292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4121 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1220  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  85.79 
 
 		 413 aa  701    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.68044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4121  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 		 396 aa  811    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0994  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  58.81 
 
 		 374 aa  381  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4618  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.12 
 
 		 370 aa  239  6.999999999999999e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00401863  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.62 
 
 		 376 aa  235  9e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362697  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2153  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.48 
 
 		 398 aa  233  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.29 
 
 		 397 aa  224  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1613  sortase family protein  42.5 
 
 		 354 aa  135  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2733  VanW family protein  37.44 
 
 		 480 aa  135  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000046928  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  38.84 
 
 		 586 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4015  hypothetical protein  49.64 
 
 		 306 aa  129  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3542  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.33 
 
 		 638 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0100576  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  37.38 
 
 		 803 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0383  hypothetical protein  50.34 
 
 		 656 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.677432  normal  0.0348791 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  39.9 
 
 		 350 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0527  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.44 
 
 		 688 aa  116  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.841411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.02 
 
 		 597 aa  116  8.999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0664  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.19 
 
 		 689 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  40.43 
 
 		 662 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0780  hypothetical protein  48.18 
 
 		 283 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  36.41 
 
 		 801 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1159  hypothetical protein  47.53 
 
 		 665 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1454  hypothetical protein  43.79 
 
 		 459 aa  113  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000963301  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  37.7 
 
 		 597 aa  112  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0340  hypothetical protein  43.56 
 
 		 492 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00130161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.17 
 
 		 257 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  40.88 
 
 		 596 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0525  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.17 
 
 		 155 aa  104  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  35.37 
 
 		 601 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3541  hypothetical protein  31.64 
 
 		 451 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000377942  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  37.05 
 
 		 601 aa  103  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.05 
 
 		 722 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4187  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.45 
 
 		 407 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0004  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.67 
 
 		 171 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10350  hypothetical protein  42.74 
 
 		 507 aa  99.8  7e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.228348  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  38.24 
 
 		 600 aa  99.8  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4116  Allergen V5/Tpx-1 family protein  40.34 
 
 		 455 aa  99  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4950  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  44.17 
 
 		 206 aa  99.4  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1305  hypothetical protein  37.02 
 
 		 374 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.30538  normal  0.428296 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  41.56 
 
 		 347 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4678  hypothetical protein  37.95 
 
 		 338 aa  97.4  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4120  hypothetical protein  36.4 
 
 		 374 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.897659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3540  hypothetical protein  32.24 
 
 		 334 aa  96.7  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000633057  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4294  hypothetical protein  33.69 
 
 		 653 aa  96.7  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134506  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0524  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.5 
 
 		 177 aa  94  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.139747  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1394  hypothetical protein  33.98 
 
 		 415 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2449  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  40 
 
 		 170 aa  92  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1312  hypothetical protein  33.03 
 
 		 345 aa  92.8  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.175874  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4296  hypothetical protein  34.4 
 
 		 642 aa  90.9  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4295  hypothetical protein  34.95 
 
 		 635 aa  90.5  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0028  hypothetical protein  36.41 
 
 		 376 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4281  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.82 
 
 		 628 aa  89.7  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4214  hypothetical protein  36.7 
 
 		 376 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.278975 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2455  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  42.02 
 
 		 171 aa  87.8  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.550997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  37.79 
 
 		 375 aa  87  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0912  hypothetical protein  39.53 
 
 		 574 aa  85.9  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000369378  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0889  hypothetical protein  36.45 
 
 		 421 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465797  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  36.99 
 
 		 384 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1171  hypothetical protein  33.7 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000304249  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1018  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.5 
 
 		 481 aa  82  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.333846  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3329  peptidase M14 carboxypeptidase A  37.5 
 
 		 453 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3736  hypothetical protein  35.98 
 
 		 400 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00729537  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3979  peptidase M14, carboxypeptidase A  37.21 
 
 		 500 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3485  SCP-like extracellular  35.78 
 
 		 457 aa  80.9  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2114  hypothetical protein  38.6 
 
 		 654 aa  79  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.325526 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3744  hypothetical protein  36.22 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0607  hypothetical protein  36.5 
 
 		 531 aa  77.8  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0906909  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0300  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  37.59 
 
 		 605 aa  76.3  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.271211 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4994  hypothetical protein  36.36 
 
 		 804 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.158573  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0975  hypothetical protein  36.08 
 
 		 340 aa  72.8  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000499479  normal  0.0135476 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0894  hypothetical protein  48 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000012433 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2046  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  35 
 
 		 862 aa  67.8  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000297905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0042  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.87 
 
 		 866 aa  63.9  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0819  hypothetical protein  34.96 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0656  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.77 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5983  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.96 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.538368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4524  hypothetical protein  35.54 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0816159 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0825  hypothetical protein  35.77 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2602e-53 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0664  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.36 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0913  hypothetical protein  34.96 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3289  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.57 
 
 		 307 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3408  hypothetical protein  34.48 
 
 		 496 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0116345  normal  0.112401 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2818  hypothetical protein  37.07 
 
 		 536 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0037  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.82 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.82 
 
 		 313 aa  59.3  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000114472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0668  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.15 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.988638  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2244  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.69 
 
 		 476 aa  56.6  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111887  decreased coverage  0.00847254 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03640  Ykud domain-containing protein  34.65 
 
 		 521 aa  56.2  0.0000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000350594  normal  0.0100407 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1163  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.94 
 
 		 301 aa  55.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000106835  normal  0.0179239 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2782  hypothetical protein  34.48 
 
 		 503 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1082  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.14 
 
 		 333 aa  56.2  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000431634  normal  0.0168034 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4300  hypothetical protein  35.9 
 
 		 519 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1510  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.43 
 
 		 307 aa  56.2  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.360333  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21900  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.2 
 
 		 263 aa  54.3  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0855  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.11 
 
 		 541 aa  54.3  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.914763  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1314  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.33 
 
 		 139 aa  54.3  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4076  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.34 
 
 		 292 aa  54.7  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000400018  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1766  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.41 
 
 		 337 aa  53.9  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000276408  unclonable  0.00000169171 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1853  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.43 
 
 		 354 aa  53.9  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000197997  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1747  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.43 
 
 		 354 aa  53.9  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000920948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>