248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2308 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2537  sodium/hydrogen exchanger family protein  85.05 
 
 		 669 aa  1120    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2321  sodium/hydrogen exchanger  98.94 
 
 		 660 aa  1315    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.545125  hitchhiker  0.000203679 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2605  sodium/hydrogen exchanger  74.84 
 
 		 637 aa  930    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00858761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2308  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 660 aa  1324    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3909  Na+/H+ antiporter  54.03 
 
 		 607 aa  637    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2109  sodium/hydrogen exchanger  68.87 
 
 		 643 aa  859    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1732  sodium/hydrogen exchanger  76.67 
 
 		 702 aa  916    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2400  sodium/hydrogen exchanger  74.72 
 
 		 625 aa  911    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000130765  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1998  sodium/hydrogen exchanger  75.53 
 
 		 616 aa  919    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112153 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1982  sodium/hydrogen exchanger  52.61 
 
 		 619 aa  648    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2065  sodium/hydrogen exchanger  98.94 
 
 		 660 aa  1314    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000562767  hitchhiker  0.000963897 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2147  sodium/hydrogen exchanger  91.49 
 
 		 670 aa  1096    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251145  normal  0.368531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2224  sodium/hydrogen exchanger  91.32 
 
 		 673 aa  1093    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00760493  normal  0.0969988 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1861  sodium/hydrogen exchanger  78.18 
 
 		 719 aa  930    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.182882  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2324  sodium/hydrogen exchanger  91.28 
 
 		 670 aa  1111    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.339898  normal  0.580137 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2017  sodium/hydrogen exchanger  99.39 
 
 		 660 aa  1315    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000155921  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1871  sodium/hydrogen exchanger family protein  74.31 
 
 		 666 aa  930    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0707  sodium/hydrogen exchanger  64.78 
 
 		 651 aa  853    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0511  sodium/hydrogen exchanger  52.79 
 
 		 622 aa  623  1e-177  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00461  Na+/H+ antiporter  53.72 
 
 		 569 aa  601  1e-170  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1380  putative sodium/hydrogen antiporter  51.23 
 
 		 611 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00463957  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0220  hypothetical protein  48.81 
 
 		 598 aa  550  1e-155  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16030  putative sodium/hydrogen antiporter  51.26 
 
 		 611 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000727  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  48.15 
 
 		 599 aa  536  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1072  sodium/hydrogen exchanger  49.58 
 
 		 601 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.558941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1024  Sodium/hydrogen exchanger  49.25 
 
 		 602 aa  530  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30796  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4152  sodium/hydrogen exchanger  49.01 
 
 		 608 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561792 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04922  Na+/K+/H+ antiporter  47.92 
 
 		 597 aa  528  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1467  sodium/hydrogen exchanger  49.24 
 
 		 601 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0146  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  44.59 
 
 		 763 aa  519  1e-146  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269507 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0156  sodium/hydrogen exchanger  43.91 
 
 		 764 aa  520  1e-146  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0127  sodium/hydrogen exchanger  42.43 
 
 		 760 aa  520  1e-146  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.302904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4254  sodium/hydrogen exchanger  49.24 
 
 		 601 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2318  sodium/hydrogen exchanger  47.3 
 
 		 599 aa  513  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0395796  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4478  sodium/hydrogen exchanger  50.18 
 
 		 602 aa  511  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1211  Sodium/hydrogen exchanger  44.37 
 
 		 611 aa  462  1e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0850  sodium/hydrogen exchanger  42.56 
 
 		 617 aa  453  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0477  sodium/hydrogen exchanger  46.1 
 
 		 616 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0802705  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0424  sodium/hydrogen exchanger  39.08 
 
 		 852 aa  377  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0521  Sodium/hydrogen exchanger  36.65 
 
 		 604 aa  360  5e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0868  Na(+):H(+) antiporter  37.12 
 
 		 606 aa  342  1e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03225  Na(+):H(+) antiporter, CPA1 family protein  35.84 
 
 		 625 aa  317  4e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4369  sodium/hydrogen exchanger  33.94 
 
 		 596 aa  312  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19170  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  32.9 
 
 		 640 aa  311  2.9999999999999997e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.490991  normal  0.0684118 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4286  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.12 
 
 		 596 aa  310  4e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0381852  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4275  Na+/H+ exchanger (Na+/H+ antiporter)  33.94 
 
