More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2362 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_1606  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  44.78 
 
 		 884 aa  712    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0732  type VI secretion ATPase  43.85 
 
 		 882 aa  694    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.759249  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0433  clpB protein, putative  45.27 
 
 		 875 aa  710    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2627  ATPase  53.39 
 
 		 865 aa  879    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5984  type VI secretion ATPase  48.52 
 
 		 909 aa  779    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3095  chaperone-associated ATPase, putative  53.27 
 
 		 878 aa  878    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.829668 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02051  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  49.23 
 
 		 910 aa  830    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3654  ClpA/B type protease  51.33 
 
 		 889 aa  860    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0054  ClpA/B type protease  50.86 
 
 		 897 aa  853    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.622723  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3906  type VI secretion ATPase  45.24 
 
 		 893 aa  696    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.356382 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6115  type VI secretion ATPase  45.64 
 
 		 906 aa  716    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.24944 
 
 
-
 
NC_003296  RS01959  putative CLPA/B-type chaperone protein  49.28 
 
 		 905 aa  833    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1102  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  42.68 
 
 		 911 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3147  ClpA/B type protease  51.33 
 
 		 889 aa  860    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2924  type VI secretion ATPase  49.55 
 
 		 889 aa  843    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2548  clpB protein, putative  42.45 
 
 		 867 aa  643    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.575234  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5425  clpB protein, putative  43.21 
 
 		 882 aa  667    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0408  type VI secretion ATPase  50.81 
 
 		 889 aa  841    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2830  ClpA/B type protease  50.86 
 
 		 897 aa  853    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0409  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  44.78 
 
 		 884 aa  712    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.834401  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0156  chaperone clpB  45.91 
 
 		 895 aa  722    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.102124  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3610  type VI secretion ATPase  43.29 
 
 		 875 aa  663    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0303  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  44.63 
 
 		 887 aa  708    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.649065  normal  0.656234 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4958  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:Clp, N terminal  53.85 
 
 		 867 aa  889    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3013  ATPase  49.32 
 
 		 887 aa  802    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2171  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  50.84 
 
 		 899 aa  857    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.203695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0298  ClpV1 family type VI secretion ATPase  44.86 
 
 		 879 aa  711    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.140659 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1727  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  47.95 
 
 		 898 aa  776    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.141687  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4084  type VI secretion ATPase  48.29 
 
 		 916 aa  782    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000202411 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5260  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:phosphopantetheine attachment site  43.19 
 
 		 913 aa  715    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3864  type VI secretion ATPase  45.75 
 
 		 928 aa  764    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00372415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2696  Clp ATPase  45.7 
 
 		 891 aa  709    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.310032  hitchhiker  0.00716242 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1713  ClpA/B type protease  51.33 
 
 		 889 aa  860    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0170  AAA family ATPase  43.33 
 
 		 882 aa  686    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000964396 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2331  ATPase  48.51 
 
 		 900 aa  784    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518917  normal  0.0250901 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3638  protease associated ATPase ClpB  51.33 
 
 		 889 aa  862    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1194  SciG protein  44.9 
 
 		 888 aa  719    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.445857  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1625  SciG protein  45.91 
 
 		 918 aa  724    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.398172  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4919  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  50.28 
 
 		 891 aa  829    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.989717  hitchhiker  0.00768481 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1205  ATPase  43.1 
 
 		 873 aa  692    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.394277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3412  ClpA/B-type protease  48.93 
 
 		 846 aa  715    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.219119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3129  ClpA/ClpB family protein  44.01 
 
 		 881 aa  689    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5584  ClpB protein, putative  42.79 
 
 		 885 aa  662    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3474  hypothetical protein  45.85 
 
 		 889 aa  716    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2820  heat shock protein ClpB-like  45.23 
 
 		 899 aa  717    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3565  chaperonin clpA/B/, ATPase  49.89 
 
 		 889 aa  852    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2890  type VI secretion ATPase  47.59 
 
 		 849 aa  700    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0979  AAA ATPase, Clp  44.9 
 
 		 893 aa  717    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1582  AAA ATPase, Clp  45.52 
 
