More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1563 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1563  ATP synthase F1, epsilon subunit  100 
 
 
134 aa  268  1e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000113638  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1087  ATP synthase F1, epsilon subunit  41.54 
 
 
136 aa  97.4  6e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0027  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.2 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1423  ATP synthase F1, epsilon subunit  36.64 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3149  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.29 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4897  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.92 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.271639 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.35 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0904  ATP synthase F1, epsilon subunit  31.37 
 
 
171 aa  63.9  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.112177  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17790  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.24 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4239  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.21 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.785039  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2756  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.06 
 
 
148 aa  63.9  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3751  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000167376  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3186  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.38 
 
 
138 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0578931  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3844  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.21 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000154563 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3405  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.31 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0114  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.54 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.693828  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0084  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.62 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.78895  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3511  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.45 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000312684 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0874  ATP synthase F1, epsilon subunit  36.89 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0273  ATP synthase F1, epsilon subunit  30.71 
 
 
134 aa  62.8  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.16135  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4746  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.21 
 
 
142 aa  61.6  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3656  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.16 
 
 
136 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3710  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.16 
 
 
136 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.737709  normal  0.337608 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3493  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.45 
 
 
138 aa  61.6  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000220298  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3924  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.21 
 
 
142 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0244651 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4016  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.21 
 
 
142 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.821379  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4129  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.21 
 
 
142 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.734658  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3345  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.63 
 
 
138 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00950448  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0758  ATP synthase F1, epsilon subunit, putative  30.39 
 
 
171 aa  61.2  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3955  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.82 
 
 
142 aa  61.2  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0052877  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3525  ATP synthase F1, epsilon subunit  39.56 
 
 
125 aa  60.8  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.012932 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3414  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.65 
 
 
133 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3510  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.92 
 
 
140 aa  60.8  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3169  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.54 
 
 
138 aa  60.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00353797  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0023  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.25 
 
 
138 aa  60.8  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.187642  hitchhiker  0.000120688 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4485  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.05 
 
 
142 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.541695  hitchhiker  0.00000768605 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3058  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.19 
 
 
140 aa  60.8  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4044  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.01 
 
 
142 aa  60.5  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.757579  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4195  ATP synthase F1, epsilon subunit  37 
 
 
140 aa  60.1  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4364  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.47 
 
 
142 aa  60.5  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.788281  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4309  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.47 
 
 
142 aa  60.5  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000882186 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16291  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.45 
 
 
134 aa  60.5  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4365  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.47 
 
 
142 aa  60.1  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.49232  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4506  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.47 
 
 
142 aa  60.5  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.107248 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16411  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.45 
 
 
134 aa  60.1  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.662603  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3492  ATP synthase F1, epsilon subunit  30.28 
 
 
152 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0175018  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4617  ATP synthase F1, epsilon subunit  27.82 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002031  ATP synthase epsilon chain  29.25 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2868  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.32 
 
 
140 aa  60.1  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0028  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  38.75 
 
 
88 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3316  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.96 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0532539  normal  0.0655418 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4175  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.77 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.295254  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03114  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.01 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4201  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.77 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.110385  normal  0.374799 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0009  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.31863  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0421  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.35 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4227  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.77 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5412  ATP synthase F1, epsilon subunit  30.28 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.782662 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3021  ATP synthase F1, epsilon subunit  30.09 
 
 
149 aa  58.2  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4548  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.77 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.91 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.952205  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3735  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.04 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4874  ATP synthase F1, epsilon subunit  30.28 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0423  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.38 
 
 
143 aa  58.2  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0484  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.38 
 
 
143 aa  58.2  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3026  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.91 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3893  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.96 
 
 
141 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159746  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4258  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.64 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3130  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.23 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4190  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2164  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.48 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00420  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.3 
 
 
140 aa  57.8  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03615  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36 
 
 
139 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.901981  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4236  ATP synthase F1, epsilon subunit  36 
 
 
139 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4074  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36 
 
 
137 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69427  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4263  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36 
 
 
139 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  0.317947 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03559  hypothetical protein  36 
 
 
139 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.772502  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4195  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36 
 
 
137 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5167  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36 
 
 
139 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0939649 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4099  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36 
 
 
139 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.420004 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3947  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36 
 
 
139 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4254  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36 
 
 
137 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4246  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36 
 
 
139 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.014203  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4089  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36 
 
 
139 aa  57  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4145  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36 
 
 
139 aa  57  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2053  ATP synthase F1, epsilon subunit  29 
 
 
163 aa  57  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.376983  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3949  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.54 
 
 
138 aa  57  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3994  ATP synthase F1, epsilon subunit  39.77 
 
 
140 aa  57  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.305683  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3302  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.78 
 
 
134 aa  57  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2423  ATP synthase F1, epsilon subunit, putative  29 
 
 
163 aa  57  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.72522  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.59 
 
 
139 aa  57  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.929878  normal  0.384385 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2176  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.29 
 
 
134 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0466412  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2138  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.29 
 
 
134 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0782971  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3283  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.62 
 
 
141 aa  56.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0505  ATP synthase F1, epsilon subunit  25.98 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.250005 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4133  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490759  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0198  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.96 
 
 
138 aa  57  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1508  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.92 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1402  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.06 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.537501  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4034  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.54 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000113371 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>