68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0018 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0018  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 		 202 aa  402  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0325  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.81 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2737  chromosome segregation and condensation protein ScpA  22.92 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.577112  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2184  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.13 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  23.81 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0593  condensin subunit ScpA  27.6 
 
 		 339 aa  64.7  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  22.75 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0748  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.24 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0457996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1011  condensin subunit ScpA  24.26 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0026  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.06 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1498  condensin subunit ScpA  24.09 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00138218  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1340  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.07 
 
 		 386 aa  55.5  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0528  chromosome segregation and condensation protein ScpA  20.47 
 
 		 322 aa  53.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.769453  normal  0.399884 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06800  hypothetical protein  36.36 
 
 		 313 aa  53.1  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.147317  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3703  chromosome segregation and condensation protein ScpA  20.9 
 
 		 248 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2588  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.43 
 
 		 405 aa  52  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342818  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1327  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.86 
 
 		 263 aa  51.2  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.583538  normal  0.373498 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  28.8 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  28.57 
 
 		 247 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  28.57 
 
 		 247 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  28.57 
 
 		 247 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  28.57 
 
 		 247 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  28.57 
 
 		 247 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  29.6 
 
 		 247 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  29.6 
 
 		 247 aa  49.3  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  29.6 
 
 		 247 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2457  condensin subunit ScpA  23.42 
 
 		 283 aa  49.3  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.27105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  29.6 
 
 		 247 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  29.6 
 
 		 247 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  24.68 
 
 		 254 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4345  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.95 
 
 		 254 aa  48.5  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.331059 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1382  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.45 
 
 		 285 aa  48.9  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0547025  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0886  hypothetical protein  25 
 
 		 247 aa  48.5  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.855762  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2060  segregation and condensation protein A  26.78 
 
 		 248 aa  48.1  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.721203  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1974  condensin subunit ScpA  20.7 
 
 		 278 aa  48.1  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.776999 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1774  segregation and condensation protein A  27.62 
 
 		 248 aa  47.8  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01791  hypothetical protein  24.69 
 
 		 277 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1566  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.2 
 
 		 243 aa  47.4  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0721026  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3001  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.55 
 
 		 364 aa  47.4  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.428168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09620  hypothetical protein  22.92 
 
 		 259 aa  46.6  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0183259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0059  condensin subunit ScpA  35 
 
 		 222 aa  45.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.52 
 
 		 267 aa  45.8  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01701  hypothetical protein  23.87 
 
 		 273 aa  45.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01681  hypothetical protein  23.46 
 
 		 273 aa  45.1  0.0007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.450973  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2584  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.75 
 
 		 259 aa  45.1  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000515385  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2815  chromosome segregation and condensation protein ScpA  23.32 
 
 		 286 aa  44.7  0.0009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.036308  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0721  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.82 
 
 		 304 aa  44.3  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00886352  normal  0.0253766 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0764  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.33 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.705704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1736  chromosome segregation and condensation protein ScpA  22.67 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3492  condensin subunit ScpA  23.32 
 
 		 286 aa  44.3  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.367211  normal  0.705468 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1838  chromosome segregation and condensation protein ScpA  22.87 
 
 		 297 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1022  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.72 
 
 		 251 aa  44.3  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.39 
 
 		 285 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3839  condensin subunit ScpA  22.42 
 
 		 283 aa  42.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1832  hypothetical protein  25.47 
 
 		 245 aa  42.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.85577  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1959  condensin subunit ScpA  28.57 
 
 		 266 aa  43.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000817707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.39 
 
 		 285 aa  42.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2196  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.56 
 
 		 290 aa  42.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444422  normal  0.714691 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01671  hypothetical protein  21.85 
 
 		 296 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1211  chromosome segregation and condensation protein ScpA  23.81 
 
 		 291 aa  42  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000668122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0829  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.25 
 
 		 222 aa  42  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1011  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.89 
 
 		 291 aa  42  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1079  chromosome segregation and condensation protein ScpA  21 
 
 		 276 aa  42  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2356  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.22 
 
 		 290 aa  41.6  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.226731 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2488  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.22 
 
 		 290 aa  41.6  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963803  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1464  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.25 
 
 		 224 aa  41.6  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3487  condensin subunit ScpA  22.62 
 
 		 291 aa  41.6  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0951  chromosome segregation and condensation protein ScpA  20.24 
 
 		 256 aa  41.2  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>