More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2352 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  100 
 
 		 612 aa  1226    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  46.38 
 
 		 602 aa  497  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2452  Cl- channel voltage-gated family protein  46.13 
 
 		 603 aa  481  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  47.21 
 
 		 606 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2453  Cl- channel voltage-gated family protein  45.86 
 
 		 605 aa  434  1e-120  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  43.79 
 
 		 625 aa  429  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1761  Chloride channel core  46.44 
 
 		 605 aa  427  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2485  Cl- channel, voltage-gated family protein  45.8 
 
 		 603 aa  412  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2971  Chloride channel core  43.47 
 
 		 605 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2495  Cl- channel voltage-gated family protein  40.6 
 
 		 651 aa  398  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.575116 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  40.28 
 
 		 580 aa  389  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  40.42 
 
 		 754 aa  384  1e-105  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  39.07 
 
 		 598 aa  383  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  38.36 
 
 		 586 aa  347  5e-94  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.406579 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  42.7 
 
 		 462 aa  337  2.9999999999999997e-91  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1431  Chloride channel core  40.8 
 
 		 605 aa  319  1e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0939  Cl- channel voltage-gated family protein  36.08 
 
 		 582 aa  312  1e-83  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.564922  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0928  Cl- channel, voltage-gated family protein  37.13 
 
 		 612 aa  290  5.0000000000000004e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.453543  hitchhiker  0.000208416 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1543  Cl- channel, voltage-gated family protein  37.84 
 
 		 582 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.445538 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0357  Cl- channel, voltage-gated family protein  36.54 
 
 		 588 aa  280  6e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1071  hypothetical protein  41.53 
 
 		 457 aa  277  3e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  33.8 
 
 		 614 aa  273  6e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  36.29 
 
 		 608 aa  273  7e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2504  Chloride channel core  37.02 
 
 		 634 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.244911  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2417  chloride channel core protein  36.66 
 
 		 612 aa  266  8.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  32.11 
 
 		 613 aa  265  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1443  Cl- channel, voltage gated  35.19 
 
 		 638 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.52 
 
 		 582 aa  263  6.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2595  Cl- channel, voltage gated  42.65 
 
 		 544 aa  259  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.4857  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  36.7 
 
 		 615 aa  256  9e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  35.27 
 
 		 577 aa  254  3e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  34.73 
 
 		 597 aa  252  2e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  31.55 
 
 		 669 aa  249  9e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  33.93 
 
 		 569 aa  239  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1039  Chloride channel core  40.13 
 
 		 453 aa  235  2.0000000000000002e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  34.95 
 
 		 600 aa  233  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2388  chloride channel core  40.13 
 
 		 650 aa  227  4e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.360488 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  36.29 
 
 		 470 aa  227  4e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  37.28 
 
 		 402 aa  225  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  29.17 
 
 		 631 aa  219  7.999999999999999e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  31.87 
 
 		 627 aa  217  5e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  32.83 
 
 		 593 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10144  transmembrane protein  39.78 
 
 		 492 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  33.52 
 
 		 626 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  33.28 
 
 		 584 aa  211  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  37.1 
 
 		 587 aa  209  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  32.45 
 
 		 627 aa  206  8e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.61 
 
 		 620 aa  206  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  28.38 
 
 		 613 aa  203  7e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.05 
 
 		 577 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.57 
 
 		 591 aa  201  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.45 
 
 		 598 aa  201  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  33.33 
 
 		 590 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.37 
 
 		 591 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.52 
 
 		 636 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.52 
 
 		 579 aa  196  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.52 
 
 		 579 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.52 
 
 		 579 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.33 
 
 		 594 aa  194  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  29.59 
 
 		 628 aa  194  6e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.32 
 
 		 628 aa  191  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  28.6 
 
 		 624 aa  187  5e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.1 
 
 		 593 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4536  Chloride channel core  31.79 
 
 		 603 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143283 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1241  Cl- channel, voltage-gated family protein  35.32 
 
 		 428 aa  183  6e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.730218 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.9 
 
 		 593 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6390  Chloride channel core  31.14 
 
 		 604 aa  181  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.315587  normal  0.638262 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.47 
 
 		 589 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  36.28 
 
 		 456 aa  180  7e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.61 
 
 		 589 aa  180  8e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.61 
 
 		 589 aa  180  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.25 
 
 		 589 aa  180  8e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.29 
 
 		 591 aa  177  4e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  28.08 
 
 		 603 aa  177  5e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  26.56 
 
 		 617 aa  176  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0493  Chloride channel core  29.82 
 
 		 598 aa  176  9.999999999999999e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5349  chloride channel core  30.66 
 
 		 605 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.791997 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  29.66 
 
 		 862 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3129  voltage-gated chloride channel  28.15 
 
 		 467 aa  169  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.831797  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2728  Chloride channel core  28.15 
 
 		 474 aa  169  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.969759  hitchhiker  0.00000000119016 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2094  Chloride channel core  30.81 
 
 		 603 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0525  Cl- channel voltage-gated family protein  28.14 
 
 		 579 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  29.94 
 
 		 629 aa  164  6e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0552  Chloride channel core  28.22 
 
 		 614 aa  164  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  30.57 
 
 		 863 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  30.99 
 
 		 640 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.51 
 
 		 575 aa  160  6e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5812  chloride channel core  31.49 
 
 		 634 aa  160  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00468888 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  29.77 
 
 		 579 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  33.41 
 
 		 473 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  28.76 
 
 		 859 aa  159  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  33.41 
 
 		 473 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  33.41 
 
 		 473 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  33.41 
 
 		 473 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.42 
 
 		 591 aa  158  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4402  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.44 
 
 		 598 aa  157  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0824696  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  33.18 
 
 		 473 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0315  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 609 aa  155  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3939  chloride channel core  28.85 
 
 		 600 aa  154  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5804  Chloride channel core  27.9 
 
 		 633 aa  154  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>