More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1977 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1977  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 		 243 aa  497  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0272  cytochrome c oxidase subunit III family protein  42.71 
 
 		 206 aa  175  6e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4156  cytochrome c oxidase subunit III family protein  41.83 
 
 		 205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.487941  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1788  cytochrome c oxidase subunit III  42.27 
 
 		 208 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2224  putative denitrification protein NorE  35.64 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1970  putative denitrification protein NorE  36.7 
 
 		 201 aa  132  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1065  putative denitrification protein NorE  37.69 
 
 		 201 aa  131  7.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0560  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  38.42 
 
 		 197 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830367  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2320  cytochrome c oxidase subunit III family protein  41.38 
 
 		 174 aa  128  7.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0210247  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1918  cytochrome c oxidase subunit III family protein  34.87 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0445  putative denitrification protein NorE  34.64 
 
 		 199 aa  122  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000224014  normal  0.5524 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1813  cytochrome c oxidase, subunit III  34.95 
 
 		 194 aa  111  9e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3192  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  35.36 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3118  cytochrome c oxidase, subunit III  35.98 
 
 		 191 aa  106  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0622  putative cytochrome c oxidase subunit  36.56 
 
 		 190 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.524381  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0044  cytochrome c oxidase subunit III  32.32 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  30.56 
 
 		 203 aa  102  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  31.79 
 
 		 196 aa  99.8  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4757  cytochrome c oxidase, subunit III  33.69 
 
 		 193 aa  99  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0954288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4463  cytochrome c oxidase, subunit III  33.69 
 
 		 193 aa  99  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327335  normal  0.0356516 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0043  cytochrome c oxidase subunit III  34.78 
 
 		 199 aa  99  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000712999 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4376  cytochrome c oxidase, subunit III  33.69 
 
 		 193 aa  99  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  29.47 
 
 		 226 aa  99  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  30.41 
 
 		 224 aa  98.6  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4575  cytochrome c oxidase, subunit III  30.73 
 
 		 200 aa  98.6  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1639  cytochrome c oxidase subunit III  30.5 
 
 		 202 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06790  putative cytochrome c oxidase subunit  37.71 
 
 		 175 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1250  cytochrome c oxidase, subunit III  33.52 
 
 		 197 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.287461  hitchhiker  0.0000975001 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1540  cytochrome c oxidase subunit III  32.97 
 
 		 199 aa  95.9  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1968  cytochrome c oxidase, subunit III  32.98 
 
 		 212 aa  95.1  8e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0535  cytochrome c oxidase subunit III  31.55 
 
 		 198 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2086  NorE protein involved in nitric oxide reduction  31.05 
 
 		 192 aa  93.6  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  0.597939 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2600  cytochrome c oxidase subunit III  37.57 
 
 		 204 aa  94  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  29.79 
 
 		 209 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  29.79 
 
 		 209 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  29.26 
 
 		 209 aa  92.4  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0220  cytochrome c oxidase, subunit III  34.76 
 
 		 200 aa  91.3  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4932  cytochrome c oxidase, subunit III  32.26 
 
 		 193 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318049  normal  0.0324373 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1824  cytochrome c oxidase, subunit III  29.02 
 
 		 199 aa  89  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.240701  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  30.62 
 
 		 208 aa  88.6  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  26.72 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1541  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  30.73 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  33.18 
 
 		 207 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0998  cytochrome c oxidase, subunit III  30.17 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0077  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  30.73 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0129097  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  28.92 
 
 		 225 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3864  cytochrome c oxidase, subunit III  29.95 
 
 		 198 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00290565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  25.74 
 
 		 234 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3187  nitric oxide reductase E protein  29.28 
 
 		 184 aa  86.7  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3791  cytochrome c oxidase, subunit III  29.95 
 
 		 198 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0359951  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  24.89 
 
 		 234 aa  85.9  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3795  cytochrome c oxidase, subunit III  29.44 
 
 		 198 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478856  normal  0.908261 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0911  cytochrome c oxidase, subunit III  30.17 
 
 		 209 aa  85.5  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1163  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  30.17 
 
 		 209 aa  85.5  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322361  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2238  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  30.17 
 
 		 209 aa  85.5  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.394617  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  26.83 
 
 		 215 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  26.44 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  29.84 
 
 		 832 aa  82  0.000000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4178  cytochrome c oxidase, subunit III  28.72 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.304449  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1036  cytochrome c oxidase subunit III  26.9 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0806413 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  25.12 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1513  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6291  cytochrome c oxidase subunit III  33.16 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2527  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit III  34.38 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00772107  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  32.95 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  29 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  26.84 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  28.21 
 
 		 819 aa  75.5  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  25.7 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0250  cytochrome c oxidase, subunit III  34.36 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.256401  normal  0.022866 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0065  cytochrome c oxidase, subunit III  35.82 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  31.21 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5826  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  27.07 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.550286  normal  0.42058 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  29.31 
 
 		 214 aa  72  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1679  cytochrome c oxidase subunit III  29.79 
 
 		 293 aa  71.6  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1943  cytochrome-c oxidase  26.42 
 
 		 798 aa  71.2  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  23.08 
 
 		 229 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  27.03 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2421  cytochrome c oxidase subunit III  22.47 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0162196  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0513  cytochrome c oxidase subunit III  28.74 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4387  Cytochrome-c oxidase  30.77 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  29.14 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0183  cytochrome c oxidase subunit III  31.65 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  27.89 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  31.13 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6231  cytochrome c oxidase subunit III  29.52 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211629  normal  0.107946 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2267  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  28.95 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.462963  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0314  cytochrome c oxidase subunit III  33.83 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0246  cytochrome c oxidase, subunit III  29.12 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2855  cytochrome c oxidase subunit III  29.79 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04023  cytochrome C oxidase subunit III  31.65 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3532  cytochrome c oxidase, subunit III  29.79 
 
 		 293 aa  68.9  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.671052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5106  cytochrome c oxidase, subunit III  29.47 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0670031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2116  cytochrome c oxidase, subunit III  31.67 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479128 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2777  cytochrome c oxidase, subunit III  28.5 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.735853 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0224  cytochrome c oxidase subunit III  28.23 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4577  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit III  26.94 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  30.86 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0481  cytochrome c oxidase subunit III  28.19 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  30.86 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>