 		 596 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4654  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.94 
 
 		 596 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4781  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.94 
 
 		 596 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4436  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.94 
 
 		 596 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00005477  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4667  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.76 
 
 		 596 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2869  sodium/hydrogen exchanger  33.86 
 
 		 623 aa  286  8e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.824474  normal  0.920346 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0042  sodium/hydrogen exchanger  33.02 
 
 		 607 aa  255  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126585  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  33.39 
 
 		 741 aa  254  5.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0759  sodium/hydrogen exchanger  34.78 
 
 		 584 aa  253  7e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135673  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2740  Sodium/hydrogen exchanger  36.45 
 
 		 629 aa  248  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5185  sodium/hydrogen exchanger  36.31 
 
 		 660 aa  248  3e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2292  sodium/hydrogen exchanger  38.39 
 
 		 637 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.042334  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1446  sodium/hydrogen exchanger  39.57 
 
 		 641 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3229  sodium/hydrogen exchanger  35.81 
 
 		 652 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2891  sodium/hydrogen exchanger  36.61 
 
 		 652 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0888  sodium/hydrogen exchanger  37.76 
 
 		 628 aa  241  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.043911 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0859  sodium/hydrogen exchanger  36.81 
 
 		 640 aa  237  4e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4282  sodium/hydrogen exchanger  36.85 
 
 		 609 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0956  sodium/hydrogen exchanger  33.79 
 
 		 639 aa  234  3e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 610 aa  220  7e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2077  Na+/H+ antiporter, putative  30.28 
 
 		 595 aa  215  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  31.13 
 
 		 612 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  33.78 
 
 		 617 aa  200  7.999999999999999e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  33.18 
 
 		 617 aa  192  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3821  sodium/hydrogen exchanger  38.93 
 
 		 407 aa  191  5e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2394  Na+/H+ antiporter  41.38 
 
 		 593 aa  187  5e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00954713  hitchhiker  0.00302602 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  33.19 
 
 		 626 aa  178  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  32.53 
 
 		 628 aa  172  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0472  CPA1 family Na+/H+ antiporter  35.15 
 
 		 399 aa  166  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0494569  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  30.65 
 
 		 630 aa  161  4e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04971  CPA1 family Na+/H+ antiporter  34.47 
 
 		 401 aa  160  9e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06781  putative Na+/H+ antiporter, CPA1 family  36.52 
 
 		 421 aa  160  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05271  CPA1 family Na+/H+ antiporter  34.47 
 
 		 401 aa  159  2e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0377759  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05361  CPA1 family Na+/H+ antiporter  35.03 
 
 		 399 aa  158  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1720  CPA1 family Na+/H+ antiporter  35.41 
 
 		 414 aa  150  8e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04731  CPA1 family Na+/H+ antiporter  33.97 
 
 		 402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.281963  normal  0.831051 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1805  CPA1 family Na+/H+ antiporter  34.28 
 
 		 414 aa  140  6e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05281  CPA1 family Na+/H+ antiporter  34.28 
 
 		 414 aa  140  6e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0626531  normal  0.0646135 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0640  CPA1 family Na+/H+ antiporter  37.84 
 
 		 421 aa  140  7e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  30.68 
 
 		 620 aa  122  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  27.75 
 
 		 597 aa  113  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  24.3 
 
 		 478 aa  94.7  5e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0762  potassium/proton antiporter  25.24 
 
 		 576 aa  93.6  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  27.6 
 
 		 596 aa  92.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0021  sodium/hydrogen exchanger  24.66 
 
 		 484 aa  91.3  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0381  potassium/proton antiporter  27.51 
 
 		 506 aa  90.5  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3191  potassium/proton antiporter  26.2 
 
 		 580 aa  88.6  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0827  sodium/hydrogen exchanger  27.57 
 
 		 605 aa  88.6  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0583075 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1203  potassium/proton antiporter  28.57 
 
 		 486 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.195277  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0650  sodium/hydrogen exchanger  26.61 
 
 		 492 aa  86.7  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.939557  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  28.04 
 
 		 597 aa  85.9  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  26.63 
 
 		 588 aa  85.1  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1079  potassium/proton antiporter  24.78 
 
 		 610 aa  84.7  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  25.2 
 
 		 581 aa  84.3  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  26.03 
 
 		 597 aa  84  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>