152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_21370 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_21370  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  374  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283174  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2330  BioY protein  59.16 
 
 		 196 aa  188  4e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0901  BioY protein  51.24 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  47.94 
 
 		 191 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3005  BioY protein  46.03 
 
 		 200 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.312874  normal  0.884214 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  40.93 
 
 		 197 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4638  BioY protein  50.65 
 
 		 203 aa  122  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  41.54 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  38.71 
 
 		 197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  45.62 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  42.37 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  47.67 
 
 		 192 aa  114  6.9999999999999995e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  44.22 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1123  BioY protein  43.43 
 
 		 197 aa  112  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.432616  normal  0.483731 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  40.51 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4207  BioY protein  48.33 
 
 		 195 aa  108  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8405  BioY family protein  41.62 
 
 		 189 aa  104  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  44.65 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  42.86 
 
 		 206 aa  102  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3745  BioY protein  32.95 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421582  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2445  BioY protein  45.36 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000283482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2356  BioY protein  45.83 
 
 		 200 aa  97.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0144  BioY protein  40.31 
 
 		 200 aa  94.4  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  46.06 
 
 		 189 aa  88.6  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2134  putative BioY protein  37.16 
 
 		 197 aa  87.8  9e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  39.73 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  34.62 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  37.18 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  36.03 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  32.21 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0995  BioY protein  32.45 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0776  BioY protein  36.42 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.656127  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0638  BioY family protein  34.08 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.532905  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3444  BioY protein  32.34 
 
 		 181 aa  74.7  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  39.29 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_967  biotin biosynthesis protein BioY  31.38 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000844147  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0506  BioY family protein  33.51 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.529292  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  35.57 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0509  BioY family protein  33.51 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  37.11 
 
 		 169 aa  72  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0693  BioY protein  35.67 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  33.54 
 
 		 184 aa  72  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  40.25 
 
 		 191 aa  72  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  36.59 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  35.09 
 
 		 195 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  37.06 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  35.71 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1719  BioY family protein  35.61 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1662  BioY family protein  35.61 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3349  BioY protein  37.06 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  34.75 
 
 		 191 aa  67  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  34.04 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  33.33 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  35.37 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  39.57 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  35.54 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0169  BioY protein  33.75 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989963  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3011  BioY protein  37.5 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131178  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  36.8 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  32.89 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3107  Na+/H+ antiporter  34.97 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1184  BioY family protein  31.72 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000330178  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  49.35 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000326686  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  38.51 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  33.87 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0398  BioY family protein  35.92 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000949175  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  38.41 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  36.96 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3737  bioY family protein  34.01 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.776545  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  29.52 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000463296  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3331  bioY family protein  33.33 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000423922  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  36.24 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3640  bioY family protein  33.33 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  34.94 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3659  bioY family protein  32.65 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00282906  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  30.63 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  36.71 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  32.65 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0498  BioY protein  37.58 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.583343 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2911  BioY protein  40.48 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1732  BioY protein  33.76 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  38.51 
 
 		 180 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1704  BioY protein  28.65 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00848972  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2875  BioY protein  33.01 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000912957  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  30.19 
 
 		 169 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  33.33 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  30.19 
 
 		 169 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1681  BioY protein  40.71 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  30.73 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3420  bioY family protein  31.91 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000218504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3381  bioY family protein  31.91 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.96357e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3689  bioY family protein  31.91 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000593466  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3020  BioY protein  35.92 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  33.88 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  34.25 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1953  hypothetical protein  31.29 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.327178  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2947  BioY protein  29.7 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000305792  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1529  BioY protein  36.11 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  33.09 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  35.48 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.014299 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>