More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1642 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  100 
 
 
174 aa  330  6e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  33.33 
 
 
206 aa  99  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  33.55 
 
 
162 aa  97.4  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  33.33 
 
 
194 aa  96.7  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  33.33 
 
 
166 aa  94.4  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  30.63 
 
 
175 aa  92.8  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  36.31 
 
 
181 aa  92.8  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0067  ATP synthase F0, B subunit  39.24 
 
 
175 aa  90.5  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  34.84 
 
 
168 aa  90.5  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  31.25 
 
 
175 aa  89.7  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  30.67 
 
 
238 aa  89.4  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  31.13 
 
 
166 aa  89.7  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  33.97 
 
 
181 aa  88.2  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  35.9 
 
 
167 aa  87.8  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  34.18 
 
 
178 aa  87.4  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  30.38 
 
 
175 aa  86.3  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  36.26 
 
 
159 aa  85.1  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  36.26 
 
 
159 aa  85.1  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  33.74 
 
 
195 aa  85.1  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  35.19 
 
 
200 aa  84.3  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  30.38 
 
 
175 aa  84  9e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 
171 aa  84  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  31.79 
 
 
167 aa  83.6  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  33.11 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 
175 aa  82.8  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  32.93 
 
 
194 aa  83.2  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  30.49 
 
 
164 aa  82  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2873  F0F1 ATP synthase subunit B  31.51 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.405678  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4016  ATP synthase F0, B subunit  36.97 
 
 
179 aa  80.9  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  27.59 
 
 
173 aa  80.1  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  29.68 
 
 
175 aa  80.5  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  27.59 
 
 
173 aa  80.1  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  32.73 
 
 
164 aa  80.5  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  30.12 
 
 
165 aa  80.5  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3676  ATP synthase F0, B subunit  34.78 
 
 
189 aa  80.5  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951735  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  30.38 
 
 
175 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  32.1 
 
 
179 aa  79.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2434  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
146 aa  79  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0912679  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  31.48 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  31.17 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52200  F0 sector of membrane-bound ATP synthase, subunit B  27.97 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  32.52 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  31.37 
 
 
164 aa  78.6  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  31.21 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0008  ATP synthase F0, B subunit  30.61 
 
 
157 aa  78.2  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.320711  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0180  F0F1 ATP synthase subunit B  30 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2144  F0F1 ATP synthase subunit B  30 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  31.48 
 
 
179 aa  77  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  27.89 
 
 
173 aa  75.9  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1937  F0F1 ATP synthase subunit B  31.85 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.385177  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  34.51 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0661  F0F1-type ATP synthase, subunit b  26.75 
 
 
176 aa  75.1  0.0000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.300947  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  26.9 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  30.82 
 
 
199 aa  74.7  0.0000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  33.96 
 
 
182 aa  74.3  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2452  ATP synthase F0, B subunit  31.65 
 
 
194 aa  74.7  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  29.81 
 
 
193 aa  74.3  0.0000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  34.59 
 
 
181 aa  74.3  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3634  ATP synthase F0, B subunit  34.52 
 
 
175 aa  73.9  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213902  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  31.08 
 
 
165 aa  74.3  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1799  ATP synthase F0, B subunit  37.18 
 
 
173 aa  73.6  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.402009  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  30.77 
 
 
168 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  29.3 
 
 
168 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  30.07 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  30.07 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  29.8 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  27.81 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  31.21 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  30.07 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  30.07 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  30.07 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  30.07 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  29.27 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  29.3 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  30.07 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  28.86 
 
 
156 aa  72  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3879  ATP synthase F0, B subunit  29.75 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000993244  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  28.48 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0749  ATP synthase F0, B subunit  33.33 
 
 
163 aa  70.9  0.000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246986  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  26.17 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  26.17 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5299  F0F1 ATP synthase subunit B  28.19 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5417  F0F1 ATP synthase subunit B  27.52 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.496413  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2748  F0F1 ATP synthase subunit B  28.38 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000265032  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5204  F0F1 ATP synthase subunit B  27.52 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228088  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5435  F0F1 ATP synthase subunit B  27.52 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  29.75 
 
 
193 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2342  ATP synthase F0, B subunit  34.13 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0063  ATP synthase F0 subunit B  26.24 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1266  ATP synthase F0, B subunit  32.95 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2609  ATP synthase F0, B subunit  34.13 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3740  ATP synthase F0, B subunit  30.07 
 
 
194 aa  68.6  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  29.73 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3309  F0F1 ATP synthase subunit B  29.14 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384998  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  26.39 
 
 
165 aa  67.4  0.00000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  28.93 
 
 
179 aa  67.4  0.00000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  38.31 
 
 
171 aa  67.4  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  26.17 
 
 
156 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  26.14 
 
 
156 aa  67  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  26.8 
 
 
156 aa  67  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>