187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3581 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 		 453 aa  904    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  47.33 
 
 		 500 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  44.19 
 
 		 451 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3583  MmgE/PrpD family protein  46.06 
 
 		 462 aa  309  5e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0329422 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4177  MmgE/PrpD family protein  36.02 
 
 		 441 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3986  MmgE/PrpD family protein  35.76 
 
 		 441 aa  249  6e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  38.1 
 
 		 462 aa  218  1e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  36.8 
 
 		 481 aa  211  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  34.77 
 
 		 488 aa  209  7e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6636  MmgE/PrpD family protein  36.79 
 
 		 457 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29162 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  36.08 
 
 		 483 aa  203  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3094  MmgE/PrpD family protein  35.8 
 
 		 453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  34.22 
 
 		 455 aa  194  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  34.99 
 
 		 456 aa  193  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  33.33 
 
 		 463 aa  192  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  31.53 
 
 		 490 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0113  MmgE/PrpD family protein  38.44 
 
 		 465 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  34.14 
 
 		 482 aa  186  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0206  MmgE/PrpD family protein  30.55 
 
 		 449 aa  184  3e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  36.06 
 
 		 456 aa  182  9.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  32.37 
 
 		 463 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  29.95 
 
 		 457 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  35.18 
 
 		 451 aa  176  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  31.41 
 
 		 456 aa  176  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  35.44 
 
 		 458 aa  173  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1585  MmgE/PrpD family protein  36.97 
 
 		 482 aa  173  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0449825  hitchhiker  0.00338638 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4268  MmgE/PrpD family protein  33.11 
 
 		 454 aa  168  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  28.47 
 
 		 449 aa  166  1.0000000000000001e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  27.71 
 
 		 446 aa  165  2.0000000000000002e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  33.89 
 
 		 451 aa  164  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  31.34 
 
 		 460 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4091  hypothetical protein  32.78 
 
 		 451 aa  162  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  34.03 
 
 		 443 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5175  hypothetical protein  32.93 
 
 		 453 aa  159  9e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0108  propionate catabolism protein  28.88 
 
 		 444 aa  157  3e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  27.38 
 
 		 446 aa  157  4e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6206  MmgE/PrpD family protein  32.08 
 
 		 451 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  33.94 
 
 		 442 aa  156  8e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0638  MmgE/PrpD family protein  34.65 
 
 		 443 aa  155  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  35.01 
 
 		 450 aa  155  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  26.26 
 
 		 446 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6810  MmgE/PrpD family protein  30.63 
 
 		 460 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  31.71 
 
 		 471 aa  152  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  30.86 
 
 		 450 aa  151  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4176  MmgE/PrpD family protein  31.97 
 
 		 450 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  35.19 
 
 		 503 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  35.19 
 
 		 503 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  31.14 
 
 		 451 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  34.94 
 
 		 458 aa  144  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  35.19 
 
 		 503 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3745  MmgE/PrpD family protein  33.24 
 
 		 442 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  35.34 
 
 		 458 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2365  MmgE/PrpD family protein  34.57 
 
 		 439 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3409  MmgE/PrpD family protein  35.19 
 
 		 455 aa  140  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  30.07 
 
 		 461 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  32.6 
 
 		 453 aa  137  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  31.54 
 
 		 458 aa  136  8e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  31.1 
 
 		 454 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  28.08 
 
 		 469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  35.13 
 
 		 447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0678  MmgE/PrpD family protein  36.82 
 
 		 444 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  31 
 
 		 470 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  33.57 
 
 		 445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  31.83 
 
 		 457 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  35.17 
 
 		 472 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  30.53 
 
 		 476 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3318  MmgE/PrpD family protein  32.83 
 
 		 477 aa  127  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501682  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3559  MmgE/PrpD family protein  35.25 
 
 		 442 aa  127  6e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.595946  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  33.15 
 
 		 486 aa  125  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  35.95 
 
 		 458 aa  125  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6631  MmgE/PrpD family protein  37.29 
 
 		 468 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  28.76 
 
 		 470 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  32.06 
 
 		 455 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  27.61 
 
 		 481 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  32.68 
 
 		 456 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6217  MmgE/PrpD family protein  32.55 
 
 		 461 aa  120  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  27.65 
 
 		 481 aa  119  9e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4443  MmgE/PrpD family protein  31.68 
 
 		 464 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  29.84 
 
 		 461 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  32.33 
 
 		 465 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  33.16 
 
 		 468 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  25.87 
 
 		 453 aa  116  8.999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4958  MmgE/PrpD family protein  31.6 
 
 		 464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  30.02 
 
 		 450 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  27.09 
 
 		 449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  29.2 
 
 		 468 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4102  hypothetical protein  31.49 
 
 		 461 aa  114  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  29.62 
 
 		 450 aa  114  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  28.93 
 
 		 501 aa  113  8.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  29.88 
 
 		 449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0288  putative MmgE/PrpD family protein  31.8 
 
 		 456 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  32.3 
 
 		 447 aa  110  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43263  hypothetical protein  23.83 
 
 		 481 aa  109  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  29.53 
 
 		 474 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  30.11 
 
 		 467 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  26.78 
 
 		 457 aa  104  4e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  31.29 
 
 		 462 aa  103  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  29.89 
 
 		 454 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2657  MmgE/PrpD  25.81 
 
 		 504 aa  100  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  29.95 
 
 		 454 aa  99.8  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>