57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0006 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0006  plasmid maintenance system antidote protein  100 
 
 		 380 aa  774    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1542  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.78 
 
 		 373 aa  340  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000135778  unclonable  0.000000000156625 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1441  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.72 
 
 		 371 aa  325  7e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000771176 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03612  Plasmid maintenance system antidote protein  40.76 
 
 		 371 aa  275  7e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5647  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  46.01 
 
 		 362 aa  273  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1016  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.7 
 
 		 385 aa  262  6e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1951  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.57 
 
 		 368 aa  241  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0275  DNA-binding protein  39.57 
 
 		 386 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1194  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.55 
 
 		 369 aa  231  2e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1548  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.99 
 
 		 363 aa  224  3e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2492  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.17 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0483  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.18 
 
 		 350 aa  182  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0212  hypothetical protein  33.7 
 
 		 368 aa  176  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4709  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.44 
 
 		 360 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.29865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1543  hypothetical protein  31.12 
 
 		 367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0317  hypothetical protein  28.33 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1808  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.75 
 
 		 358 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3332  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 		 292 aa  129  7.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3170  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.1 
 
 		 376 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19493  unclonable  0.0000000000000213391 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1079  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.69 
 
 		 361 aa  115  8.999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20190  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.04 
 
 		 228 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0033  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.99 
 
 		 334 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2453  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 409 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.253954  normal  0.726571 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0920  hypothetical protein  26.02 
 
 		 345 aa  75.5  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.409849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3421  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  22.97 
 
 		 383 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1982  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  47.22 
 
 		 116 aa  71.6  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.610111  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4195  putative transcription regulator with HTH domain protein  30.94 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0386  helix-turn-helix domain-containing protein  30.08 
 
 		 422 aa  67.8  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.375659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0814  helix-turn-helix domain-containing protein  29.45 
 
 		 425 aa  63.2  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00469966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4510  hypothetical protein  28.7 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0236  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.28 
 
 		 124 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0019  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.59 
 
 		 98 aa  54.3  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191318  normal  0.0141037 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0412  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 		 100 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0947  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 		 106 aa  51.6  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2261  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.13 
 
 		 76 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000446898  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0417  XRE family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 104 aa  50.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0579  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.53 
 
 		 101 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2430  plasmid maintenance system antidote protein  40 
 
 		 108 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216096  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4027  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.21 
 
 		 101 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0750  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 		 117 aa  47.8  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.236771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2764  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.88 
 
 		 95 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4756  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.84 
 
 		 100 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3311  plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 		 111 aa  47.4  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2894  addiction module antidote protein, HigA family  27.16 
 
 		 119 aa  47  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1906  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.11 
 
 		 100 aa  47.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000136892  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1291  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 98 aa  47  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2829  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.51 
 
 		 110 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0896969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0768  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.25 
 
 		 100 aa  45.8  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0571  XRE family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 107 aa  45.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0422  virulence-associated protein, putative  33.77 
 
 		 97 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0091  putative plasmid maintenance system antidote protein  21.4 
 
 		 408 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.838316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1009  hypothetical protein  26.28 
 
 		 319 aa  43.9  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0415  putative plasmid maintenance system antidote protein VapI  40.35 
 
 		 78 aa  43.5  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3225  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.58 
 
 		 106 aa  43.5  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.114466 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2564  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  46.67 
 
 		 116 aa  43.1  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.63579  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2896  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.73 
 
 		 95 aa  43.1  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543418 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3243  plasmid maintenance system antidote protein  32.05 
 
 		 102 aa  43.1  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0211861  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>