More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3109 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3109  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 327 aa  642    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  39.11 
 
 		 1061 aa  157  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0633  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  34.39 
 
 		 1161 aa  136  5e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2036  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  33.76 
 
 		 1162 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5865  glycosyl transferase family 2  30.42 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1578  glycosyl transferase family 2  29.32 
 
 		 305 aa  118  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4927  glycosyl transferase family 2  32.9 
 
 		 309 aa  113  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640418  normal  0.791087 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2444  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4142  glycosyl transferase family 2  28.76 
 
 		 313 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000221538 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3646  glycosyl transferase family protein  31.06 
 
 		 507 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2861  glycosyl transferase family 2  33.5 
 
 		 305 aa  96.3  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0047  glycosyl transferase family 2  28.18 
 
 		 327 aa  96.3  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0045  glycosyl transferase family 2  28.18 
 
 		 327 aa  96.3  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.288326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3560  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 		 306 aa  94  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480294  normal  0.632112 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2189  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.66 
 
 		 303 aa  92  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016555  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2210  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  28.76 
 
 		 314 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149934  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2839  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 		 314 aa  91.7  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0441317  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3008  glycosyl transferase  32.37 
 
 		 303 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895358  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2313  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  28.33 
 
 		 314 aa  89.4  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0276977 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2424  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  28.88 
 
 		 314 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.126367  hitchhiker  0.000645643 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2311  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  28.88 
 
 		 314 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0283502  normal  0.0363291 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0841  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.913833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3103  glycosyl transferase family protein  32.22 
 
 		 322 aa  79  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.532387  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4286  glycosyl transferase family protein  31.45 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.131233 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4770  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 		 324 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2138  glycosyl transferase family protein  27.46 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.177505  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  26.78 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  27.96 
 
 		 705 aa  72  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0085  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0285695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0082  O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase, putative  31.22 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19572  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2354  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.05 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.218636  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2557  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 499 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1822  glycosyl transferase family protein  40.91 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  28.51 
 
 		 731 aa  66.6  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0596  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.26 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.300556  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  34.06 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  37.11 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3050  glycosyl transferase family protein  41.86 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1697  glycosyl transferase family 2  35.2 
 
 		 366 aa  65.9  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.696391  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 		 924 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  38.83 
 
 		 748 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  33.57 
 
 		 597 aa  64.3  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3249  glycosyl transferase family 2  39.53 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0399034  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  37.61 
 
 		 1435 aa  63.2  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 		 340 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 		 329 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  25.44 
 
 		 841 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0716  putative sugar transferase  38.46 
 
 		 448 aa  62  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1703  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2596  glycosyl transferase family 2  32.69 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 		 477 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  24.21 
 
 		 1152 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3148  glycosyl transferase family 2  39.53 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3216  glycosyl transferase family 2  35.65 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0149  glycosyl transferase family 2  37.29 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.473763 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  29.49 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  37.29 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  32.74 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  26.36 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  42.7 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  32.09 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 		 1739 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  24.21 
 
 		 1152 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 		 1359 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  24.75 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  32.76 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2264  glycosyl transferase family 2  35.96 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.135779 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  31.5 
 
 		 1340 aa  60.1  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  30.4 
 
 		 1523 aa  59.7  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0779  glycosyl transferase family 2  32.65 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  27.14 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3045  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144194  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1912  glycosyl transferase family 2  37.36 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  25.61 
 
 		 369 aa  59.3  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.86 
 
 		 355 aa  58.5  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4914  family 2 glycosyl transferase  23.05 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 		 632 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  31.97 
 
 		 663 aa  59.3  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  31.97 
 
 		 700 aa  58.9  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1772  glycosyl transferase family protein  32.77 
 
 		 264 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.293765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  21.77 
 
 		 346 aa  58.9  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  27.51 
 
 		 1759 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 		 1198 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1543  glycosyl transferase family protein  35.14 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  28.08 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  26.82 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  29.5 
 
 		 792 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  25.66 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08321  glycosyl transferase family protein  27.71 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.389273  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3457  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07290  hypothetical protein  24.08 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.43943  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  26.46 
 
 		 403 aa  57.4  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  34.75 
 
 		 777 aa  57.4  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0156  glycosyl transferase family protein  26.41 
 
 		 310 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  31.75 
 
 		 573 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  24.32 
 
 		 325 aa  57  0.0000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  36.97 
 
 		 349 aa  57  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>