More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3366 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_3366  ABC transporter related  100 
 
 
297 aa  615  1e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0975  ABC transporter related  99.66 
 
 
297 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0997  ABC transporter related  99.33 
 
 
297 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1009  ABC transporter related  98.65 
 
 
297 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2963  ABC transporter related  90.91 
 
 
293 aa  550  1e-156  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3280  ABC transporter related  78.75 
 
 
326 aa  454  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1033  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  80.74 
 
 
285 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0840  ABC transporter related  77.66 
 
 
321 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3182  ABC transporter related  77.66 
 
 
321 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0874  ABC transporter related  70.34 
 
 
269 aa  387  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3736  ABC transporter-related protein  63.6 
 
 
311 aa  365  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.652525 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4086  ABC transporter related  69.26 
 
 
279 aa  363  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3382  ABC transporter related  63.5 
 
 
308 aa  360  1e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1116  ABC transporter related  62.92 
 
 
307 aa  341  7e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0712  ABC transporter-related protein  62.45 
 
 
324 aa  324  9e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0760  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  58.08 
 
 
271 aa  308  5e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0867  ABC transporter related  50.4 
 
 
261 aa  271  9e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1348  ABC transporter related  50.4 
 
 
261 aa  271  9e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893482  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1330  ABC transporter related  50.4 
 
 
261 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4490  ABC transporter, ATPase subunit  49.6 
 
 
265 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0876356  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4566  ABC transporter related  49.43 
 
 
280 aa  259  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  49.6 
 
 
260 aa  258  7e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1413  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  48.29 
 
 
295 aa  258  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3153  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  47.84 
 
 
263 aa  255  6e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3192  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  47.84 
 
 
265 aa  255  6e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2035  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  47.84 
 
 
263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0878  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  47.84 
 
 
265 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.382345  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2712  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  47.84 
 
 
265 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203934  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1898  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  47.84 
 
 
265 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303699  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2164  ABC transporter related  45.63 
 
 
270 aa  246  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0593  ABC transporter-like  48.05 
 
 
262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835078  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5561  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.45 
 
 
259 aa  242  5e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26400  putative ATP-binding component of ABC transporter  49.4 
 
 
257 aa  242  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.749781  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4240  ABC transporter related  48.55 
 
 
285 aa  234  9e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2099  ABC transporter related  42.8 
 
 
261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5102  ABC transporter  45.88 
 
 
259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2242  ABC transporter ATP-binding protein  47.41 
 
 
257 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  42.86 
 
 
259 aa  228  1e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  41.8 
 
 
264 aa  222  7e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  39.54 
 
 
275 aa  217  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5100  ABC transporter related  42.46 
 
 
253 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130853  normal  0.02881 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  44.92 
 
 
262 aa  217  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2731  ABC transporter related  43.32 
 
 
255 aa  217  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3207  ABC transporter related  41.67 
 
 
253 aa  217  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.712241  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1166  putative vitamin B12 transport ATP-binding protein BtuD  46.89 
 
 
276 aa  216  4e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.468222  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4222  ABC transporter related  44.18 
 
 
254 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  42.06 
 
 
262 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0443  ABC transporter related  43.08 
 
 
257 aa  210  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.152213 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2599  ABC transporter related  42.06 
 
 
254 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628612  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.44 
 
 
253 aa  206  4e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3775  ABC transporter related protein  40.87 
 
 
265 aa  206  5e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2273  ABC transporter related  41.5 
 
 
254 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788065  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  42.15 
 
 
384 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  40.32 
 
 
267 aa  202  8e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4828  ABC transporter related  41.11 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169592  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  42.68 
 
 
257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5388  ABC transporter related  42.06 
 
 
253 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133322  normal  0.359169 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0404  ABC transporter related  42.44 
 
 
283 aa  198  9e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4783  ABC transporter related  42.02 
 
 
263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 
251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1141  ABC transporter related  42.08 
 
 
303 aa  193  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  39.44 
 
 
269 aa  192  6e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  37.08 
 
 
424 aa  191  1e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1301  ABC transporter-related protein  39.76 
 
 
261 aa  190  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  38.19 
 
 
490 aa  188  7e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23980  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  38.1 
 
 
339 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.862389 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  38.55 
 
 
264 aa  187  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2322  ABC transporter related protein  38.25 
 
 
261 aa  186  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1285  ABC transporter related  38.02 
 
 
255 aa  186  5e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0279038  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1610  ABC transporter related protein  40.65 
 
 
315 aa  186  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0728276  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  35.91 
 
 
455 aa  185  9e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.33 
 
 
264 aa  185  9e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  36.4 
 
 
536 aa  184  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21290  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  41.74 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  40.69 
 
 
266 aa  183  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  41.31 
 
 
262 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.58 
 
 
265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1426  ABC transporter related protein  35.74 
 
 
266 aa  182  6e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0163  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  37.92 
 
 
265 aa  182  6e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00150  iron-hydroxamate transporter subunit  37.92 
 
 
265 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00128613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3451  ABC transporter related protein  37.92 
 
 
265 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0148611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0156  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  37.92 
 
 
265 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0161  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  37.92 
 
 
265 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00149  hypothetical protein  37.92 
 
 
265 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00123723  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1653  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
254 aa  182  8.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0155  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  37.92 
 
 
265 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0560  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  41.04 
 
 
257 aa  181  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0143  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  37.92 
 
 
265 aa  181  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3914  ABC transporter related  44.39 
 
 
274 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00146418  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17610  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  36.89 
 
 
251 aa  180  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  39.5 
 
 
268 aa  180  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04360  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  38.24 
 
 
285 aa  181  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  40.74 
 
 
270 aa  180  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3508  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  37.92 
 
 
265 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000160242  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  38.75 
 
 
409 aa  179  7e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0965  ABC transporter related  36.68 
 
 
293 aa  176  3e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0225  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.8 
 
 
265 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0210  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.8 
 
 
265 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0209  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.8 
 
 
265 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2584  ABC transporter related  39.17 
 
 
273 aa  176  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>