More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1293 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  75.12 
 
 		 648 aa  950    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  73.12 
 
 		 648 aa  926    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  74.81 
 
 		 648 aa  959    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  71.2 
 
 		 648 aa  872    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  70.62 
 
 		 649 aa  918    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  71.27 
 
 		 649 aa  919    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  69.77 
 
 		 653 aa  893    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  80 
 
 		 649 aa  1035    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  71.43 
 
 		 649 aa  932    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  74.35 
 
 		 648 aa  929    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  74.35 
 
 		 648 aa  929    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  100 
 
 		 650 aa  1300    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  75.27 
 
 		 648 aa  967    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  73.23 
 
 		 648 aa  928    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  75.12 
 
 		 648 aa  964    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  47.8 
 
 		 657 aa  597  1e-169  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  44.56 
 
 		 720 aa  560  1e-158  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  44.01 
 
 		 654 aa  504  1e-141  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1593  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  42.94 
 
 		 655 aa  494  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  36.82 
 
 		 662 aa  465  1e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4238  sodium/hydrogen exchanger  41.55 
 
 		 656 aa  445  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  40.09 
 
 		 660 aa  441  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  40 
 
 		 660 aa  441  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  40.81 
 
 		 661 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  41.06 
 
 		 674 aa  441  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  40.81 
 
 		 661 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000235169 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  39.7 
 
 		 659 aa  438  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  39.28 
 
 		 652 aa  433  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  40.6 
 
 		 661 aa  431  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  40.47 
 
 		 668 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3810  sodium/hydrogen exchanger family protein  39.97 
 
 		 680 aa  422  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.162531 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  39.06 
 
 		 666 aa  421  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0296  sodium/hydrogen exchanger  39.79 
 
 		 659 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0414  putative glutathione-regulated potassium-efflux system K+/H+ antiporter transmembrane protein  39.94 
 
 		 659 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  41.07 
 
 		 663 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  40.99 
 
 		 667 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  40.16 
 
 		 678 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  40.99 
 
 		 667 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2171  sodium/hydrogen exchanger  39.84 
 
 		 668 aa  415  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2796  sodium/hydrogen exchanger  39.84 
 
 		 668 aa  415  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0879164 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4133  potassium efflux system protein  40.99 
 
 		 661 aa  415  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.477795 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2785  sodium/hydrogen exchanger  39.84 
 
 		 668 aa  415  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0657605  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  41.09 
 
 		 669 aa  412  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1760  sodium/hydrogen exchanger family protein  39.76 
 
 		 654 aa  410  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303253  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  40.79 
 
 		 658 aa  410  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0155  sodium/hydrogen exchanger  38.78 
 
 		 661 aa  410  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2703  sodium/hydrogen exchanger  40.16 
 
 		 670 aa  412  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2845  sodium/hydrogen exchanger  40.16 
 
 		 670 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0613147  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  41.01 
 
 		 663 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  40.68 
 
 		 666 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  40.93 
 
 		 669 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  40.93 
 
 		 669 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  40.93 
 
 		 669 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  40.93 
 
 		 669 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  40.93 
 
 		 669 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0269  sodium/hydrogen exchanger  39.18 
 
 		 659 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4109  sodium/hydrogen exchanger  40.43 
 
 		 661 aa  398  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.324646  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3491  potassium efflux system protein  41.15 
 
 		 661 aa  393  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0181  sodium/hydrogen exchanger  39.45 
 
 		 665 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4900  potassium efflux system protein  39.6 
 
 		 664 aa  395  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4786  potassium efflux system protein  39.59 
 
 		 661 aa  392  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3967  Sodium/hydrogen exchanger  43.18 
 
 		 570 aa  372  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0880  sodium/hydrogen exchanger  37.95 
 
 		 655 aa  367  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.19448  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1519  sodium/hydrogen exchanger family protein  39.78 
 
 		 579 aa  368  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.49267  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  33.58 
 
 		 671 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  33.39 
 
 		 674 aa  352  1e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.49 
 
 		 697 aa  348  2e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  33.44 
 
 		 636 aa  347  3e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2194  potassium efflux system protein  39.54 
 
 		 574 aa  342  9e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  33.09 
 
 		 666 aa  342  9e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  32.24 
 
 		 672 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  33.13 
 
 		 665 aa  330  6e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  33.23 
 
 		 666 aa  327  6e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  34.45 
 
 		 664 aa  327  6e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  32.47 
 
 		 666 aa  324  3e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  34.89 
 
 		 741 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3734  sodium/hydrogen exchanger  37.57 
 
 		 591 aa  320  6e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0554  potassium efflux system protein  34.9 
 
 		 624 aa  318  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00935447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3407  potassium efflux system protein  33.61 
 
 		 624 aa  318  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1735  sodium/hydrogen exchanger  36.54 
 
 		 593 aa  317  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0907  sodium/hydrogen exchanger  34.85 
 
 		 563 aa  316  9.999999999999999e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.116888  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  32.16 
 
 		 658 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  29.97 
 
 		 682 aa  313  7.999999999999999e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4560  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  36.66 
 
 		 602 aa  312  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520462  normal  0.460103 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3930  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  35.87 
 
 		 602 aa  311  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.423778  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4634  sodium/hydrogen exchanger  35.31 
 
 		 630 aa  310  5e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136405 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0266  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  35.69 
 
 		 602 aa  310  5.9999999999999995e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40601  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3687  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  35.69 
 
 		 602 aa  310  5.9999999999999995e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3654  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.81 
 
 		 601 aa  309  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0814431  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0301  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  36.64 
 
 		 604 aa  309  9e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.768293  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  31.92 
 
 		 656 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1853  sodium/hydrogen exchanger  32.52 
 
 		 688 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000204486  normal  0.40293 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.62 
 
 		 601 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.538189  normal  0.242525 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3653  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.81 
 
 		 601 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3825  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.62 
 
 		 601 aa  307  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.450061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5097  sodium/hydrogen exchanger  35.14 
 
 		 630 aa  308  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  31.56 
 
 		 663 aa  308  3e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3762  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.62 
 
 		 601 aa  308  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.581986  normal  0.282948 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1943  sodium/hydrogen exchanger  36.25 
 
 		 629 aa  306  6e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409828  normal  0.0242024 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0802  sodium/hydrogen exchanger  36.25 
 
 		 583 aa  306  6e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>