197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2077 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2077  Na+/H+ antiporter, putative  100 
 
 		 595 aa  1187    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4286  sodium/hydrogen exchanger family protein  39.44 
 
 		 596 aa  430  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0381852  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4667  sodium/hydrogen exchanger family protein  39.44 
 
 		 596 aa  430  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4654  sodium/hydrogen exchanger family protein  39.27 
 
 		 596 aa  428  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4781  sodium/hydrogen exchanger family protein  39.27 
 
 		 596 aa  428  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4369  sodium/hydrogen exchanger  38.92 
 
 		 596 aa  426  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4436  sodium/hydrogen exchanger family protein  39.09 
 
 		 596 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00005477  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4275  Na+/H+ exchanger (Na+/H+ antiporter)  39.09 
 
 		 596 aa  425  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2869  sodium/hydrogen exchanger  34.58 
 
 		 623 aa  271  2e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.824474  normal  0.920346 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0521  Sodium/hydrogen exchanger  29.62 
 
 		 604 aa  262  1e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0042  sodium/hydrogen exchanger  32.51 
 
 		 607 aa  254  4.0000000000000004e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126585  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0220  hypothetical protein  29.04 
 
 		 598 aa  249  9e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000727  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  28.88 
 
 		 599 aa  238  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1211  Sodium/hydrogen exchanger  30.7 
 
 		 611 aa  237  3e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0850  sodium/hydrogen exchanger  31.17 
 
 		 617 aa  236  9e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04922  Na+/K+/H+ antiporter  27.13 
 
 		 597 aa  236  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1024  Sodium/hydrogen exchanger  31.86 
 
 		 602 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30796  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4152  sodium/hydrogen exchanger  30.53 
 
 		 608 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561792 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16030  putative sodium/hydrogen antiporter  32.2 
 
 		 611 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1380  putative sodium/hydrogen antiporter  32.2 
 
 		 611 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00463957  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0868  Na(+):H(+) antiporter  30.56 
 
 		 606 aa  233  6e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0511  sodium/hydrogen exchanger  30.05 
 
 		 622 aa  233  6e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1072  sodium/hydrogen exchanger  30.08 
 
 		 601 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.558941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0127  sodium/hydrogen exchanger  30.78 
 
 		 760 aa  231  4e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.302904  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1467  sodium/hydrogen exchanger  30.27 
 
 		 601 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4254  sodium/hydrogen exchanger  30.27 
 
 		 601 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2318  sodium/hydrogen exchanger  28.62 
 
 		 599 aa  227  5.0000000000000005e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0395796  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0156  sodium/hydrogen exchanger  30.33 
 
 		 764 aa  222  9.999999999999999e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0146  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  30.13 
 
 		 763 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4282  sodium/hydrogen exchanger  30.28 
 
 		 609 aa  219  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2605  sodium/hydrogen exchanger  28.67 
 
 		 637 aa  217  4e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00858761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1982  sodium/hydrogen exchanger  28.52 
 
 		 619 aa  216  7e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0477  sodium/hydrogen exchanger  31.14 
 
 		 616 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0802705  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2324  sodium/hydrogen exchanger  30.75 
 
 		 670 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.339898  normal  0.580137 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0707  sodium/hydrogen exchanger  29.76 
 
 		 651 aa  214  2.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00461  Na+/H+ antiporter  28.7 
 
 		 569 aa  212  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1871  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.24 
 
 		 666 aa  212  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2537  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.75 
 
 		 669 aa  211  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19170  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  26.01 
 
 		 640 aa  211  3e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.490991  normal  0.0684118 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2147  sodium/hydrogen exchanger  30.35 
 
 		 670 aa  209  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251145  normal  0.368531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2224  sodium/hydrogen exchanger  30.35 
 
 		 673 aa  209  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00760493  normal  0.0969988 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0424  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 852 aa  208  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1998  sodium/hydrogen exchanger  28.14 
 
 		 616 aa  205  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112153 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3909  Na+/H+ antiporter  29.02 
 
 		 607 aa  204  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0759  sodium/hydrogen exchanger  29.77 
 
 		 584 aa  200  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135673  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4478  sodium/hydrogen exchanger  27.38 
 
 		 602 aa  199  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2400  sodium/hydrogen exchanger  30.06 
 
 		 625 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000130765  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1861  sodium/hydrogen exchanger  30.77 
 
