More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2597 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2597  nitrogenase iron protein  100 
 
 		 289 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.036256  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2907  nitrogenase iron protein  94.12 
 
 		 289 aa  557  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0795  nitrogenase iron protein  83.45 
 
 		 291 aa  499  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.835028  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1353  nitrogenase iron protein  71.17 
 
 		 292 aa  443  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000220216  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2008  nitrogenase iron protein  66.06 
 
 		 324 aa  397  1e-109  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.221735  normal  0.365396 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0095  Nitrogenase  62.59 
 
 		 299 aa  380  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2886  Nitrogenase  61.48 
 
 		 290 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0774  nitrogenase  60.92 
 
 		 290 aa  353  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0506  nitrogenase reductase-like protein  47.37 
 
 		 290 aa  294  1e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1616  NifH/frxC-family protein  49.24 
 
 		 276 aa  285  5e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1573  nitrogenase iron protein subunit NifH  54.1 
 
 		 284 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1152  nitrogenase reductase-like protein  47.37 
 
 		 292 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1528  nitrogenase reductase-like protein  47.72 
 
 		 313 aa  281  7.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0803  nitrogenase reductase-like protein  47.37 
 
 		 292 aa  281  8.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.186385  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1147  nitrogenase reductase-like protein  46.23 
 
 		 292 aa  277  1e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2120  nitrogenase iron protein  48.93 
 
 		 299 aa  276  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.109902 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1201  nitrogenase iron protein  48.34 
 
 		 273 aa  273  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1415  nitrogenase iron protein subunit NifH  52.31 
 
 		 296 aa  272  5.000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.210537 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4247  nitrogenase iron protein subunit NifH  49.45 
 
 		 296 aa  271  8.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.252394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4043  nitrogenase iron protein  47.23 
 
 		 273 aa  268  5e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0162942 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4488  nitrogenase iron protein subunit NifH  50 
 
 		 287 aa  269  5e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0165  nitrogenase iron protein subunit NifH  49.42 
 
 		 268 aa  268  7e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2083  nitrogenase  48.53 
 
 		 270 aa  268  1e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3030  nitrogenase iron protein  50.76 
 
 		 288 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3889  nitrogenase  46.55 
 
 		 288 aa  267  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.290532  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0834  nitrogenase reductase  50.57 
 
 		 276 aa  267  1e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1158  nitrogenase reductase  52.09 
 
 		 274 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3916  nitrogenase reductase  49.06 
 
 		 295 aa  265  4e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1023  nitrogenase iron protein  49.43 
 
 		 275 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3203  nitrogenase iron protein  52.71 
 
 		 288 aa  265  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2098  nitrogenase iron protein  49.08 
 
 		 292 aa  265  5.999999999999999e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6881  nitrogenase iron protein  48.87 
 
 		 289 aa  265  5.999999999999999e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0171  nitrogenase reductase  49.08 
 
 		 273 aa  265  8.999999999999999e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.217628  normal  0.670038 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01380  Nitrogenase iron protein  48.31 
 
 		 290 aa  265  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0237  Nitrogenase  47.79 
 
 		 272 aa  262  4e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.848648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3467  nitrogenase iron protein  47.97 
 
 		 288 aa  262  4.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1049  nitrogenase iron protein  47.97 
 
 		 275 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2821  nitrogenase iron protein  49.81 
 
 		 272 aa  261  6.999999999999999e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.436411  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4054  nitrogenase iron protein subunit NifH  46.42 
 
 		 324 aa  261  8.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00458685  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1202  nitrogenase iron protein subunit NifH  47.97 
 
 		 296 aa  261  8.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.451718  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1354  nitrogenase iron protein  49.06 
 
 		 296 aa  261  1e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3090  nitrogenase reductase  50.37 
 
 		 277 aa  261  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0685  nitrogenase reductase  51.75 
 
 		 274 aa  260  1e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3855  nitrogenase iron protein  47.96 
 
 		 326 aa  260  2e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430007  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1528  nitrogenase reductase  51.75 
 
 		 274 aa  260  2e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1019  nitrogenase reductase  50 
 
 		 274 aa  260  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855562  normal  0.490785 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1949  nitrogenase reductase  51.36 
 
 		 274 aa  260  2e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00645764  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1224  nitrogenase reductase-like protein  45.62 
 
 		 278 aa  259  3e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3771  nitrogenase iron protein  49.42 
 
