More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3226 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3226  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  512  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.849662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5809  twin arginine-targeting protein translocase TatC  58.14 
 
 		 267 aa  305  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66980  sec-independent protein translocase TatC  58.14 
 
 		 267 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0332914  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4204  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  58.06 
 
 		 249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0591  Sec-independent protein translocase TatC  61.51 
 
 		 255 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0294622  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3422  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  57.59 
 
 		 260 aa  303  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0400  Sec-independent protein translocase TatC  57.66 
 
 		 249 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3556  Sec-independent protein translocase TatC  58.06 
 
 		 249 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0456  Sec-independent protein translocase TatC  59 
 
 		 261 aa  298  4e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0501  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  56.45 
 
 		 249 aa  297  1e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4242  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  57.79 
 
 		 249 aa  297  1e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5157  sec-independent protein translocase TatC  57.09 
 
 		 266 aa  296  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0382  Sec-independent periplasmic protein translocase  57.09 
 
 		 266 aa  296  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00567  Sec-independent protein translocase protein  56.05 
 
 		 249 aa  296  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0380  Sec-independent periplasmic protein translocase  57.49 
 
 		 264 aa  296  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0447  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  59.09 
 
 		 263 aa  295  5e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3001  sec-independent protein translocase protein TatC  55.6 
 
 		 251 aa  295  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87318  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5018  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  57.49 
 
 		 262 aa  293  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4892  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  57.49 
 
 		 262 aa  293  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.418116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3900  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  56.45 
 
 		 251 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0426  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  56.45 
 
 		 251 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000454537 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0414  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  56.45 
 
 		 251 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4051  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  57.38 
 
 		 250 aa  291  5e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0440  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  56.05 
 
 		 251 aa  291  6e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.289196 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2427  hypothetical protein  58.16 
 
 		 250 aa  291  7e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3758  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  55.2 
 
 		 253 aa  291  7e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.428108  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0470  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  54.29 
 
 		 248 aa  291  7e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  57.09 
 
 		 262 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0318  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  54.65 
 
 		 258 aa  290  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4101  sec-independent protein translocase, TatC subunit  57.76 
 
 		 255 aa  289  3e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.84957 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4215  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  56.91 
 
 		 269 aa  289  3e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3797  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  59.48 
 
 		 253 aa  289  3e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03731  TatABCE protein translocation system subunit  56.22 
 
 		 258 aa  288  7e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  56.22 
 
 		 258 aa  288  7e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3378  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  56.33 
 
 		 251 aa  288  7e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.865812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  56.22 
 
 		 258 aa  288  7e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  56.22 
 
 		 258 aa  288  7e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4062  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  56.22 
 
 		 258 aa  288  7e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  56.22 
 
 		 258 aa  288  7e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4221  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  56.22 
 
 		 258 aa  288  7e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142004 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  56.22 
 
 		 258 aa  288  7e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03680  hypothetical protein  56.22 
 
 		 258 aa  288  7e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4362  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  54.62 
 
 		 259 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4302  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  54.62 
 
 		 259 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.901815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4183  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  54.62 
 
 		 259 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.335663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4255  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  54.62 
 
 		 259 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4206  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  54.62 
 
 		 259 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3910  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  56.91 
 
 		 255 aa  286  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0253  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  57.08 
 
 		 256 aa  285  5e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.3231 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0516  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  57.61 
 
 		 264 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0132  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  54.98 
 
 		 398 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00562  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  54.66 
 
 		 251 aa  282  4.0000000000000003e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0221  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  58.26 
 
 		 368 aa  281  7.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0741  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  59.92 
 
 		 258 aa  281  8.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0276  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  56.28 
 
 		 258 aa  280  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3955  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  56.67 
 
 		 256 aa  279  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0774266 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3940  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  56.28 
 
 		 258 aa  280  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3636  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  56.28 
 
 		 258 aa  279  3e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1974  Sec-independent protein translocase TatC  56.72 
 
 		 368 aa  279  4e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.812349  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45480  twin arginine-targeting protein translocase  54.58 
 
 		 265 aa  277  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3043  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  52.8 
 
 		 252 aa  276  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3730  Sec-independent protein translocase TatC  57.26 
 
 		 249 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3060  Sec-independent periplasmic protein translocase, TatC  54.66 
 
 		 250 aa  271  9e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001922  twin-arginine translocation protein TatC  56.49 
 
 		 250 aa  268  8.999999999999999e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1486  Sec-independent protein translocase TatC  53.88 
 
 		 254 aa  267  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.450631  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1036  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  50.4 
 
 		 253 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1039  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  49.6 
 
 		 253 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4187  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  50.59 
 
 		 252 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1080  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  49.21 
 
 		 253 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.557784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2610  Sec-independent protein translocase TatC  51.44 
 
 		 262 aa  263  3e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3207  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  55.92 
 
 		 250 aa  261  8e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0165  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  53.56 
 
 		 255 aa  257  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0547  Sec-independent protein translocase TatC  54.66 
 
 		 245 aa  256  2e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0576043  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2002  Sec-independent protein translocase TatC  49.15 
 
 		 278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.4915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  50.41 
 
 		 269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0522  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  59.48 
 
 		 256 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.741843 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2305  Sec-independent protein translocase TatC  48.51 
 
 		 294 aa  250  1e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.920568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0716  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.52 
 
 		 289 aa  236  2e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206477 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  46.25 
 
 		 262 aa  236  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183813  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0260  Sec-independent protein translocase TatC  47.48 
 
 		 244 aa  236  3e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0872197  hitchhiker  0.00458614 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0783  Sec-independent protein translocase TatC  46.25 
 
 		 262 aa  236  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.037642 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2322  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  45.38 
 
 		 277 aa  236  4e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0472235  normal  0.432389 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0699  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  44.66 
 
 		 262 aa  234  9e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1087  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.56 
 
 		 264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3987  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  49.34 
 
 		 249 aa  230  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0915  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  43.78 
 
 		 265 aa  227  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03838  twin arginine-targeting protein translocase TatC  45.71 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.362627  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  44.35 
 
 		 266 aa  222  4e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1740  SEC-independent protein translocase  46.75 
 
 		 246 aa  218  5e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  44.36 
 
 		 259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.40732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3235  Sec-independent protein translocase TatC  43.73 
 
 		 260 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1668  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  44.77 
 
 		 246 aa  214  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0843  Sec-independent protein translocase TatC  45.88 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.293811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0411  Sec-independent protein translocase TatC  44.14 
 
 		 259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.856028  normal  0.682623 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3547  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  45.12 
 
 		 259 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146328  hitchhiker  0.0021948 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1055  Sec-independent protein translocase TatC  43.03 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1617  Sec-independent protein translocase TatC  43.57 
 
 		 271 aa  207  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.050313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3217  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  43.19 
 
 		 267 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.920211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2870  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  43.19 
 
 		 267 aa  205  5e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0371703 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2940  putative SEC-independent translocase protein TATC transmembrane  43.19 
 
 		 267 aa  204  8e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.935622  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>