70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0970 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_0970  hypothetical protein  100 
 
 
377 aa  769    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0284438  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0316  hypothetical protein  51.52 
 
 
399 aa  333  4e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0057  protein of unknown function DUF262  38.15 
 
 
341 aa  172  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2180  hypothetical protein  29.27 
 
 
422 aa  151  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.912338  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1500  protein of unknown function DUF262  28.03 
 
 
377 aa  136  6.0000000000000005e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4216  hypothetical protein  34.85 
 
 
390 aa  133  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0600221  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28245  predicted protein  32.89 
 
 
470 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3592  hypothetical protein  28.27 
 
 
402 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3053  hypothetical protein  30.34 
 
 
386 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  0.0469245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5531  hypothetical protein  28.15 
 
 
390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6233  protein of unknown function DUF262  29.14 
 
 
406 aa  116  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0601  hypothetical protein  27.21 
 
 
375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252439  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0397  hypothetical protein  27.21 
 
 
375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747895  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0064  hypothetical protein  25.21 
 
 
371 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4224  protein of unknown function DUF262  26.45 
 
 
389 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2955  hypothetical protein  25.99 
 
 
349 aa  104  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3373  hypothetical protein  34.2 
 
 
353 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2583  protein of unknown function DUF262  28.81 
 
 
345 aa  101  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.521519  normal  0.265896 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1028  hypothetical protein  35.57 
 
 
638 aa  100  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4642  hypothetical protein  28.73 
 
 
396 aa  99.8  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0278  hypothetical protein  26.97 
 
 
397 aa  99.8  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101516 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0608  hypothetical protein  31.13 
 
 
366 aa  97.8  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0134  hypothetical protein  26.62 
 
 
375 aa  97.4  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50837  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1461  hypothetical protein  24.86 
 
 
375 aa  95.9  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.743576  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2494  hypothetical protein  27.35 
 
 
375 aa  95.5  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0036317  normal  0.931696 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0765  hypothetical protein  26.79 
 
 
617 aa  95.9  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.390072  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2372  protein of unknown function DUF262  26.42 
 
 
378 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0794  hypothetical protein  23.86 
 
 
354 aa  95.9  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3547  hypothetical protein  30.15 
 
 
458 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0722197 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2969  protein of unknown function DUF262  27.01 
 
 
392 aa  93.6  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.901235  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001832  hypothetical protein  29.85 
 
 
539 aa  92.4  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3506  protein of unknown function DUF262  25.47 
 
 
370 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2610  protein of unknown function DUF262  25.47 
 
 
370 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.639774  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0643  protein of unknown function DUF262  26.09 
 
 
374 aa  90.1  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1427  protein of unknown function DUF262  29.12 
 
 
399 aa  89.7  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4676  hypothetical protein  29.21 
 
 
369 aa  89.7  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2954  protein of unknown function DUF262  27.72 
 
 
379 aa  89.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1156  protein of unknown function DUF262  27.97 
 
 
409 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3409  protein of unknown function DUF262  30.5 
 
 
368 aa  86.7  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0706  hypothetical protein  29.91 
 
 
370 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01779  hypothetical protein  30.48 
 
 
650 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2195  hypothetical protein  25.68 
 
 
391 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175958  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4975  hypothetical protein  26.8 
 
 
394 aa  76.6  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3484  protein of unknown function DUF262  31.58 
 
 
344 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2248  hypothetical protein  26.98 
 
 
343 aa  72.8  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0486494 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2619  protein of unknown function DUF262  30.26 
 
 
343 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0682  hypothetical protein  24 
 
 
367 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000252163 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2977  hypothetical protein  29.53 
 
 
349 aa  67  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.197913  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1797  hypothetical protein  26.52 
 
 
375 aa  65.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1629  hypothetical protein  24.58 
 
 
365 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2539  protein of unknown function DUF262  30.57 
 
 
405 aa  65.1  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000210562  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3517  protein of unknown function DUF262  36.25 
 
 
159 aa  63.2  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161235  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1158  HNH endonuclease  25.97 
 
 
360 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.161614  normal  0.0199852 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0645  hypothetical protein  27.78 
 
 
330 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17227  hitchhiker  0.000000224938 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2554  hypothetical protein  24.84 
 
 
368 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118621  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0063  hypothetical protein  25.15 
 
 
363 aa  62  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0746  hypothetical protein  25.51 
 
 
320 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5280  protein of unknown function DUF262  28.74 
 
 
353 aa  53.9  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2200  protein of unknown function DUF262  24.05 
 
 
589 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.294339 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3603  hypothetical protein  30.85 
 
 
570 aa  47.8  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.136498  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2734  Protein of unknown function DUF2081  28.87 
 
 
753 aa  46.6  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1061  hypothetical protein  30.68 
 
 
575 aa  46.6  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3179  protein of unknown function DUF262  29.89 
 
 
575 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0065  hypothetical protein  26.8 
 
 
760 aa  45.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4280  hypothetical protein  28.38 
 
 
388 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1804  hypothetical protein  27.96 
 
 
584 aa  45.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3198  hypothetical protein  38.46 
 
 
390 aa  45.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0809  hypothetical protein  26.04 
 
 
754 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0825  hypothetical protein  26.04 
 
 
754 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2208  hypothetical protein  31.82 
 
 
432 aa  43.5  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.511265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>