110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1899 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1899  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  822    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.598311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0012  hypothetical protein  51.41 
 
 		 379 aa  350  2e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0572769  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  48.74 
 
 		 373 aa  334  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1520  domain of unknown function DUF1745  47.11 
 
 		 1101 aa  322  6e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.593307 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0354  hypothetical protein  46.3 
 
 		 387 aa  305  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0140  FIST C domain protein  46.02 
 
 		 379 aa  302  7.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0331  hypothetical protein  46.83 
 
 		 387 aa  299  4e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  44.38 
 
 		 395 aa  299  6e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4141  hypothetical protein  44.41 
 
 		 365 aa  299  7e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  41.29 
 
 		 381 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3184  hypothetical protein  42.09 
 
 		 377 aa  279  6e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3884  domain of unknown function DUF1745  35.88 
 
 		 1852 aa  207  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  27.68 
 
 		 408 aa  147  3e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2107  domain of unknown function DUF1745  30 
 
 		 401 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2153  hypothetical protein  29.5 
 
 		 400 aa  133  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  25.98 
 
 		 383 aa  123  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2079  domain of unknown function DUF1745  28.49 
 
 		 417 aa  123  6e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00286991  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1476  domain of unknown function DUF1745  27.61 
 
 		 629 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.153758  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2305  domain of unknown function DUF1745  27.32 
 
 		 389 aa  113  6e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0294  hypothetical protein  26.85 
 
 		 375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  27.65 
 
 		 396 aa  111  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1352  domain of unknown function DUF1745  27.3 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3322200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2119  hypothetical protein  26.98 
 
 		 402 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  26.74 
 
 		 387 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1203  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  25.88 
 
 		 932 aa  96.7  7e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00343755  normal  0.259486 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  25.96 
 
 		 376 aa  93.6  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0268  diguanylate cyclase  24.7 
 
 		 933 aa  92.8  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0380534  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0824  hypothetical protein  25.78 
 
 		 379 aa  90.5  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1204  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  26.9 
 
 		 931 aa  89.4  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271509 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3657  domain of unknown function DUF1745  25.07 
 
 		 416 aa  88.2  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4040  domain of unknown function DUF1745  26.49 
 
 		 396 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4131  domain of unknown function DUF1745  23.73 
 
 		 396 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1891  hypothetical protein  33.68 
 
 		 391 aa  82.8  0.000000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.473859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1202  fused sensor protein/response regulator  25.4 
 
 		 934 aa  82.8  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127641  normal  0.087847 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3113  hypothetical protein  26.32 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.680527  hitchhiker  0.0000208643 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1055  domain of unknown function DUF1745  30.37 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0911  hypothetical protein  24.24 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.36206  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0444  hypothetical protein  28.72 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0438  domain of unknown function DUF1745  29.79 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0688  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.82 
 
 		 951 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00399648  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3242  domain of unknown function DUF1745  28.9 
 
 		 371 aa  67  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0186777  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4044  hypothetical protein  25.14 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0895  FIST C domain protein  23.47 
 
 		 350 aa  65.9  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000443325  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3246  domain of unknown function DUF1745  23.73 
 
 		 396 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116005  normal  0.61148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8558  hypothetical protein  25.07 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0889  hypothetical protein  27.44 
 
 		 374 aa  64.3  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2993  hypothetical protein  30.41 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002115  sensory box/GGDEF family protein  22.8 
 
 		 828 aa  61.6  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0526  hypothetical protein  22.14 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0128  hypothetical protein  22.4 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.193314  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2052  domain of unknown function DUF1745  23.65 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4045  hypothetical protein  24.69 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2659  hypothetical protein  24.62 
 
 		 406 aa  57  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3362  hypothetical protein  26.16 
 
 		 377 aa  55.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.103972 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1872  hypothetical protein  24.46 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2665  domain of unknown function DUF1745  22.44 
 
 		 427 aa  56.2  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1503  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.58 
 
 		 947 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2247  hypothetical protein  25 
 
 		 382 aa  55.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.316904 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0091  domain of unknown function DUF1745  27.93 
 
 		 383 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2538  hypothetical protein  25.45 
 
 		 382 aa  54.3  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3551  hypothetical protein  25.51 
 
 		 371 aa  53.5  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1883  hypothetical protein  23.46 
 
 		 382 aa  52.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1049  hypothetical protein  23 
 
 		 406 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198533 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2063  hypothetical protein  25.61 
 
 		 425 aa  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.748308  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24381  hypothetical protein  24.38 
 
 		 429 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0466  domain of unknown function DUF1745  26.22 
 
 		 385 aa  51.6  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0306  hypothetical protein  26.67 
 
 		 447 aa  50.8  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2912  hypothetical protein  28.71 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5581  hypothetical protein  26.61 
 
 		 396 aa  50.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19369  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1939  hypothetical protein  27.36 
 
 		 384 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10891  hypothetical protein  24.02 
 
 		 386 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.824347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0281  hypothetical protein  26.7 
 
 		 431 aa  48.9  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.812324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02432  hypothetical protein  20.73 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2191  diguanylate cyclase  21.69 
 
 		 806 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00068502 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3390  hypothetical protein  24.82 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.0973611 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3141  hypothetical protein  25 
 
 		 460 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3140  hypothetical protein  26.82 
 
 		 387 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1108  domain of unknown function DUF1745  25 
 
 		 378 aa  48.9  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1387  hypothetical protein  25 
 
 		 378 aa  48.9  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3887  hypothetical protein  26.24 
 
 		 421 aa  48.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.894307 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2389  GGDEF family protein  25 
 
 		 829 aa  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10639  hypothetical protein  24.12 
 
 		 383 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000135133  normal  0.805152 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00305  sensory transduction protein kinase  25.65 
 
 		 828 aa  47.8  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3160  domain of unknown function DUF1745  26.24 
 
 		 421 aa  48.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4193  domain of unknown function DUF1745  26.23 
 
 		 386 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351241  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3254  domain of unknown function DUF1745  23.4 
 
 		 385 aa  47.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126453  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1139  hypothetical protein  24.93 
 
 		 392 aa  47.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3344  hypothetical protein  23.43 
 
 		 464 aa  47.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3953  hypothetical protein  23.16 
 
 		 389 aa  47.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1561  hypothetical protein  23.53 
 
 		 404 aa  46.6  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0913  domain of unknown function DUF1745  23.2 
 
 		 414 aa  46.2  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0940  domain of unknown function DUF1745  23.2 
 
 		 414 aa  46.2  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4508  hypothetical protein  24.61 
 
 		 439 aa  46.2  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260066 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3636  hypothetical protein  24.9 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0371475  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1931  hypothetical protein  23.78 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2339  domain of unknown function DUF1745  24.55 
 
 		 383 aa  45.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38990  hypothetical protein  26.72 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.880326  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1400  domain of unknown function DUF1745  26.37 
 
 		 398 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.653815  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05570  hypothetical protein  26.92 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2592  hypothetical protein  23.78 
 
 		 386 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>