More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0377 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0377  Nitrate and nitrite sensing domain protein  100 
 
 		 661 aa  1342    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000413313  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.86 
 
 		 658 aa  476  1e-133  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.603066  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.65 
 
 		 720 aa  314  2.9999999999999996e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0989  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.75 
 
 		 720 aa  306  6e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1929  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.31 
 
 		 662 aa  277  4e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23754  normal  0.0188929 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2325  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.58 
 
 		 664 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100516  hitchhiker  0.00420774 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1713  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.45 
 
 		 666 aa  265  1e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000425798  normal  0.0665929 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2242  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.22 
 
 		 664 aa  265  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2369  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.62 
 
 		 664 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0315396  normal  0.0961625 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1813  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.07 
 
 		 664 aa  258  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.280908  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1950  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.58 
 
 		 664 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0377955  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1352  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.12 
 
 		 668 aa  258  3e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0763  methyl-accepting chemotaxis protein  34.57 
 
 		 661 aa  257  4e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1957  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.43 
 
 		 664 aa  256  7e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.257458  normal  0.211978 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1937  methyl-accepting chemotaxis protein  35.38 
 
 		 662 aa  256  1.0000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0215017  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2282  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.76 
 
 		 664 aa  251  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.330304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0413  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.68 
 
 		 653 aa  230  8e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.81 
 
 		 661 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2657  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.46 
 
 		 646 aa  216  8e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.653915  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.04 
 
 		 652 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.74 
 
 		 649 aa  211  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1251  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.39 
 
 		 646 aa  209  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.457093  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1114  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.95 
 
 		 700 aa  201  5e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.655641 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1760  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.16 
 
 		 664 aa  194  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.106787  normal  0.536367 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.24 
 
 		 531 aa  193  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.666083  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1790  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.16 
 
 		 664 aa  191  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.119789  normal  0.182995 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1685  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.46 
 
 		 664 aa  191  5e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0832618  normal  0.158688 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2284  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.94 
 
 		 653 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297466 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2315  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  28.19 
 
 		 653 aa  167  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.967368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3099  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.16 
 
 		 672 aa  165  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.500846  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0262  chemotaxis sensory transducer  32.56 
 
 		 650 aa  157  6e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2511  methyl-accepting chemotaxis protein  28.07 
 
 		 653 aa  157  8e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295069  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2141  chemotaxis sensory transducer  33.61 
 
 		 708 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0819  chemotaxis sensory transducer  32.7 
 
 		 627 aa  154  5e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.113637  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0982  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.07 
 
 		 663 aa  154  5.9999999999999996e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.293812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1039  protease htpx  30.64 
 
 		 656 aa  153  1e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0758551  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1932  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.73 
 
 		 682 aa  151  3e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1930  chemotaxis sensory transducer  32.97 
 
 		 625 aa  151  4e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1471  DNA processing chain A  27.92 
 
 		 651 aa  150  1.0000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1205  chemotaxis sensory transducer  33.61 
 
 		 713 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1931  chemotaxis sensory transducer  34.6 
 
 		 621 aa  147  9e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0631  chemotaxis sensory transducer  33.99 
 
 		 656 aa  146  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00821954  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0840  cache domain-contain protein  30.99 
 
 		 566 aa  146  1e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.287851  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0113  chemotaxis sensory transducer  32.97 
 
 		 563 aa  144  4e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1854  chemotaxis sensory transducer  31.3 
 
 		 536 aa  144  6e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1826  chemotaxis sensory transducer  31.22 
 
 		 650 aa  144  6e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1331  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.19 
 
 		 563 aa  143  8e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158014  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0920  nitrate and nitrite sensing methyl-accepting chemotaxis protein  26.67 
 
 		 662 aa  143  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1432  chemotaxis sensory transducer  31.25 
 
 		 546 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0087  MCP-domain signal transduction protein  33.52 
 
 		 600 aa  139  2e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0562  putative methyl-accepting chemotaxis protein  31.97 
 
 		 530 aa  139  2e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.191806  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0112  chemotaxis sensory transducer  38.57 
 
 		 563 aa  137  5e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0046  methyl-accepting chemotaxis protein  30.46 
 
 		 584 aa  137  7.000000000000001e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1434  chemotaxis sensory transducer  31.14 
 
 		 530 aa  136  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0019  methyl-accepting chemotaxis protein  30.46 
 
