290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3889 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3889  nitrogenase  100 
 
 
288 aa  587  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.290532  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2886  Nitrogenase  51.84 
 
 
290 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0774  nitrogenase  49.47 
 
 
290 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2008  nitrogenase iron protein  47.65 
 
 
324 aa  272  5.000000000000001e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.221735  normal  0.365396 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0095  Nitrogenase  46.72 
 
 
299 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2597  nitrogenase iron protein  46.55 
 
 
289 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.036256  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1353  nitrogenase iron protein  44.48 
 
 
292 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000220216  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0795  nitrogenase iron protein  45.45 
 
 
291 aa  263  3e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.835028  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2907  nitrogenase iron protein  46.79 
 
 
289 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0793  nitrogenase  40.22 
 
 
280 aa  203  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00476725  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0237  Nitrogenase  39.55 
 
 
272 aa  202  4e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.848648  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1616  NifH/frxC-family protein  36.09 
 
 
276 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0506  nitrogenase reductase-like protein  36.33 
 
 
290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4043  nitrogenase iron protein  38.24 
 
 
273 aa  198  7.999999999999999e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0162942 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1224  nitrogenase reductase-like protein  37.36 
 
 
278 aa  196  3e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1201  nitrogenase iron protein  37.5 
 
 
273 aa  196  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1158  nitrogenase reductase  38.17 
 
 
274 aa  191  1e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1038  nitrogenase iron protein subunit NifH  37.36 
 
 
264 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2083  nitrogenase  38.75 
 
 
270 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0347  nitrogenase iron protein subunit NifH  37.92 
 
 
265 aa  189  5e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1937  nitrogenase  39.93 
 
 
272 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.894359  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1815  Nitrogenase  40.32 
 
 
251 aa  188  8e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1023  nitrogenase iron protein  37.26 
 
 
275 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1573  nitrogenase iron protein subunit NifH  37.27 
 
 
284 aa  187  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0803  nitrogenase reductase-like protein  35.56 
 
 
292 aa  186  5e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.186385  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1528  nitrogenase reductase-like protein  35.56 
 
 
313 aa  185  9e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1147  nitrogenase reductase-like protein  34.6 
 
 
292 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1152  nitrogenase reductase-like protein  34.51 
 
 
292 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1434  nitrogenase iron protein  36.5 
 
 
283 aa  182  6e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01380  Nitrogenase iron protein  35.46 
 
 
290 aa  182  7e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0685  nitrogenase reductase  37.25 
 
 
274 aa  182  8.000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3030  nitrogenase iron protein  38.04 
 
 
288 aa  182  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0561  nitrogenase iron protein  35.02 
 
 
276 aa  181  9.000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000368653  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0171  nitrogenase reductase  37.13 
 
 
273 aa  181  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.217628  normal  0.670038 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1528  nitrogenase reductase  37.25 
 
 
274 aa  181  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2613  nitrogenase reductase  35.42 
 
 
276 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3855  nitrogenase iron protein  35.46 
 
 
326 aa  181  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430007  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1731  NifH/frxC-family protein  36.81 
 
 
274 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1178  nitrogenase  36.6 
 
 
264 aa  180  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0165  nitrogenase iron protein subunit NifH  37.8 
 
 
268 aa  181  2e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1142  nitrogenase iron protein  35.36 
 
 
276 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.442855  normal  0.809863 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3467  nitrogenase iron protein  37.1 
 
 
288 aa  179  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0744  nitrogenase reductase  36.47 
 
 
274 aa  179  5.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6881  nitrogenase iron protein  36.5 
 
 
289 aa  178  9e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82086  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1627  nitrogenase reductase  36.08 
 
 
274 aa  177  1e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000481616  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2098  nitrogenase iron protein  37 
 
 
292 aa  178  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1751  nitrogenase reductase  36.08 
 
 
274 aa  178  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.555016  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0834  nitrogenase reductase  35.19 
 
 
276 aa  178  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3090  nitrogenase reductase  35.42 
 
 
277 aa  177  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3916  nitrogenase reductase  36.12 
 
