49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0527 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0527  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  603  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1107  helix-turn-helix domain protein  26.94 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4770  protein of unknown function DUF955  24.89 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.166779  hitchhiker  0.00150402 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1957  XRE family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 410 aa  65.9  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1588  hypothetical protein  30.04 
 
 		 390 aa  63.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0265  XRE family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2466  protein of unknown function DUF955  25.25 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000413379  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2671  protein of unknown function DUF955  28.12 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  23.71 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1805  XRE family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 396 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0389  hypothetical protein  25.27 
 
 		 393 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0725053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  26.19 
 
 		 346 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3835  protein of unknown function DUF955  26.4 
 
 		 370 aa  52.8  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  31.41 
 
 		 355 aa  52.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  26.54 
 
 		 367 aa  51.2  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3160  protein of unknown function DUF955  28.14 
 
 		 404 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.208418  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  35.54 
 
 		 182 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3885  hypothetical protein  32.62 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0992506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2853  helix-turn-helix domain protein  26.29 
 
 		 355 aa  50.4  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12537  hypothetical protein  28.17 
 
 		 415 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.9395e-37  hitchhiker  0.00258051 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1489  protein of unknown function DUF955  22.31 
 
 		 388 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  28.45 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  30.53 
 
 		 283 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  29.32 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4601  hypothetical protein  26.35 
 
 		 255 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4623  hypothetical protein  26.35 
 
 		 255 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2518  protein of unknown function DUF955  28.81 
 
 		 378 aa  47.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.010681 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1934  hypothetical protein  24.82 
 
 		 386 aa  47.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.671247  normal  0.125283 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3355  hypothetical protein  32 
 
 		 354 aa  47.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160143  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  24.69 
 
 		 367 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0095  protein of unknown function DUF955  22.62 
 
 		 273 aa  46.6  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  28.19 
 
 		 366 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  28.22 
 
 		 350 aa  46.6  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  26.45 
 
 		 362 aa  45.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  24.69 
 
 		 367 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3976  hypothetical protein  27.11 
 
 		 355 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0104  helix-turn-helix domain-containing protein  24.56 
 
 		 372 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0634562  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0609  protein of unknown function DUF955  28.21 
 
 		 454 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  28.05 
 
 		 174 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0188  hypothetical protein  26.58 
 
 		 383 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  24.73 
 
 		 355 aa  43.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2168  protein of unknown function DUF955  25.73 
 
 		 386 aa  43.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2309  hypothetical protein  24.55 
 
 		 241 aa  43.1  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.316951 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  30.3 
 
 		 156 aa  43.1  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  26.41 
 
 		 372 aa  42.7  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  25.99 
 
 		 347 aa  42.7  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  29.91 
 
 		 175 aa  42.7  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  26.22 
 
 		 349 aa  42.4  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  26.55 
 
 		 359 aa  42.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>