More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2778 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  99.03 
 
 
413 aa  808  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
413 aa  820  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  45.36 
 
 
418 aa  313  2e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  40.48 
 
 
419 aa  295  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4705  glycosyl transferase group 1  37.62 
 
 
440 aa  252  7e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.625922 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3806  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
428 aa  240  3e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773329  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3429  glycosyl transferase group 1  34.53 
 
 
440 aa  238  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  36.08 
 
 
425 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  35.97 
 
 
425 aa  232  7e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3216  glycosyl transferase, group 1  35.6 
 
 
414 aa  229  6e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.573386  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 
441 aa  152  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  30.79 
 
 
447 aa  147  4e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  25.34 
 
 
778 aa  139  1e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  37.2 
 
 
445 aa  137  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  36.25 
 
 
403 aa  134  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  28.29 
 
 
452 aa  128  2e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4248  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 
405 aa  127  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.0976118 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 
409 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  32.24 
 
 
426 aa  122  1e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  29.44 
 
 
403 aa  119  8e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 
403 aa  119  8e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  35.42 
 
 
390 aa  115  2e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 
539 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4229  glycosyl transferase, group 1  31.05 
 
 
445 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  35.42 
 
 
391 aa  113  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 
414 aa  113  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  34.91 
 
 
415 aa  113  7e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  34.87 
 
 
393 aa  111  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 
415 aa  110  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  28.61 
 
 
401 aa  108  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 
403 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
401 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
404 aa  103  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0783  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 
782 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2716  glycosyl transferase group 1  29.53 
 
 
733 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  30.07 
 
 
384 aa  100  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 
392 aa  95.9  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.74 
 
 
397 aa  94.4  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 
403 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2400  glycosyl transferase, group 1  23.8 
 
 
452 aa  91.7  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  30.54 
 
 
401 aa  90.9  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
410 aa  89.7  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 
405 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 
391 aa  88.2  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2588  glycosyl transferase, group 1  24.94 
 
 
426 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 
394 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  35.03 
 
 
358 aa  86.3  1e-15  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3802  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 
466 aa  85.9  1e-15  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6868  glycosyl transferase group 1  29.56 
 
 
424 aa  85.5  2e-15  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4590  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 
462 aa  85.5  2e-15  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 
353 aa  85.5  2e-15  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3228  glycosyl transferase, group 1  26.95 
 
 
401 aa  84.7  2e-15  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.948731  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1093  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 
384 aa  84  5e-15  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6389  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 
387 aa  83.2  9e-15  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.447732  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0178  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
414 aa  82.4  1e-14  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0742938  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  29.56 
 
 
390 aa  82.4  1e-14  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  23.83 
 
 
392 aa  82.8  1e-14  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4490  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 
398 aa  82  2e-14  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2384  glycosyl transferase group 1  34.22 
 
 
374 aa  81.6  2e-14  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3815  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 
436 aa  81.6  2e-14  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.2599  normal  0.775775 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3446  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.89 
 
 
412 aa  82  2e-14  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 
390 aa  81.3  3e-14  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  30.15 
 
 
404 aa  80.9  4e-14  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
748 aa  80.5  5e-14  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1955  glycosyl transferase group 1  30.64 
 
 
768 aa  78.6  2e-13  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.303263  normal  0.277598 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  24.09 
 
 
375 aa  78.6  2e-13  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0177  glycosyl transferase group 1  25.11 
 
 
445 aa  78.6  2e-13  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0643614  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6400  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 
389 aa  78.6  2e-13  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  33.62 
 
 
398 aa  78.6  2e-13  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 
411 aa  78.2  3e-13  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  35.37 
 
 
350 aa  77.8  3e-13  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  31.38 
 
 
414 aa  77.4  4e-13  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3926  glycosyl transferase group 1  24.53 
 
 
410 aa  76.6  7e-13  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760133 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  32.76 
 
 
353 aa  76.6  7e-13  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  34 
 
 
346 aa  76.6  7e-13  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  30.38 
 
 
398 aa  75.9  1e-12  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5004  glycosyl transferase group 1  31.77 
 
 
435 aa  76.3  1e-12  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  3.72843e-05 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2766  glycosyl transferase group 1  32.47 
 
 
413 aa  75.9  1e-12  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.36427 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0250  glycosyl transferase, group 1  26.25 
 
 
374 aa  75.9  1e-12  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.430935  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
458 aa  75.9  1e-12  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  31.42 
 
 
366 aa  75.5  2e-12  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  38.38 
 
 
367 aa  75.5  2e-12  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2081  glycosyl transferase group 1  31.77 
 
 
374 aa  74.7  3e-12  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
413 aa  74.7  3e-12  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  34.27 
 
 
413 aa  74.3  3e-12  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  34.76 
 
 
395 aa  74.3  4e-12  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 
400 aa  74.3  4e-12  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0141  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 
374 aa  73.6  6e-12  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.191109  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  32.16 
 
 
381 aa  73.6  6e-12  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 
387 aa  73.6  7e-12  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  32.4 
 
 
395 aa  73.2  8e-12  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  33.7 
 
 
423 aa  72.8  9e-12  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 
377 aa  73.2  9e-12  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 
904 aa  73.2  9e-12  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  29.56 
 
 
371 aa  72.8  1e-11  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  26.89 
 
 
346 aa  72.4  1e-11  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3016  glycosyl transferase group 1  44.36 
 
 
373 aa  72.8  1e-11  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 
381 aa  72.8  1e-11  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
366 aa  71.6  2e-11  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 
394 aa  71.6  2e-11  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>