52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1200 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1200  cupin 2, barrel  100 
 
 		 115 aa  226  7e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0363  hypothetical protein  27.88 
 
 		 130 aa  57  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.540367  normal  0.422558 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  50.67 
 
 		 277 aa  57  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4297  hypothetical protein  45.45 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2156  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.29 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.888659  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3536  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.35 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.541629  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1033  hypothetical protein  36.62 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0020  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.11 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1814  hypothetical protein  34.04 
 
 		 159 aa  51.6  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.255229  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1661  hypothetical protein  47.95 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4358  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.1 
 
 		 112 aa  50.8  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.437014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2051  hypothetical protein  38.03 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.889386  normal  0.46009 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1257  hypothetical protein  31.37 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5777  hypothetical protein  37.66 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4174  hypothetical protein  45.07 
 
 		 110 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257816  normal  0.271179 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1039  hypothetical protein  30.43 
 
 		 110 aa  48.9  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.67228  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21730  hypothetical protein, contains double-stranded beta-helix domain protein  37.61 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.769467 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0891  cupin 2, barrel  32.1 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.049809  normal  0.341782 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5772  hypothetical protein  32.14 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0681  hypothetical protein  27.06 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1894  hypothetical protein  30.39 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0914  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.07 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1699  hypothetical protein  32.08 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275263  normal  0.0722973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  32.67 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0361  hypothetical protein  32.1 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.642928  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0927  cupin 2 domain-containing protein  38.67 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474041  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1022  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.44 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4856  cupin 2 domain-containing protein  32.71 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5186  hypothetical protein  32.91 
 
 		 312 aa  43.9  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.41986  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0982  cupin 2 domain-containing protein  32.05 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0782  hypothetical protein  28.57 
 
 		 113 aa  43.5  0.0009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000506344  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0897  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.85 
 
 		 110 aa  43.5  0.0009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0275  hypothetical protein  28.44 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3944  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0892017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0496  hypothetical protein  33.04 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.41249 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4871  hypothetical protein  41.79 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468339  normal  0.0822888 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3238  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  33.04 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1759  hypothetical protein  38.71 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.048485  hitchhiker  0.00577747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4488  hypothetical protein  41.79 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.77 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4575  hypothetical protein  41.79 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.131851 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.77 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08250  cupin domain-containing protein  31.11 
 
 		 113 aa  41.6  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0145374  normal  0.40746 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2089  hypothetical protein  34.52 
 
 		 130 aa  41.6  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154794  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1252  hypothetical protein  26.53 
 
 		 113 aa  41.6  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00699027  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3670  cupin 2 domain-containing protein  28.85 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801583 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1863  cupin 2 domain-containing protein  30.93 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.524548 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0782  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.35 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0960825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  27.66 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1645  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.84 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125951  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1304  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 110 aa  40  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1005  cupin 2 domain-containing protein  28.41 
 
 		 114 aa  40  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>