More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1778 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1813  aminotransferase class V  100 
 
 
385 aa  793    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.300679  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1778  aminotransferase, class V  100 
 
 
385 aa  793    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182739  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1287  aminotransferase, class V  75.19 
 
 
387 aa  590  1e-167  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17916  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  41.39 
 
 
384 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  40.39 
 
 
385 aa  288  1e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  38.2 
 
 
384 aa  280  4e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  37.93 
 
 
384 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  38.83 
 
 
382 aa  276  4e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  38.73 
 
 
383 aa  271  1e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  36.53 
 
 
387 aa  269  5.9999999999999995e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  38.08 
 
 
386 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  35.75 
 
 
387 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  37.05 
 
 
387 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  37.82 
 
 
382 aa  260  2e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  37.7 
 
 
384 aa  258  1e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  38.16 
 
 
382 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  38.16 
 
 
382 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  36.84 
 
 
382 aa  255  8e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  36.57 
 
 
382 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  35.95 
 
 
387 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  34.4 
 
 
385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  36.87 
 
 
385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  36.12 
 
 
382 aa  254  3e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  38.58 
 
 
385 aa  253  3e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  36.34 
 
 
397 aa  249  5e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  38.27 
 
 
382 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  36.77 
 
 
388 aa  246  4e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  35.77 
 
 
382 aa  246  6.999999999999999e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  35.6 
 
 
384 aa  245  8e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  35.71 
 
 
382 aa  241  1e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  37.36 
 
 
383 aa  241  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  33.78 
 
 
379 aa  241  2e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  35.57 
 
 
384 aa  241  2e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  35.56 
 
 
386 aa  240  4e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  34.08 
 
 
382 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  35.88 
 
 
383 aa  231  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  34.56 
 
 
380 aa  230  4e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  34.85 
 
 
382 aa  228  1e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  34.93 
 
 
363 aa  228  1e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  35.88 
 
 
380 aa  228  1e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  35.14 
 
 
395 aa  225  1e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  33.7 
 
 
387 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  34.14 
 
 
379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  34.37 
 
 
362 aa  218  2e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  33.6 
 
 
379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  34.36 
 
 
383 aa  216  4e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  32.37 
 
 
379 aa  216  7e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  35.9 
 
 
384 aa  215  9e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  33.07 
 
 
381 aa  215  9e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  30.79 
 
 
400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  33.42 
 
 
379 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  34.9 
 
 
380 aa  212  7e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  33.8 
 
 
362 aa  211  1e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  32.97 
 
 
380 aa  212  1e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  33.8 
 
 
362 aa  211  1e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  30.81 
 
 
391 aa  204  2e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3452  aminotransferase, class V  31.64 
 
 
391 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2489  putative serine--glyoxylate aminotransferase  30.34 
 
 
400 aa  202  6e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  31.84 
 
 
381 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  31.32 
 
 
399 aa  201  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  30.21 
 
 
396 aa  200  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  33.52 
 
 
360 aa  199  5e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  31.22 
 
 
394 aa  199  9e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0114  L-aspartate aminotransferase / phosphoserine aminotransferase  30.67 
 
 
395 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0418  Alanine--glyoxylate transaminase  32.56 
 
 
375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  32.72 
 
 
381 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0208  hypothetical protein  33.25 
 
 
387 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  29.5 
 
 
391 aa  196  5.000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2447  Serine--glyoxylate transaminase  31.27 
 
 
389 aa  195  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.372161 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  30.3 
 
 
406 aa  193  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4253  Serine--glyoxylate transaminase  30.3 
 
 
406 aa  193  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3001  Serine--glyoxylate transaminase  29.95 
 
 
406 aa  192  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000231297  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3325  serine--glyoxylate aminotransferase  29.69 
 
 
422 aa  191  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  30.87 
 
 
415 aa  191  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0386  aminotransferase class V  30.99 
 
 
360 aa  191  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.823228  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0969  aminotransferase class V  31.71 
 
 
374 aa  191  2e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.716227  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  29.52 
 
 
398 aa  191  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  29.51 
 
 
401 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  29.33 
 
 
401 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  29.24 
 
 
396 aa  189  5.999999999999999e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2906  aminotransferase class V  28.68 
 
 
414 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0053  aminotransferase, class V  34.02 
 
 
376 aa  186  4e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3418  Serine--glyoxylate transaminase  30.67 
 
 
400 aa  186  5e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  30.77 
 
 
421 aa  186  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1715  aminotransferase class V  30.59 
 
 
389 aa  186  7e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3052  Serine--glyoxylate transaminase  28.17 
 
 
413 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.160259 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1929  aminotransferase class V  32.96 
 
 
370 aa  184  3e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1762  aminotransferase class V  30.87 
 
 
412 aa  183  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.229115  normal  0.0159311 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5140  aminotransferase, class V  29.2 
 
 
406 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6210  Serine--glyoxylate transaminase  29.17 
 
 
396 aa  182  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.164021 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  32.68 
 
 
377 aa  182  7e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2699  serine-glyoxylate aminotransferase  29.74 
 
 
396 aa  182  7e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0056  aminotransferase, class V  33.7 
 
 
376 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  29.77 
 
 
417 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  30.21 
 
 
417 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4200  aminotransferase class V  30.7 
 
 
391 aa  181  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.357141 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  29.41 
 
 
396 aa  181  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4570  Serine--glyoxylate transaminase  30.7 
 
 
391 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0189325 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3022  aminotransferase, class V  28.65 
 
 
406 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2753  aminotransferase, class V  28.61 
 
 
406 aa  179  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.320291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>