More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0374 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
226 aa  457  1e-128  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  99.56 
 
 
226 aa  457  1e-128  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  86.78 
 
 
227 aa  397  1e-110  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  66.98 
 
 
224 aa  292  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  67.44 
 
 
229 aa  284  8e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  48.86 
 
 
220 aa  211  6e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  49.33 
 
 
229 aa  211  8e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  49.33 
 
 
229 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  49.32 
 
 
220 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  49.33 
 
 
229 aa  205  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  50 
 
 
220 aa  205  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  47.95 
 
 
220 aa  204  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  49.32 
 
 
220 aa  204  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  49.32 
 
 
220 aa  204  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  49.32 
 
 
220 aa  204  8e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  50.49 
 
 
240 aa  204  9e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  46.54 
 
 
223 aa  203  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  47.49 
 
 
220 aa  202  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  50.71 
 
 
213 aa  202  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  49.04 
 
 
221 aa  201  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  49.04 
 
 
221 aa  201  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  46.08 
 
 
223 aa  200  1e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  48.83 
 
 
215 aa  199  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  49.53 
 
 
233 aa  199  4e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  50 
 
 
227 aa  198  5e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  47.32 
 
 
223 aa  198  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  48.08 
 
 
221 aa  197  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  50.48 
 
 
213 aa  197  1e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  50.95 
 
 
224 aa  195  5e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  49.28 
 
 
212 aa  193  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  48.82 
 
 
212 aa  192  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  47.03 
 
 
220 aa  188  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  46.23 
 
 
214 aa  183  2e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  46.23 
 
 
214 aa  183  2e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  44.5 
 
 
224 aa  161  7e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  41.15 
 
 
230 aa  158  6e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  40.47 
 
 
218 aa  156  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  40.85 
 
 
214 aa  155  5e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  43.5 
 
 
224 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  44.23 
 
 
218 aa  147  9e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4362  Phosphoglycerate mutase  42.86 
 
 
230 aa  146  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0562  phosphoglycerate mutase  41.08 
 
 
185 aa  133  2e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0434916 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  39.07 
 
 
237 aa  130  1e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  36.76 
 
 
214 aa  126  2e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  33.99 
 
 
208 aa  125  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  46.84 
 
 
208 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  42.11 
 
 
440 aa  122  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  39.23 
 
 
223 aa  122  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  40.1 
 
 
223 aa  122  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  38.69 
 
 
205 aa  122  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  49.68 
 
 
205 aa  121  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  36.72 
 
 
213 aa  120  1e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.63977e-06  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  37.68 
 
 
225 aa  120  2e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  38.5 
 
 
202 aa  119  5e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  5.9372e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  35.75 
 
 
188 aa  117  1e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  34.13 
 
 
217 aa  117  2e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 
209 aa  117  2e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  35.12 
 
 
208 aa  115  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  43.79 
 
 
198 aa  114  9e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  35.76 
 
 
206 aa  112  4e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  31.84 
 
 
209 aa  112  4e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  34.16 
 
 
207 aa  112  4e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0736  phosphoglycerate mutase (GpmB protein)-like  33.33 
 
 
208 aa  111  7e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 
220 aa  110  2e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  34.55 
 
 
215 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  34.55 
 
 
215 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  34.55 
 
 
215 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  34.55 
 
 
215 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  34.55 
 
 
215 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  34.8 
 
 
210 aa  108  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  27.41 
 
 
201 aa  108  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  40.38 
 
 
215 aa  108  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  47.1 
 
 
205 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  36.13 
 
 
207 aa  108  9e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  37.56 
 
 
192 aa  107  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  41.56 
 
 
378 aa  106  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 
215 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  40.21 
 
 
378 aa  107  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  45.81 
 
 
205 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  27.59 
 
 
233 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  36.41 
 
 
222 aa  106  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  36.41 
 
 
222 aa  106  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  42.5 
 
 
203 aa  105  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  38 
 
 
210 aa  105  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  44.23 
 
 
234 aa  105  6e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  33.84 
 
 
207 aa  104  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  35.68 
 
 
215 aa  104  9e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  35.68 
 
 
215 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  38.79 
 
 
225 aa  104  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  35.68 
 
 
215 aa  104  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  35.68 
 
 
215 aa  104  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  35.68 
 
 
215 aa  104  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  35.68 
 
 
215 aa  104  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  35.68 
 
 
215 aa  104  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  35.68 
 
 
215 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  34.31 
 
 
209 aa  104  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  35.68 
 
 
215 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  35.6 
 
 
207 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  29.56 
 
 
203 aa  102  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  34.87 
 
 
213 aa  102  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>