76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3164 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3164  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  615  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2943  hypothetical protein  87.7 
 
 		 309 aa  552  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000846327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3288  hypothetical protein  62.3 
 
 		 308 aa  382  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4670  hypothetical protein  62.29 
 
 		 297 aa  366  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610067  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3190  hypothetical protein  60.39 
 
 		 324 aa  353  2e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525581 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2969  hypothetical protein  57.88 
 
 		 324 aa  337  9.999999999999999e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4327  hypothetical protein  55.59 
 
 		 319 aa  315  5e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2206  hypothetical protein  58.42 
 
 		 336 aa  302  5.000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3287  hypothetical protein  48.88 
 
 		 322 aa  253  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0390  hypothetical protein  45.17 
 
 		 318 aa  246  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.752733 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2084  hypothetical protein  45.45 
 
 		 322 aa  239  4e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5886  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  30.77 
 
 		 361 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.695825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  24.9 
 
 		 543 aa  66.2  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1117  dienelactone hydrolase-like protein  28.57 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.218404  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  32.56 
 
 		 607 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  29.29 
 
 		 568 aa  62.8  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  37.96 
 
 		 347 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  38.98 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  36.79 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1126  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  29.51 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  29.81 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  31.03 
 
 		 551 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1237  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.96 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136395  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2163  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  27.2 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0271635  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  35.65 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  28.86 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  29.71 
 
 		 547 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  31.82 
 
 		 546 aa  55.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0309  putative lipoprotein signal peptide  36.97 
 
 		 352 aa  55.1  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.45814 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  24.91 
 
 		 382 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  24.34 
 
 		 569 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2227  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  26.8 
 
 		 488 aa  54.7  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  27.4 
 
 		 567 aa  53.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18539  predicted protein  31.87 
 
 		 713 aa  53.5  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0118293  decreased coverage  0.000205789 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  33.05 
 
 		 328 aa  53.1  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1800  protein of unknown function DUF1400  26.02 
 
 		 542 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  32.85 
 
 		 318 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3459  carboxylic ester hydrolase  25.25 
 
 		 456 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.675018  hitchhiker  1.26241e-19 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  32.85 
 
 		 318 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  31.86 
 
 		 568 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  29.32 
 
 		 601 aa  52  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1079  hypothetical protein  26.27 
 
 		 369 aa  52  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000122089  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  25.66 
 
 		 600 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  29.81 
 
 		 526 aa  51.6  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1195  hypothetical protein  30.77 
 
 		 289 aa  51.2  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0219721  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  25.58 
 
 		 565 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1888  carboxylic ester hydrolase  27.87 
 
 		 456 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  32.12 
 
 		 318 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  24.04 
 
 		 605 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  25.66 
 
 		 600 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4065  putative hydrolase, putative exported protein  30.05 
 
 		 336 aa  50.4  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263411  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  28.57 
 
 		 572 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0630  hypothetical protein  36.52 
 
 		 410 aa  49.3  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  27.19 
 
 		 572 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  24.69 
 
 		 545 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5818  hypothetical protein  33.91 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  26.23 
 
 		 567 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  32.76 
 
 		 365 aa  47.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2228  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  26.45 
 
 		 406 aa  48.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0076  hypothetical protein  33.61 
 
 		 341 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15541  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4221  hypothetical protein  27.81 
 
 		 407 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263447  hitchhiker  0.00109479 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1192  hypothetical protein  32.47 
 
 		 316 aa  47.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0593  hydrolase protein  33.33 
 
 		 320 aa  47  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4877  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.68 
 
 		 396 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30181  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.71 
 
 		 505 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.157772 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2838  hypothetical protein  28.3 
 
 		 348 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540199  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  33.91 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1107  dienelactone hydrolase-like protein  24.07 
 
 		 369 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.12853  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  37.96 
 
 		 372 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  23.74 
 
 		 430 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2487  putative lipoprotein signal peptide  33.64 
 
 		 334 aa  43.5  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0944  dienelactone hydrolase-like  30.16 
 
 		 318 aa  43.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  24.53 
 
 		 343 aa  42.7  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1295  hypothetical protein  24.58 
 
 		 369 aa  42.7  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.103756  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0469  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.08 
 
 		 638 aa  42.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5444  hypothetical protein  29.48 
 
 		 327 aa  42.4  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0680915  normal  0.105622 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>