More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0365 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4374  aspartyl-tRNA synthetase  60.6 
 
 		 604 aa  717    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2557  aspartyl-tRNA synthetase  62.95 
 
 		 609 aa  775    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0413  aspartyl-tRNA synthetase  53.72 
 
 		 600 aa  649    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0868  aspartyl-tRNA synthetase  62.56 
 
 		 596 aa  793    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.925972  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0751  aspartyl-tRNA synthetase  66.05 
 
 		 595 aa  816    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.220186  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2364  aspartyl-tRNA synthetase  62.39 
 
 		 595 aa  725    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.769745  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2168  aspartyl-tRNA synthetase  62.44 
 
 		 604 aa  728    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271234  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2465  aspartyl-tRNA synthetase  61.71 
 
 		 604 aa  722    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.858075  normal  0.022913 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0672  aspartyl-tRNA synthetase  53.78 
 
 		 590 aa  659    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.301206  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0450  aspartyl-tRNA synthetase  61.69 
 
 		 599 aa  734    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1588  aspartyl-tRNA synthetase  66.72 
 
 		 590 aa  825    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.858986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2633  aspartyl-tRNA synthetase  80.88 
 
 		 590 aa  1008    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.530132  normal  0.0940983 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0815  aspartyl-tRNA synthetase  95.77 
 
 		 591 aa  1174    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3140  aspartyl-tRNA synthetase  65.06 
 
 		 623 aa  826    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545815 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3453  aspartyl-tRNA synthetase  67.23 
 
 		 591 aa  834    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0866598  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0209  aspartyl-tRNA synthetase  57 
 
 		 623 aa  695    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.789469 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2072  aspartyl-tRNA synthetase  61.41 
 
 		 606 aa  727    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0802  aspartyl-tRNA synthetase  65.6 
 
 		 595 aa  802    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.336028 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2496  aspartyl-tRNA synthetase  65.87 
 
 		 590 aa  816    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1338  aspartyl-tRNA synthetase  61.62 
 
 		 593 aa  739    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.427897  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0334  aspartyl-tRNA synthetase  53.28 
 
 		 590 aa  662    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3166  aspartyl-tRNA synthetase  78.38 
 
 		 591 aa  970    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1592  aspartyl-tRNA synthetase  63.48 
 
 		 601 aa  779    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0409967  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2336  aspartyl-tRNA synthetase  66.21 
 
 		 590 aa  820    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.544435  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3864  aspartyl-tRNA synthetase  66.38 
 
 		 590 aa  824    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.32606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2947  aspartyl-tRNA synthetase  66.89 
 
 		 590 aa  823    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2541  aspartyl-tRNA synthetase  65.71 
 
 		 595 aa  811    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0210193  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2111  aspartyl-tRNA synthetase  66.5 
 
 		 590 aa  837    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4486  aspartyl-tRNA synthetase  61.27 
 
 		 604 aa  721    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0635  aspartyl-tRNA synthetase  81.31 
 
 		 594 aa  1011    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.312658 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1751  aspartyl-tRNA synthetase  62.46 
 
 		 619 aa  756    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.96886  normal  0.294173 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4005  aspartyl-tRNA synthetase  60.6 
 
 		 614 aa  717    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.70537 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1251  aspartyl-tRNA synthetase  65.37 
 
 		 596 aa  799    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0677524 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1122  aspartyl-tRNA synthetase  67.12 
 
 		 594 aa  825    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403181  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0365  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 591 aa  1214    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.747846 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0043  aspartyl-tRNA synthetase  64.76 
 
 		 593 aa  785    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000554718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1104  aspartyl-tRNA synthetase  65.37 
 
 		 596 aa  802    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.507446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1396  aspartyl-tRNA synthetase  61.55 
 
 		 597 aa  735    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1258  aspartyl-tRNA synthetase  63.12 
 
 		 605 aa  778    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000886805 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2472  aspartyl-tRNA synthetase  95.77 
 
 		 591 aa  1174    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0952045 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0745  aspartyl-tRNA synthetase  66.05 
 
 		 595 aa  816    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0504  aspartyl-tRNA synthetase  59.34 
 
 		 625 aa  724    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0413061  normal  0.734988 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2183  aspartyl-tRNA synthetase  84.94 
 
 		 591 aa  1049    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.403701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3302  aspartyl-tRNA synthetase  64 
 
 		 607 aa  787    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0932  aspartyl-tRNA synthetase  54.47 
 
 		 605 aa  625  1e-178  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000107292  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0477  aspartyl-tRNA synthetase  51.86 
 
 		 588 aa  621  1e-177  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.0000000218693  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1469  aspartyl-tRNA synthetase  52.46 
 
 		 608 aa  612  9.999999999999999e-175  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000021993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1320  aspartyl-tRNA synthetase  53.99 
 
 		 604 aa  611  1e-173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0251551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1519  aspartyl-tRNA synthetase  52.46 
 
 		 605 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000463103  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1650  aspartyl-tRNA synthetase  53.27 
 
 		 606 aa  598  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1620  aspartyl-tRNA synthetase  52.95 
 
 		 601 aa  593  1e-168  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0865646  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1016  aspartyl-tRNA synthetase  51.18 
 
 		 608 aa  592  1e-168  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90482  normal  0.914473 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1543  aspartyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 		 581 aa  568  1e-160  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00178145  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 603 aa  504  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 		 589 aa  499  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 		 588 aa  499  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1411  aspartyl-tRNA synthetase  45.96 
 
 		 594 aa  497  1e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00209555  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3786  aspartyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 		 589 aa  491  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000017207  normal  0.0478066 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1351  aspartyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 		 600 aa  487  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21332  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0649  aspartyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 583 aa  478  1e-133  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.176198  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0968  aspartyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 592 aa  477  1e-133  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0743  aspartyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 		 583 aa  474  1e-132  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.853011  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0668  aspartyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 		 583 aa  472  1e-132  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.530416  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1981  aspartyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 585 aa  473  1e-132  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000379313  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3302  aspartyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 		 589 aa  474  1e-132  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 592 aa  475  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 		 619 aa  475  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 593 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 598 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3981  aspartyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 591 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0111519  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 591 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000271682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 589 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4411  aspartyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 591 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00200172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1359  aspartyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 		 583 aa  471  1.0000000000000001e-131  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.400527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 593 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 595 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 		 586 aa  471  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0643  aspartyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 598 aa  472  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100017  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 		 597 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_612  aspartyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 		 598 aa  466  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000641857  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1268  aspartyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 591 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.132766  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36730  aspartyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 591 aa  464  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0708  aspartyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 		 598 aa  465  1e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000309343  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 591 aa  463  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 591 aa  462  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 591 aa  462  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 590 aa  464  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 588 aa  463  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 596 aa  463  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 591 aa  462  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 591 aa  462  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 588 aa  463  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1196  aspartyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 584 aa  464  1e-129  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2187  aspartyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 		 590 aa  462  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000146204  normal  0.319945 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 591 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 591 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 627 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 599 aa  459  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 592 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 594 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>