More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3703 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3703  ABC-3 transporter component  100 
 
 		 290 aa  551  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.406266  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4558  hypothetical protein  62.99 
 
 		 290 aa  348  8e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0927  ABC-3 protein  64.41 
 
 		 290 aa  346  3e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426068  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3130  ABC-3 protein  66.67 
 
 		 291 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4708  ABC-3 protein  65.34 
 
 		 290 aa  337  9.999999999999999e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4829  hypothetical protein  64.29 
 
 		 291 aa  334  9e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0978  ABC-3 protein  65.73 
 
 		 295 aa  333  3e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0844  hypothetical protein  62.99 
 
 		 290 aa  332  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0721518 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3499  ABC-3 protein  67.96 
 
 		 288 aa  331  9e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1047  ABC-3 protein  65.96 
 
 		 295 aa  329  3e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160155 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3427  hypothetical protein  63.21 
 
 		 289 aa  328  5.0000000000000004e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1175  ABC-3 protein  65.96 
 
 		 295 aa  328  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0915  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems permease components  62.5 
 
 		 289 aa  323  2e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891696  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1340  ABC transporter permease  60.43 
 
 		 290 aa  321  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.562769 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2228  ABC-3 protein  63.03 
 
 		 289 aa  311  5.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1973  ABC transporter, membrane protein  56.99 
 
 		 293 aa  308  5.9999999999999995e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1596  ABC-3 protein  59.93 
 
 		 288 aa  308  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0434418 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2634  cation ABC transporter, permease protein  61.07 
 
 		 289 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059277  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5583  ABC-3 protein  64.87 
 
 		 288 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0895448  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2367  hypothetical protein  61.07 
 
 		 289 aa  305  7e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00313159  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2783  ABC-3 protein  59.36 
 
 		 291 aa  303  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.314797  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2471  ABC-3 protein  58.72 
 
 		 296 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0221  hypothetical protein  61.11 
 
 		 300 aa  302  4.0000000000000003e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.860948  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0179  ABC-3 protein  61.57 
 
 		 290 aa  300  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.958095 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1063  ABC transporter membrane spanning protein  60.5 
 
 		 290 aa  300  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21744  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5388  ABC-3 protein  64.55 
 
 		 288 aa  296  4e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  0.0641109 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3680  ABC-3 protein  58.78 
 
 		 284 aa  295  7e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0704  ABC-3 protein  57.09 
 
 		 286 aa  294  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.462722  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3531  ABC-3 protein  57.95 
 
 		 284 aa  293  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0622  ABC-3 protein  61.21 
 
 		 290 aa  292  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285827  normal  0.675779 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1311  ABC-3 protein  64.89 
 
 		 290 aa  292  5e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0677  ABC-3 protein  61.92 
 
 		 290 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697838  normal  0.0650939 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0654  ABC-3 protein  57.24 
 
 		 284 aa  288  6e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3391  ABC-3 protein  60.49 
 
 		 304 aa  282  5.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0468601  normal  0.064332 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1143  ABC-3 protein  54.9 
 
 		 294 aa  281  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1122  ABC-3 protein  58.36 
 
 		 285 aa  280  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000976582  unclonable  0.0000000110767 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2052  hypothetical protein  56.16 
 
 		 299 aa  278  9e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.146645  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5660  hypothetical protein  55.16 
 
 		 288 aa  253  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.721685  normal  0.0964649 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0351  ABC transporter, permease protein  49.25 
 
 		 290 aa  252  6e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3177  ABC-3 protein  53.66 
 
 		 287 aa  249  5e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0105  cation ABC transporter, permease protein  47.1 
 
 		 284 aa  228  6e-59  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.536532  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3561  ABC-3 protein  60.07 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  32.34 
 
 		 278 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  32.34 
 
 		 278 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  28.21 
 
 		 279 aa  149  5e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  34.72 
 
 		 304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  31.52 
 
 		 280 aa  140  3e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  30.39 
 
 		 278 aa  139  7e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  32.4 
 
 		 282 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  29.01 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  27.84 
 
 		 288 aa  137  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  27.84 
 
 		 288 aa  137  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  29.01 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  27.14 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  32.51 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  30.38 
 
 		 281 aa  136  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  30 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  32.52 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  32.81 
 
 		 289 aa  133  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  28.28 
 
 		 288 aa  134  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  31.71 
 
 		 283 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  32.98 
 
 		 285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  30.24 
 
 		 294 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  32.82 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2917  ABC-3 protein  34.27 
 
 		 285 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  27.56 
 
 		 297 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  27.56 
 
 		 297 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  27.56 
 
 		 297 aa  123  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1204  ABC-3 protein  32.75 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.604109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  29.03 
 
 		 290 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  29.03 
 
 		 290 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  31.03 
 
 		 281 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  33.22 
 
 		 276 aa  119  7e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2045  ABC-3 protein  31.67 
 
 		 278 aa  119  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00377513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  28.98 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  29.33 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2892  ABC-3 transporter component  33.22 
 
 		 285 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  29.18 
 
 		 282 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3017  chelated iron transport system membrane protein YfeD  29.18 
 
 		 282 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0681936 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  29.18 
 
 		 282 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0325  chelated iron ABC transporter, permease  27.2 
 
 		 280 aa  116  5e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  29.18 
 
 		 282 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  27.24 
 
 		 285 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  33.33 
 
 		 303 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  29.47 
 
 		 285 aa  115  7.999999999999999e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3053  chelated iron transport system membrane protein YfeD  29.18 
 
 		 282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0343678 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0908  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, inner membrane subunit SitD  34.11 
 
 		 282 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.457468  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  27.56 
 
 		 277 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  28.98 
 
 		 287 aa  112  5e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  29.47 
 
 		 285 aa  112  8.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  29.18 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1318  manganese transport system membrane protein MntB  29.07 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2566  ABC-3 protein  34.11 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.774032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  29.18 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3358  hypothetical protein  30.8 
 
 		 297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0130649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  30.45 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0246  ABC-3 protein  32.4 
 
 		 282 aa  109  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13210  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  32.17 
 
 		 276 aa  109  6e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  29.1 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  29.67 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>