 		 593 aa  136  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.314472  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3269  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.8 
 
 		 605 aa  134  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000515244  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0544  MCP-domain signal transduction protein  28.5 
 
 		 530 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1073  chemotaxis sensory transducer  28.92 
 
 		 633 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00919731  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0395  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase (UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine synthetase)  38.89 
 
 		 663 aa  131  3e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2035  putative transducer  34.14 
 
 		 626 aa  131  5.0000000000000004e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1856  acyl-CoA hydrolase  39.01 
 
 		 654 aa  129  2.0000000000000002e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1331  MCP-domain signal transduction protein  58.33 
 
 		 678 aa  127  6e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0312  methyl-accepting chemotaxis protein  46.54 
 
 		 662 aa  127  7e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0180  methyl-accepting chemotaxis protein  46.54 
 
 		 659 aa  127  7e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0314  methyl-accepting chemotaxis protein  46.54 
 
 		 659 aa  127  8.000000000000001e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1735  methyl-accepting chemotaxis protein  46.54 
 
 		 651 aa  127  8.000000000000001e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0289  methyl-accepting chemotaxis protein  46.54 
 
 		 665 aa  127  9e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0140  methyl-accepting chemotaxis protein  46.54 
 
 		 540 aa  126  1e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0383  MCP-domain signal transduction protein  46.11 
 
 		 656 aa  126  1e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.168196  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1915  methyl-accepting chemotaxis protein  46.54 
 
 		 653 aa  126  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.633585  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1549  methyl-accepting chemotaxis protein  48.41 
 
 		 236 aa  126  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00107467  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.6 
 
 		 372 aa  126  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.409493  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1720  methyl-accepting chemotaxis protein  46.54 
 
 		 664 aa  126  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1547  MCP-domain signal transduction protein  45.51 
 
 		 657 aa  125  2e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1178  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.55 
 
 		 530 aa  125  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1546  MCP-domain signal transduction protein  45.51 
 
 		 660 aa  125  2e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1227  methyl-accepting chemotaxis protein  39.02 
 
 		 553 aa  125  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0141  MCP-domain signal transduction protein  45.51 
 
 		 658 aa  125  3e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0185  methyl-accepting chemotaxis protein  47.76 
 
 		 544 aa  124  5e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000579859  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1307  methyl-accepting chemotaxis protein  47.76 
 
 		 596 aa  124  6e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000917497  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0818  chemotaxis sensory transducer  28.76 
 
 		 590 aa  124  6e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1041  methyl-accepting chemotaxis protein  36.67 
 
 		 731 aa  123  9.999999999999999e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.32701  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1645  methyl-accepting chemotaxis protein  49.21 
 
 		 545 aa  123  9.999999999999999e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0567442  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0397  methyl-accepting chemotaxis protein  46.48 
 
 		 655 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1409  methyl-accepting chemotaxis protein  46.48 
 
 		 655 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1860  chemotaxis sensory transducer  30.77 
 
 		 533 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00521087  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0869  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  51.16 
 
 		 649 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0190  methyl-accepting chemotaxis protein  49.21 
 
 		 657 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.145639  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1305  methyl-accepting chemotaxis protein  49.21 
 
 		 652 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.049405  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1679  methyl-accepting chemotaxis protein  45.22 
 
 		 700 aa  122  3e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1858  methyl-accepting chemotaxis protein  56.03 
 
 		 700 aa  121  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1498  methyl-accepting chemotaxis protein  45.22 
 
 		 700 aa  122  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.756421  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1957  methyl-accepting chemotaxis protein  63.16 
 
 		 654 aa  121  4.9999999999999996e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1499  MCP-domain signal transduction protein  34.23 
 
 		 694 aa  120  6e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0612  methyl-accepting chemotaxis protein  40.96 
 
 		 429 aa  119  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1202  chemotaxis sensory transducer  40.91 
 
 		 380 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003896  methyl-accepting chemotaxis protein  30.92 
 
 		 545 aa  117  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000288698  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2196  methyl-accepting chemotaxis protein  38.41 
 
 		 604 aa  116  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1698  methyl-accepting chemotaxis protein  29.53 
 
 		 653 aa  116  1.0000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130314  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1128  methyl-accepting chemotaxis protein  40.43 
 
 		 429 aa  116  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>