More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0455 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0455  50S ribosomal protein L21  100 
 
 
104 aa  201  3e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000169225  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1370  50S ribosomal protein L21  90.38 
 
 
104 aa  186  1e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000286753  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1180  50S ribosomal protein L21  76.92 
 
 
104 aa  159  9e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00135426  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1192  50S ribosomal protein L21  71.29 
 
 
102 aa  147  5e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000108547  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  65.35 
 
 
102 aa  140  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  65.35 
 
 
102 aa  140  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  65.35 
 
 
102 aa  140  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  65.35 
 
 
102 aa  140  8e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  65.35 
 
 
102 aa  140  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  65.35 
 
 
102 aa  140  8e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  65.35 
 
 
102 aa  140  8e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  65.35 
 
 
102 aa  140  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  63.37 
 
 
102 aa  135  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  63.37 
 
 
102 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  63.37 
 
 
102 aa  135  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  66.67 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  63.37 
 
 
102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  62.38 
 
 
102 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1326  50S ribosomal protein L21P  65.66 
 
 
99 aa  126  1.0000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000107304  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0957  50S ribosomal protein L21P  60.61 
 
 
100 aa  119  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000239901  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1211  50S ribosomal protein L21  60.4 
 
 
102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000816286  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  57 
 
 
102 aa  114  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  55.88 
 
 
103 aa  111  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1704  50S ribosomal protein L21  58.42 
 
 
102 aa  111  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000276664  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1737  50S ribosomal protein L21  58.42 
 
 
102 aa  111  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000015429  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0412  50S ribosomal protein L21  54.46 
 
 
100 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 
103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 
103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 
102 aa  105  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0205  50S ribosomal protein L21  52 
 
 
100 aa  106  1e-22  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1452  ribosomal protein L21  52.48 
 
 
103 aa  106  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000564167  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  55 
 
 
105 aa  105  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 
103 aa  105  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl441  50S ribosomal protein L21  55.45 
 
 
99 aa  105  2e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304369  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  49.52 
 
 
114 aa  104  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  48.08 
 
 
149 aa  103  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  49.5 
 
 
104 aa  102  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 
102 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 
102 aa  100  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 
101 aa  99.4  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 
104 aa  99.4  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0484  ribosomal protein L21  51.46 
 
 
105 aa  99.4  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.239256  normal  0.0811402 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  50.98 
 
 
103 aa  98.6  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 
103 aa  98.2  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 
104 aa  98.2  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 
102 aa  97.8  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 
102 aa  97.8  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  49.5 
 
 
103 aa  97.1  8e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  50 
 
 
103 aa  97.1  8e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  48.54 
 
 
131 aa  96.7  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 
103 aa  96.3  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0646  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 
130 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362263  normal  0.661162 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 
102 aa  96.3  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 
102 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 
103 aa  95.9  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 
103 aa  95.5  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0231  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 
104 aa  95.9  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0497  ribosomal protein L21  54.55 
 
 
98 aa  95.9  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2670  50S ribosomal protein L21  45.45 
 
 
123 aa  95.5  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000122926  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 
105 aa  94.7  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4328  50S ribosomal protein L21  50.96 
 
 
138 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.665904 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2652  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 
103 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0214685  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  48.57 
 
 
132 aa  94.7  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2695  50S ribosomal protein L21  47.47 
 
 
120 aa  94.4  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171739  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  50.98 
 
 
103 aa  94  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 
102 aa  93.6  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  48 
 
 
103 aa  94  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 
103 aa  94  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 
102 aa  93.6  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf326  50S ribosomal protein L21  48.48 
 
 
101 aa  93.2  1e-18  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.858976  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 
103 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 
103 aa  92.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  45.1 
 
 
103 aa  92.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3449  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 
103 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00752607  hitchhiker  0.00404832 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1320  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 
103 aa  92.4  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0375246  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  45.1 
 
 
104 aa  92.4  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0507  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 
103 aa  92.8  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  45.19 
 
 
104 aa  92.4  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 
103 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  45.1 
 
 
103 aa  91.7  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  50 
 
 
103 aa  91.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2001  50S ribosomal protein L21  44.44 
 
 
120 aa  92  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0536247  normal  0.99837 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3258  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 
103 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 
103 aa  91.3  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2523  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 
103 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444595  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1140  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 
103 aa  91.3  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3526  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 
103 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248668  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0446  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 
103 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1305  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 
103 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3490  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 
103 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761621  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 
103 aa  91.7  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  91.3  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2802  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 
103 aa  91.3  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000188755  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0551  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 
103 aa  91.3  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000001032  normal  0.0263071 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0509  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 
103 aa  91.3  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00322629  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3666  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 
103 aa  91.3  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000619372  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0099  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 
103 aa  91.3  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000205057  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  91.3  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0484  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 
103 aa  91.3  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00989792  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0581  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 
103 aa  91.3  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000178483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>