 
295 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1244  nitrogenase reductase  36.08 
 
 
274 aa  176  3e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000240583  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02660  vanadium nitrogenase iron protein  37.23 
 
 
290 aa  176  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4488  nitrogenase iron protein subunit NifH  36.12 
 
 
287 aa  176  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1949  nitrogenase reductase  35.69 
 
 
274 aa  175  7e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00645764  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2821  nitrogenase iron protein  35.06 
 
 
272 aa  175  8e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.436411  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4247  nitrogenase iron protein subunit NifH  36.53 
 
 
296 aa  175  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.252394  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1019  nitrogenase reductase  34.72 
 
 
274 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855562  normal  0.490785 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0143  nitrogenase iron protein  34.8 
 
 
280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.343179  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4046  nitrogenase iron protein  35.85 
 
 
275 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.316801  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4054  nitrogenase iron protein subunit NifH  35.36 
 
 
324 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00458685  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1246  nitrogenase reductase  36.76 
 
 
312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.944984  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0650  nitrogenase iron protein  37.69 
 
 
288 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4478  nitrogenase reductase  37.25 
 
 
297 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1202  nitrogenase iron protein subunit NifH  35.11 
 
 
296 aa  172  3.9999999999999995e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.451718  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1041  nitrogenase iron protein subunit NifH  38.17 
 
 
248 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.343788  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0491  nitrogenase iron protein  34.67 
 
 
293 aa  172  7.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1354  nitrogenase iron protein  35.74 
 
 
296 aa  172  7.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0541  nitrogenase reductase  36.4 
 
 
291 aa  171  9e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72124  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2192  nitrogenase reductase  36.4 
 
 
291 aa  171  9e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.866269  normal  0.548044 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0969  nitrogenase reductase  36.13 
 
 
299 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1073  nitrogenase reductase  36.13 
 
 
299 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4930  nitrogenase reductase  36.5 
 
 
295 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2821  nitrogenase iron protein  37.31 
 
 
289 aa  170  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2145  nitrogenase iron protein  37.69 
 
 
289 aa  170  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.936237 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3203  nitrogenase iron protein  38.31 
 
 
288 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4684  nitrogenase reductase  34.43 
 
 
275 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2074  nitrogenase iron protein  37.69 
 
 
289 aa  169  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2120  nitrogenase iron protein  34.69 
 
 
299 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.109902 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2364  nitrogenase iron protein  36.16 
 
 
298 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4463  nitrogenase reductase  35.77 
 
 
300 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49000  nitrogenase reductase  34.69 
 
 
275 aa  169  5e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3771  nitrogenase iron protein  36.47 
 
 
299 aa  169  6e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0377842  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0280  NifH/frxC  39.08 
 
 
728 aa  169  7e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.359044  normal  0.513981 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1049  nitrogenase iron protein  34.56 
 
 
275 aa  168  9e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5101  nitrogenase reductase  35.27 
 
 
298 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3534  nitrogenase reductase  34.93 
 
 
299 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332377  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5052  nitrogenase reductase  35.04 
 
 
295 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2281  nitrogenase reductase  33.33 
 
 
275 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000562599  normal  0.173141 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0274  nitrogenase iron protein  34.33 
 
 
291 aa  165  8e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23577  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0088  nitrogenase reductase  35.21 
 
 
303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.55556  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0143  nitrogenase reductase  35.21 
 
 
293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1570  nitrogenase reductase  35.29 
 
 
298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0229  nitrogenase reductase  35.96 
 
 
293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2610  nitrogenase reductase  33.95 
 
 
275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.343866  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0658  nitrogenase reductase  33.58 
 
 
275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0493156  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0065  nitrogenase reductase  33.58 
 
 
275 aa  163  3e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1240  nitrogenase reductase  34.19 
 
 
296 aa  163  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.118183 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1175  nitrogenase iron protein  36.54 
 
 
289 aa  163  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1522  nitrogenase reductase  34.19 
 
 
296 aa  163  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1395  nitrogenase reductase  32.47 
 
 
275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>