More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1631 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1631  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 227 aa  456  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0039171  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  46.46 
 
 		 283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3002  two component transcriptional regulator  47.79 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.67465  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  46.9 
 
 		 235 aa  196  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1091  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.47 
 
 		 232 aa  191  8e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03101  two-component response regulator transcription regulator protein  48.9 
 
 		 226 aa  190  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1598  response regulator receiver  46.93 
 
 		 226 aa  191  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0990  transcriptional regulator  42.48 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000166767  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1458  two component transcriptional regulator  45.78 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  48.44 
 
 		 236 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.09 
 
 		 225 aa  185  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0419  two component transcriptional regulator  41.85 
 
 		 229 aa  185  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1496  response regulator receiver  45.33 
 
 		 222 aa  185  6e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.23196  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  44.3 
 
 		 225 aa  185  6e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1174  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.74 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.216853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.41 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  43.81 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1629  two-component response regulator  46.46 
 
 		 228 aa  182  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 		 240 aa  182  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 		 231 aa  182  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 224 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.23 
 
 		 223 aa  181  6e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03339  Response regulator consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain  39.38 
 
 		 226 aa  181  6e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2330  DNA-binding response regulator  43.42 
 
 		 228 aa  181  7e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5468  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.25 
 
 		 223 aa  181  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3379  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.69 
 
 		 223 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  41.15 
 
 		 224 aa  180  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1620  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 227 aa  181  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000174219  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 223 aa  180  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.61 
 
 		 225 aa  180  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2946  DNA-binding heavy metal response regulator  46.49 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1330  response regulator receiver  44.49 
 
 		 219 aa  180  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 406 aa  179  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0102  response regulator receiver protein  46.02 
 
 		 222 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0344  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.81 
 
 		 231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  41.15 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  44.05 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4783  two component transcriptional regulator  41.85 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000784885  unclonable  0.00000000984925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  44.05 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  44.05 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 		 255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0378  DNA-binding heavy metal response regulator  45.13 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4800  heavy metal response regulator  45.13 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185939 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 242 aa  179  4e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 231 aa  179  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1438  DNA-binding response regulator CzrR  45.61 
 
 		 224 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4392  two component transcriptional regulator  40.97 
 
 		 225 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0025821  decreased coverage  0.00000564878 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4283  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.61 
 
 		 224 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0230752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001641  putative two component response regulator transcription regulator protein  42.92 
 
 		 230 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.170142  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  40.62 
 
 		 224 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  46.19 
 
 		 224 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.81 
 
 		 228 aa  178  5.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.41 
 
 		 224 aa  178  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  45.58 
 
 		 225 aa  178  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  39.73 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.92 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.58 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3892  putative two-component response regulator  44.74 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  41.52 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0097  two component transcriptional regulator  39.38 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00144432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2440  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 		 222 aa  176  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0936231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4693  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.48 
 
 		 220 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3624  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.74 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.13 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0197  transcriptional activator protein, response regulator  40.97 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0086442  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1566  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.11 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435599 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  41.7 
 
 		 241 aa  176  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 		 270 aa  176  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1806  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.86 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0205791  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6519  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.69 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0435386 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.13 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.58 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.97 
 
 		 224 aa  175  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  45.74 
 
 		 224 aa  175  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 220 aa  176  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  45.81 
 
 		 227 aa  175  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0311  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 232 aa  175  6e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.280613 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4521  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.78 
 
 		 223 aa  175  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.315032 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0451  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.1 
 
 		 230 aa  174  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4258  response regulator receiver  41.52 
 
 		 220 aa  174  7e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0567705  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0047  DNA-binding heavy metal response regulator, putative  43.81 
 
 		 224 aa  174  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.116112  hitchhiker  0.00000494979 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.81 
 
 		 224 aa  174  8e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0868462 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 225 aa  174  8e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2069  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.69 
 
 		 228 aa  174  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0102482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.39 
 
 		 224 aa  174  8e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.81 
 
 		 224 aa  174  8e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.382659  hitchhiker  0.0034413 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0632  two component transcriptional regulator  40.43 
 
 		 227 aa  174  8e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0064  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.81 
 
 		 224 aa  174  8e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118539 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0604  two component transcriptional regulator  40.43 
 
 		 227 aa  174  8e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4369  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.74 
 
 		 224 aa  174  8e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732935 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5873  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  44.69 
 
 		 228 aa  174  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2474  heavy metal response regulator  40.62 
 
 		 223 aa  174  9e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4663  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.58 
 
 		 225 aa  174  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180214  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0944  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 		 225 aa  174  9e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.091613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31270  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  42.41 
 
 		 221 aa  174  9e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.249814 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1815  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.25 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275759  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2913  two component transcriptional regulator  41.59 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0379396  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.13 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>