 		 299 aa  259  3e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0377842  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4478  nitrogenase reductase  49.81 
 
 		 297 aa  259  4e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0143  nitrogenase iron protein  47.97 
 
 		 280 aa  259  4e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.343179  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0793  nitrogenase  47.43 
 
 		 280 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00476725  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0274  nitrogenase iron protein  47.94 
 
 		 291 aa  258  6e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23577  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1785  nitrogenase iron protein  47.14 
 
 		 296 aa  258  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0650  nitrogenase iron protein  51.16 
 
 		 288 aa  258  8e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1813  nitrogenase iron protein  47.14 
 
 		 296 aa  258  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02660  vanadium nitrogenase iron protein  50.39 
 
 		 290 aa  258  9e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1570  nitrogenase reductase  49.26 
 
 		 298 aa  258  1e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1627  nitrogenase reductase  50.58 
 
 		 274 aa  257  1e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000481616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1434  nitrogenase iron protein  46.43 
 
 		 283 aa  257  2e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1244  nitrogenase reductase  50.97 
 
 		 274 aa  257  2e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000240583  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1751  nitrogenase reductase  50.19 
 
 		 274 aa  256  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.555016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0491  nitrogenase iron protein  48.3 
 
 		 293 aa  255  6e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0969  nitrogenase reductase  49.62 
 
 		 299 aa  254  9e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1073  nitrogenase reductase  49.62 
 
 		 299 aa  254  9e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2364  nitrogenase iron protein  48.13 
 
 		 298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2613  nitrogenase reductase  49.08 
 
 		 276 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0561  nitrogenase iron protein  48.73 
 
 		 276 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000368653  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1937  nitrogenase  47.06 
 
 		 272 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.894359  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3534  nitrogenase reductase  48.13 
 
 		 299 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332377  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4463  nitrogenase reductase  49.25 
 
 		 300 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1246  nitrogenase reductase  47.04 
 
 		 312 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.944984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0744  nitrogenase reductase  50.58 
 
 		 274 aa  252  4.0000000000000004e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49000  nitrogenase reductase  45.93 
 
 		 275 aa  252  5.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1038  nitrogenase iron protein subunit NifH  44.53 
 
 		 264 aa  252  6e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2074  nitrogenase iron protein  49.61 
 
 		 289 aa  252  6e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0658  nitrogenase reductase  45.59 
 
 		 275 aa  251  8.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0493156  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2145  nitrogenase iron protein  49.61 
 
 		 289 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.936237 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1240  nitrogenase reductase  47.06 
 
 		 296 aa  251  9.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.118183 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1522  nitrogenase reductase  47.06 
 
 		 296 aa  251  9.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2821  nitrogenase iron protein  50 
 
 		 289 aa  251  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2192  nitrogenase reductase  47.39 
 
 		 291 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.866269  normal  0.548044 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0541  nitrogenase reductase  47.39 
 
 		 291 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72124  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4930  nitrogenase reductase  47.01 
 
 		 295 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1803  nitrogenase reductase  45.22 
 
 		 275 aa  250  2e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.736404  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1142  nitrogenase iron protein  49.24 
 
 		 276 aa  250  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.442855  normal  0.809863 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3996  nitrogenase reductase  47.39 
 
 		 299 aa  249  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5101  nitrogenase reductase  47.39 
 
 		 298 aa  248  6e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4136  nitrogenase iron protein subunit NifH  48.26 
 
 		 296 aa  248  6e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0109879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1218  nitrogenase iron protein  48.06 
 
 		 288 aa  248  9e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0662  nitrogenase iron protein subunit NifH  48.45 
 
 		 289 aa  247  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.24324  normal  0.221237 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2610  nitrogenase reductase  44.28 
 
 		 275 aa  246  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.343866  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1175  nitrogenase iron protein  48.45 
 
 		 289 aa  246  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4046  nitrogenase iron protein  47.55 
 
 		 275 aa  246  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.316801  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0473  nitrogenase reductase  46.07 
 
 		 290 aa  245  4.9999999999999997e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.686958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1178  nitrogenase  42.91 
 
 		 264 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0088  nitrogenase reductase  46.27 
 
 		 303 aa  245  6e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.55556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4684  nitrogenase reductase  45.22 
 
 		 275 aa  245  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0065  nitrogenase reductase  44.49 
 
 		 275 aa  245  6e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0143  nitrogenase reductase  46.27 
 
 		 293 aa  245  6.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>