 
231 aa  111  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1602  NADH dehydrogenase subunit C  41.6 
 
 
231 aa  111  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.949933  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2714  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  34.42 
 
 
309 aa  111  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4242  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.74 
 
 
164 aa  110  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000475487  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3353  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.77 
 
 
162 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000103894  normal  0.0125346 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2402  NADH dehydrogenase subunit C  37.67 
 
 
199 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0037532 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0743  NADH dehydrogenase subunit C  42.54 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3136  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.42 
 
 
162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000631094  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1886  NADH dehydrogenase subunit C  36.73 
 
 
206 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.585114 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1357  NADH dehydrogenase subunit C  39.72 
 
 
200 aa  108  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.357714  normal  0.0381949 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0471  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  39.02 
 
 
283 aa  108  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.665178  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1714  NADH dehydrogenase subunit C  42.28 
 
 
200 aa  108  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4392  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.07 
 
 
215 aa  108  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.165622  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2693  NADH dehydrogenase subunit C  38.21 
 
 
252 aa  107  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0399  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40 
 
 
227 aa  108  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6680  NADH dehydrogenase subunit C  38.46 
 
 
252 aa  107  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4556  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  39.23 
 
 
245 aa  107  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1024  NADH dehydrogenase subunit C  41.78 
 
 
200 aa  107  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7689  NADH dehydrogenase subunit C  39.84 
 
 
235 aa  107  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.800892  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2154  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.67 
 
 
230 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.818422  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3298  NADH dehydrogenase subunit C  36.55 
 
 
204 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0890  NADH dehydrogenase subunit C  37.67 
 
 
201 aa  106  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31158  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0586  NADH:ubiquinone oxidoreductase 27 kD subunit- like protein  34.69 
 
 
225 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1176  NADH dehydrogenase subunit C  45.9 
 
 
200 aa  106  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.410937  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2514  NADH dehydrogenase subunit C  45.9 
 
 
200 aa  106  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1542  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.09 
 
 
179 aa  106  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0780  NADH dehydrogenase subunit C  36.3 
 
 
205 aa  106  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.575172  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1261  NADH dehydrogenase subunit C  37.93 
 
 
200 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.841588  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2219  NADH dehydrogenase subunit C  35.37 
 
 
206 aa  105  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534462  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03360  NADH-ubiquinone oxidoreductase 30.4 kDa subunit, putative  38.85 
 
 
284 aa  105  3e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2628  NADH-quinone oxidoreductase, C subunit  36.53 
 
 
202 aa  104  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.972938  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2255  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.53 
 
 
202 aa  104  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000967355 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10229  NADH-ubiquinone oxidoreductase 30.4 kDa subunit, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  38 
 
 
290 aa  104  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.048814  normal  0.463288 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2005  NADH dehydrogenase subunit C  44.26 
 
 
200 aa  104  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4008  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.31 
 
 
161 aa  104  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6243400000000003e-29 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2885  NADH dehydrogenase subunit C  39.68 
 
 
204 aa  104  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.419864  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1125  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  37.09 
 
 
593 aa  104  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.64928  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2059  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  33.33 
 
 
197 aa  104  7e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2920  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.89 
 
 
204 aa  104  7e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1171  NADH dehydrogenase subunit C  41.8 
 
 
207 aa  103  8e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1314  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.27 
 
 
165 aa  103  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02211  NADH:ubiquinone oxidoreductase, chain C,D  43.9 
 
 
600 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1371  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.9 
 
 
600 aa  103  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0159293  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2435  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  43.9 
 
 
600 aa  103  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2579  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  43.9 
 
 
600 aa  103  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.144655  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1366  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  43.9 
 
 
600 aa  103  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2662  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  43.9 
 
 
600 aa  103  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0464288  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2440  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  43.9 
 
 
600 aa  103  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3425  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  43.9 
 
 
600 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.022536  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3924  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.31 
 
 
161 aa  103  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0146493  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1287  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.16 
 
 
190 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.420943  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02171  hypothetical protein  43.9 
 
 
600 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1405  NADH dehydrogenase (quinone)  38.64 
 
 
203 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.167025  normal  0.820267 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1093  NADH dehydrogenase subunit C  36.08 
 
 
205 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2574  NADH dehydrogenase subunit C  34.69 
 
 
204 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0228869  normal  0.121819 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1503  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.31 
 
 
199 aa  102  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00949077 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1292  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.06 
 
 
174 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.232426  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2573  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.49 
 
 
196 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0269  NADH dehydrogenase subunit C  39.84 
 
 
192 aa  102  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.148576  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3676  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.2 
 
 
174 aa  101  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00982408 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1494  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  36.36 
 
 
599 aa  101  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0962881  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1144  NADH dehydrogenase subunit C  33.76 
 
 
200 aa  101  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0133265  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1376  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.49 
 
 
196 aa  101  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.842396  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1275  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.49 
 
 
196 aa  101  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6092  NADH dehydrogenase subunit C  34.51 
 
 
229 aa  101  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0251678 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>