54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07290 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_07290  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  533  1e-150  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.43943  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0047  glycosyl transferase family 2  29.11 
 
 
327 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0045  glycosyl transferase family 2  29.11 
 
 
327 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.288326  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5865  glycosyl transferase family 2  31.19 
 
 
292 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4770  glycosyl transferase family protein  27.86 
 
 
324 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4142  glycosyl transferase family 2  38.46 
 
 
313 aa  63.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000221538 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3646  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
507 aa  62.4  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2839  glycosyl transferase family protein  25.38 
 
 
314 aa  61.6  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0441317  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1578  glycosyl transferase family 2  36.28 
 
 
305 aa  58.5  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3109  glycosyl transferase family protein  24.08 
 
 
327 aa  58.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1549  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 
254 aa  52  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1178  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
535 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026276 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1090  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 
236 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11948  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0167  glycosyl transferase family 2  31.86 
 
 
365 aa  50.1  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00277804  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1206  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
521 aa  50.1  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.959652  normal  0.0123578 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2214  glycosyl transferase family 2  28.24 
 
 
371 aa  49.3  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3008  glycosyl transferase  24.76 
 
 
303 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895358  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  22.75 
 
 
694 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3929  glycosyl transferase family protein  33.73 
 
 
256 aa  47.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0354  glycosyl transferase family 2  24.31 
 
 
331 aa  46.6  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0588  glycosyl transferase family 2  36.9 
 
 
255 aa  46.6  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00392203  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4927  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 
309 aa  46.6  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640418  normal  0.791087 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0291  UDP-glucose--lipooligosaccharide beta 1-4 glucosyltransferase  33.33 
 
 
256 aa  46.2  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0225943  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2861  glycosyl transferase family 2  28.26 
 
 
305 aa  46.2  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0066  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.47 
 
 
260 aa  45.8  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000310001  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0228  glycosyl transferase family protein  24.42 
 
 
333 aa  46.2  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000082788  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  24.41 
 
 
430 aa  45.8  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4150  glycosyl transferase family protein  36.47 
 
 
260 aa  45.8  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021853  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  36.47 
 
 
260 aa  45.8  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000254421  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  22.02 
 
 
477 aa  45.8  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  26.06 
 
 
328 aa  45.8  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0328  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
257 aa  45.4  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06130  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  35.8 
 
 
252 aa  45.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0563  hypothetical protein  30.19 
 
 
227 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.559548  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001812  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  32.14 
 
 
255 aa  44.3  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.825658  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3832  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.72 
 
 
413 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.956349  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1549  glycosyl transferase family protein  29.59 
 
 
228 aa  44.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1057  glycosyl transferase family 2  30.11 
 
 
259 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11232  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  35.71 
 
 
324 aa  43.9  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.255662  normal  0.13294 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  22.94 
 
 
410 aa  43.5  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0390  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 
241 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0975071  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3178  glycosyl transferase family protein  23.59 
 
 
329 aa  43.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  33.72 
 
 
299 aa  43.5  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  36.49 
 
 
313 aa  42.7  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3473  glycosyl transferase family 2  24.88 
 
 
228 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  25.37 
 
 
272 aa  42.7  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  34.88 
 
 
528 aa  42.7  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1248  glycosyl transferase family protein  32.58 
 
 
249 aa  42.7  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.480822  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0991  glycosyl transferase family 2  26.15 
 
 
493 aa  42.7  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  30.21 
 
 
221 aa  42.4  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  29.07 
 
 
311 aa  42.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0426  glycosyl transferase family 2  28.3 
 
 
260 aa  42  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1866  glycosyl transferase family 2  26.21 
 
 
250 aa  42  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3745  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 
226 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>