 		 887 aa  726    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.385377 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0178  chaperone clpB  45.79 
 
 		 895 aa  719    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2769  type VI secretion ATPase  53.27 
 
 		 865 aa  886    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186875  normal  0.804579 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3315  AAA ATPase  47 
 
 		 878 aa  709    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0942  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  44.44 
 
 		 906 aa  703    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2505  AAA family ATPase  44.06 
 
 		 880 aa  689    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0140  ClpA/B type protease  46.04 
 
 		 918 aa  720    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0264  ClpA/B type protease  44.82 
 
 		 885 aa  712    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00259  ClpB  47.28 
 
 		 901 aa  744    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388989  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2505  type VI secretion ATPase  53.77 
 
 		 865 aa  907    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2958  ClpA/B type protease  50.69 
 
 		 887 aa  854    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2520  type VI secretion ATPase  44.77 
 
 		 863 aa  712    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3023  ATPase AAA-2  44.61 
 
 		 864 aa  669    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.825053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3255  type VI secretion ATPase  43.63 
 
 		 884 aa  671    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1536  fibronectin, type III  53.82 
 
 		 897 aa  908    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0310  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  44.86 
 
 		 879 aa  711    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2096  putative ClpA/B-type chaperone, ATPase subunit ClpB, heat shock protein  44.48 
 
 		 916 aa  696    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0451  type VI secretion ATPase  50.46 
 
 		 889 aa  843    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2954  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  44.9 
 
 		 888 aa  716    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.400792  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2273  ATPase AAA-2  50.28 
 
 		 889 aa  851    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0097  ATPase  43.71 
 
 		 866 aa  651    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0618  ATPase AAA-2  44 
 
 		 893 aa  727    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0224161 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3008  type VI secretion ATPase  44.38 
 
 		 887 aa  693    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.694327 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3644  type VI secretion ATPase  44.12 
 
 		 902 aa  688    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.9184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05872  ClpA/B type protease  45.36 
 
 		 894 aa  764    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2632  ATPase AAA-2  55.3 
 
 		 681 aa  709    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2982  AAA family ATPase  43.69 
 
 		 880 aa  691    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00017738 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3069  ATPase  55.29 
 
 		 882 aa  946    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0021  clpB protein  44.6 
 
 		 869 aa  694    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0295  ATPase  44.86 
 
 		 879 aa  712    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.878276 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6693  type VI secretion ATPase  44.27 
 
 		 889 aa  703    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.348234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3118  ATPase  45.73 
 
 		 889 aa  730    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0362166 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0162  type VI secretion ATPase  48.11 
 
 		 902 aa  811    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.475088  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0322  type VI secretion ATPase  42.66 
 
 		 867 aa  647    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2362  ATPase  100 
 
 		 868 aa  1785    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.488644  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0387  ATPase  50.93 
 
 		 889 aa  850    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.315602  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0395  type VI secretion ATPase  42.55 
 
 		 867 aa  643    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3473  ATPase  45.8 
 
 		 897 aa  723    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.150348  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01100  putative ClpA/B-type chaperone  47.94 
 
 		 902 aa  810    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33990  putative ClpA/B-type protease  48.76 
 
 		 849 aa  704    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000016123  normal  0.0826946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42980  putative ClpA/B-type protease  43.53 
 
 		 877 aa  671    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172523  normal  0.0852173 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0459  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  44.78 
 
 		 884 aa  711    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0473  ATPase  50.46 
 
 		 889 aa  843    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0804  type VI secretion ATPase  43.47 
 
 		 880 aa  688    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.493869  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3629  ClpA/B type protease  51.33 
 
 		 889 aa  862    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2829  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  45.01 
 
 		 888 aa  718    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1474  type VI secretion ATPase  45.93 
 
 		 885 aa  716    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2440  ATPase  45.95 
 
 		 915 aa  712    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.217736  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1789  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  44.78 
 
 		 884 aa  712    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0160275  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1362  Clp protease-associated protein ClpB  45.93 
 
 		 885 aa  716    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1789  ATPase  44.48 
 
 		 884 aa  724    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3724  ATPase  43.24 
 
 		 895 aa  706    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.154192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>