52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0687 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0687  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 293 aa  600  1e-170  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.50177  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2781  AraC family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 207 aa  113  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0106  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.38 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0383824  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2970  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3117 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0678  AraC family transcriptional regulator  24.13 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0974  AraC family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.323377  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4039  transcriptional regulator, AraC family  35.78 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0024992  normal  0.0177037 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0099  transcriptional regulator, AraC family  25.97 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0047  transcriptional regulator, AraC family  22.37 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.230347  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6191  transcriptional regulator, AraC family  30.05 
 
 		 282 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2463  transcriptional regulator, AraC family  34.41 
 
 		 248 aa  52.8  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  33.08 
 
 		 260 aa  52.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 271 aa  49.3  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2289  transcriptional regulator, AraC family  27.72 
 
 		 278 aa  48.9  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4454  helix-turn-helix domain-containing protein  26.13 
 
 		 280 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1097  AraC family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4510  transcriptional regulator, AraC family  22.92 
 
 		 268 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2241  helix-turn-helix domain-containing protein  28.41 
 
 		 277 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1684  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  22.1 
 
 		 288 aa  47.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.465215  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5221  AraC family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343965  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2318  AraC family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 278 aa  46.6  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0958  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.63 
 
 		 268 aa  47  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0644351  decreased coverage  0.00475018 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  22.11 
 
 		 271 aa  46.6  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2498  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 245 aa  46.6  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  29.27 
 
 		 269 aa  46.6  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5120  transcriptional regulator, AraC family  26.23 
 
 		 275 aa  46.2  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.282168 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4529  Helix-turn-helix, AraC domain protein  24.36 
 
 		 303 aa  46.2  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  26.02 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  33.82 
 
 		 272 aa  45.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  25.35 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  23.66 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.25 
 
 		 260 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01433  transcriptional regulator  36.25 
 
 		 242 aa  44.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.738294  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2310  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.141971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  25.53 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5515  transcriptional regulator, AraC family  21.28 
 
 		 291 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184351  normal  0.0529906 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  26.42 
 
 		 265 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1886  transcriptional regulator, AraC family  21.43 
 
 		 280 aa  43.9  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.979359  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  28.87 
 
 		 269 aa  43.5  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2597  transcriptional regulator, AraC family  28.26 
 
 		 253 aa  43.5  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00366269  normal  0.225275 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3966  AraC family transcriptional regulator  22.43 
 
 		 276 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0381394 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4026  AraC family transcriptional regulator  22.43 
 
 		 276 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546725  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4602  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 279 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0287774  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2599  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 343 aa  42.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 265 aa  42.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1669  PAS fold-4 domain protein  34.88 
 
 		 261 aa  42.7  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4130  putative transcriptional regulator  29.63 
 
 		 265 aa  42.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0033  transcriptional regulator, AraC family  33.02 
 
 		 281 aa  42.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5692  transcriptional regulator, AraC family  24.66 
 
 		 271 aa  42.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0876527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3952  AraC family transcriptional regulator  22.43 
 
 		 262 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3448  transcriptional regulator, AraC family  30.85 
 
 		 281 aa  42.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>