 		 719 aa  195  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.182882  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2017  sodium/hydrogen exchanger  29.59 
 
 		 660 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000155921  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2321  sodium/hydrogen exchanger  29.59 
 
 		 660 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.545125  hitchhiker  0.000203679 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2065  sodium/hydrogen exchanger  29.59 
 
 		 660 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000562767  hitchhiker  0.000963897 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03225  Na(+):H(+) antiporter, CPA1 family protein  30.43 
 
 		 625 aa  191  5e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2308  sodium/hydrogen exchanger  29.59 
 
 		 660 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2109  sodium/hydrogen exchanger  26.78 
 
 		 643 aa  189  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1732  sodium/hydrogen exchanger  31.16 
 
 		 702 aa  186  9e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2891  sodium/hydrogen exchanger  30.48 
 
 		 652 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3229  sodium/hydrogen exchanger  30.48 
 
 		 652 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0859  sodium/hydrogen exchanger  28.44 
 
 		 640 aa  173  5.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1446  sodium/hydrogen exchanger  28.94 
 
 		 641 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2740  Sodium/hydrogen exchanger  27.84 
 
 		 629 aa  166  9e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  26.92 
 
 		 610 aa  166  9e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2292  sodium/hydrogen exchanger  27.52 
 
 		 637 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.042334  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  28.41 
 
 		 612 aa  165  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  26.18 
 
 		 741 aa  163  8.000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5185  sodium/hydrogen exchanger  27.73 
 
 		 660 aa  161  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0888  sodium/hydrogen exchanger  27.93 
 
 		 628 aa  157  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.043911 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3821  sodium/hydrogen exchanger  32.66 
 
 		 407 aa  151  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2394  Na+/H+ antiporter  32.28 
 
 		 593 aa  150  7e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00954713  hitchhiker  0.00302602 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0956  sodium/hydrogen exchanger  26.91 
 
 		 639 aa  145  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05361  CPA1 family Na+/H+ antiporter  32.02 
 
 		 399 aa  142  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  25.17 
 
 		 617 aa  140  4.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  27.81 
 
 		 617 aa  140  4.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0472  CPA1 family Na+/H+ antiporter  30.61 
 
 		 399 aa  138  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0494569  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04971  CPA1 family Na+/H+ antiporter  30.86 
 
 		 401 aa  131  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05271  CPA1 family Na+/H+ antiporter  30.86 
 
 		 401 aa  130  6e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0377759  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  27.92 
 
 		 628 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  27.98 
 
 		 630 aa  127  6e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  27.68 
 
 		 626 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06781  putative Na+/H+ antiporter, CPA1 family  28.81 
 
 		 421 aa  121  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04731  CPA1 family Na+/H+ antiporter  28.89 
 
 		 402 aa  110  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.281963  normal  0.831051 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1720  CPA1 family Na+/H+ antiporter  29.4 
 
 		 414 aa  110  8.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05281  CPA1 family Na+/H+ antiporter  28.33 
 
 		 414 aa  106  9e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0626531  normal  0.0646135 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1805  CPA1 family Na+/H+ antiporter  28.33 
 
 		 414 aa  106  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  24.06 
 
 		 478 aa  84.7  0.000000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0702  sodium/hydrogen exchanger  25.82 
 
 		 431 aa  83.6  0.000000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.429987  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0640  CPA1 family Na+/H+ antiporter  27.03 
 
 		 421 aa  81.3  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0869  sodium/hydrogen exchanger  26.63 
 
 		 417 aa  80.5  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0021  sodium/hydrogen exchanger  21.85 
 
 		 484 aa  75.9  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  35.26 
 
 		 620 aa  73.9  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0177  sodium/hydrogen exchanger  25.9 
 
 		 417 aa  73.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0762  potassium/proton antiporter  24.57 
 
 		 576 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3272  sodium/hydrogen exchanger  27 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  25.43 
 
 		 414 aa  69.7  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0483  sodium/hydrogen exchanger  23.6 
 
 		 419 aa  70.1  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  23.34 
 
 		 596 aa  68.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  22.91 
 
 		 597 aa  68.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3438  potassium/proton antiporter  24.71 
 
 		 616 aa  68.6  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  22.59 
 
 		 581 aa  68.2  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0702  sodium/hydrogen exchanger  25.15 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  23.46 
 
 		 581 aa  67.8  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>